More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10078 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  100 
 
 
201 aa  394  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  51.79 
 
 
211 aa  178  6e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  43.81 
 
 
215 aa  164  1e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  43.81 
 
 
215 aa  164  1e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  43.81 
 
 
215 aa  164  1e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  45.45 
 
 
201 aa  155  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
205 aa  133  1e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  41.14 
 
 
205 aa  121  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  41.36 
 
 
209 aa  118  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  38.74 
 
 
202 aa  116  2e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
222 aa  114  1e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  34.72 
 
 
211 aa  110  1e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
225 aa  110  2e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  35.03 
 
 
196 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2925  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 
198 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
197 aa  105  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 
196 aa  96.3  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
195 aa  96.7  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
196 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 
195 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
201 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
201 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  36.36 
 
 
196 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  33 
 
 
197 aa  91.3  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6079  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 
206 aa  90.5  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.615867 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  35.86 
 
 
192 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 
197 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 
211 aa  89.4  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
197 aa  89.4  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 
201 aa  88.6  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0972  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
194 aa  88.6  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0921311  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 
197 aa  88.6  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2693  regulatory protein TetR  32.63 
 
 
192 aa  88.2  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0770653  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
198 aa  86.3  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 
195 aa  85.9  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 
197 aa  85.1  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  31.07 
 
 
234 aa  82.8  3e-15  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 
201 aa  82.4  4e-15  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 
192 aa  82  6e-15  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 
198 aa  80.9  1e-14  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 
199 aa  80.1  2e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 
199 aa  77  2e-13  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  30.33 
 
 
197 aa  74.7  9e-13  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 
198 aa  73.9  2e-12  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
205 aa  60.5  2e-08  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 
205 aa  60.5  2e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3071  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
210 aa  59.3  4e-08  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
200 aa  58.5  6e-08  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 
200 aa  58.2  8e-08  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0046  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 
209 aa  57.8  1e-07  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  47.76 
 
 
217 aa  56.6  2e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
208 aa  57.4  2e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8486  putative transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 
201 aa  57  2e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  0.72211 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
200 aa  57  2e-07  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  50.72 
 
 
209 aa  57  2e-07  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
215 aa  56.2  3e-07  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
231 aa  55.8  4e-07  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 
239 aa  55.8  4e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
206 aa  55.5  5e-07  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
206 aa  55.1  8e-07  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
206 aa  55.1  8e-07  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
200 aa  54.7  9e-07  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
211 aa  54.7  9e-07  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
222 aa  54.3  1e-06  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4369  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 
206 aa  53.9  1e-06  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.27 
 
 
215 aa  53.5  2e-06  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.27 
 
 
215 aa  53.5  2e-06  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 
215 aa  53.5  2e-06  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  27.27 
 
 
215 aa  53.5  2e-06  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.27 
 
 
215 aa  53.5  2e-06  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
205 aa  53.5  2e-06  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  27.27 
 
 
215 aa  53.5  2e-06  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
242 aa  53.5  2e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4830  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 
226 aa  53.5  2e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.27 
 
 
215 aa  53.5  2e-06  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.91 
 
 
215 aa  53.5  2e-06  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
237 aa  53.5  2e-06  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 
215 aa  53.1  2e-06  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
211 aa  53.5  2e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.27 
 
 
215 aa  53.5  2e-06  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 
223 aa  53.9  2e-06  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
236 aa  52.8  3e-06  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
228 aa  53.1  3e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  27.56 
 
 
219 aa  52.8  3e-06  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
187 aa  52.8  3e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2526  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
252 aa  53.1  3e-06  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0654  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 
185 aa  52.4  4e-06  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0304  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
209 aa  52.8  4e-06  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661097  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
175 aa  52.4  4e-06  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2377  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 
211 aa  52.4  4e-06  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.081674 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
234 aa  52.4  4e-06  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
208 aa  52.4  4e-06  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
234 aa  52.4  4e-06  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 
196 aa  52.8  4