More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10084 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10084  oxidoreductase  100 
 
 
640 aa  1223  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  normal  0.170471 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2985  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  55.63 
 
 
674 aa  533  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0690807  hitchhiker  0.0074409 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4703  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  55.52 
 
 
662 aa  505  1e-142  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4469  NADH dehydrogenase (quinone)  49.58 
 
 
664 aa  437  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2460  NADH dehydrogenase (quinone)  36.75 
 
 
683 aa  351  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  31.44 
 
 
662 aa  334  2e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.55 
 
 
661 aa  319  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1127  hydrogenase membrane subunit  34.93 
 
 
649 aa  318  2e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0224903  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1691  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.22 
 
 
688 aa  318  3e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  1.43823e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0916  hydrogenase 4 subunit B  35.83 
 
 
674 aa  315  2e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1142  hydrogenase 4 subunit B  36.39 
 
 
748 aa  313  5e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.239539  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3292  hydrogenase 4 subunit B  35.62 
 
 
674 aa  311  3e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2474  hydrogenase 4 subunit B  36.41 
 
 
669 aa  310  5e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1261  hydrogenase 4 subunit B  36.6 
 
 
668 aa  310  8e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0734  NAD-dependent dehydrogenase subunit  38.56 
 
 
668 aa  307  4e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0393018  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4671  hydrogenase 4 subunit B  38.12 
 
 
674 aa  306  9e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0929  hydrogenase 4 subunit B  38.21 
 
 
687 aa  305  2e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1321  hydrogenase membrane subunit  33.44 
 
 
644 aa  302  1e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  34.32 
 
 
673 aa  300  5e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0329  hydrogenase 4 subunit B  34.33 
 
 
669 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0892  NADH dehydrogenase (quinone)  34.29 
 
 
669 aa  296  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1453  hydrogenase subunit, HycC-like protein  32.61 
 
 
644 aa  295  2e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1822  hydrogenase membrane subunit  33.28 
 
 
643 aa  295  2e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0165692  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1532  hydrogenase 4 subunit B  36.27 
 
 
668 aa  292  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1617  hydrogenase 4 subunit B  36.27 
 
 
668 aa  292  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6065  hydrogenase 4 subunit B  36.17 
 
 
669 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388772  hitchhiker  0.000500664 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  36.71 
 
 
671 aa  286  1e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1575  hydrogenase membrane subunit  33.92 
 
 
617 aa  285  2e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1069  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.56 
 
 
659 aa  285  2e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70004e-28 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3855  hydrogenase 4 subunit B  37.77 
 
 
672 aa  282  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4288  NADH dehydrogenase (quinone)  33.02 
 
 
637 aa  281  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.77072e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0179  hydrogenase 4 subunit B  35.97 
 
 
669 aa  279  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.987712  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1260  hydrogenase 4 subunit B  38.72 
 
 
672 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0751084 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4066  NADH dehydrogenase (quinone)  33.82 
 
 
669 aa  278  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0619804  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3193  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.54 
 
 
659 aa  278  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.141056  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1065  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.73 
 
 
666 aa  277  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.82932e-25 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1914  L-alanyl-D-glutamate peptidase  32.55 
 
 
655 aa  277  4e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  36.68 
 
 
662 aa  277  5e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3197  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.91 
 
 
666 aa  276  9e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00940  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  35.83 
 
 
672 aa  273  7e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0070  NADH dehydrogenase (quinone)  35.91 
 
 
667 aa  272  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0375  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.45 
 
 
669 aa  270  6e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.044448  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1791  ATP-binding protein  32.04 
 
 
655 aa  268  3e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0608774  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2149  hydrogenase 4 subunit B  38.99 
 
 
660 aa  265  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.33721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1807  hydrogenase 4 subunit B  38.99 
 
 
660 aa  265  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.370569  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0166  hydrogenase 4 subunit B  36.59 
 
 
681 aa  264  4e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970512  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2601  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.58 
 
 
660 aa  264  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1307  NADH dehydrogenase (quinone)  30.03 
 
 
633 aa  262  2e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0739  NAD-dependent dehydrogenase subunit  33.49 
 
 
661 aa  261  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188084  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  30.93 
 
 
672 aa  261  4e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3704  hydrogenase 4 subunit B  31.19 
 
 
672 aa  259  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726938  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02374  NADH dehydrogenase subunit N  31.01 
 
 
672 aa  258  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02336  hypothetical protein  31.01 
 
 
672 aa  258  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1187  NADH dehydrogenase (quinone)  30.97 
 
 
672 aa  257  4e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0188  NADH dehydrogenase (quinone)  34.83 
 
 
737 aa  257  5e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2629  hydrogenase 4 subunit B  30.86 
 
 
672 aa  256  1e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3781  NADH dehydrogenase (quinone)  38.11 
 
 
654 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0217094  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2558  NADH dehydrogenase (quinone)  35.51 
 
 
666 aa  248  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1396  hydrogenase 4 subunit B  36.91 
 
 
671 aa  247  4e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2616  NADH dehydrogenase (quinone)  34.81 
 
 
577 aa  246  6e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1285  hydrogenase 4 subunit B  31.13 
 
 
673 aa  246  1e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.488809  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2708  hydrogenase 4 subunit B  32.27 
 
 
679 aa  246  1e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2560  NADH dehydrogenase (quinone)  36.13 
 
 
663 aa  245  2e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0943  NADH dehydrogenase (quinone)  30.99 
 
 
723 aa  239  9e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.730208  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0778  NADH dehydrogenase (quinone)  35.25 
 
 
682 aa  239  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.590886  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0132  hydrogenase 4 membrane subunit  28.57 
 
 
650 aa  234  3e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.167866  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0336  NADH dehydrogenase (quinone)  31.74 
 
 
665 aa  232  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1862  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.02 
 
 
646 aa  229  9e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  3.07213e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2618  NADH dehydrogenase (quinone)  34.51 
 
 
646 aa  223  6e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.430528  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0315  NADH dehydrogenase (quinone)  31.45 
 
 
674 aa  219  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.39787  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3655  NADH dehydrogenase (quinone)  41 
 
 
654 aa  214  4e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0270969  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3795  NADH dehydrogenase (quinone)  42.22 
 
 
666 aa  213  8e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3276  NADH dehydrogenase (quinone)  30.81 
 
 
671 aa  211  5e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3712  NADH dehydrogenase (quinone)  42.07 
 
 
666 aa  210  7e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.753561  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3796  NADH dehydrogenase (quinone)  39.7 
 
 
654 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273036  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3654  NADH dehydrogenase (quinone)  42.22 
 
 
665 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3713  NADH dehydrogenase (quinone)  42.29 
 
 
654 aa  201  4e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.117424  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2795  NADH dehydrogenase (quinone)  31.54 
 
 
633 aa  178  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2787  NADH dehydrogenase (quinone)  31.54 
 
 
633 aa  178  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3054  formate hydrogenlyase subunit 3  33.51 
 
 
608 aa  175  2e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.920212  normal  0.22505 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0509  NADH dehydrogenase (quinone)  31.53 
 
 
748 aa  174  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000352419  hitchhiker  4.05513e-08 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  30.98 
 
 
500 aa  173  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  2.49004e-12 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3196  formate hydrogenlyase subunit 3  32.15 
 
 
608 aa  167  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0966  NADH dehydrogenase (quinone)  29.87 
 
 
608 aa  167  7e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3974  formate hydrogenlyase subunit 3  29.68 
 
 
608 aa  167  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3780  NADH dehydrogenase (quinone)  42.32 
 
 
670 aa  166  9e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0116247  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2432  NADH dehydrogenase (quinone)  37.08 
 
 
622 aa  166  1e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.96835  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2859  formate hydrogenlyase subunit 3  29.68 
 
 
608 aa  166  2e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3011  formate hydrogenlyase subunit 3  29.68 
 
 
608 aa  165  2e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02573  NADH dehydrogenase subunit N  29.68 
 
 
608 aa  166  2e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.621394  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0989  formate hydrogenlyase subunit 3  29.68 
 
 
608 aa  165  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.180245 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2848  formate hydrogenlyase subunit 3  29.68 
 
 
608 aa  165  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.264273 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1880  NADH dehydrogenase (quinone)  34.56 
 
 
1245 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374238  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1420  NADH dehydrogenase (quinone)  32.67 
 
 
1265 aa  160  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3038  formate hydrogenlyase subunit 3  32.99 
 
 
608 aa  160  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000419635 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2972  formate hydrogenlyase subunit 3  32.38 
 
 
608 aa  160  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3003  formate hydrogenlyase subunit 3  32.99 
 
 
608 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790766 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3161  formate hydrogenlyase subunit 3  32.38 
 
 
608 aa  160  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2620  hydrogenase 4 subunit F  34.08 
 
 
526 aa  158  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3708  hydrogenase 4 subunit F  34.36 
 
 
521 aa  159  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332962  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>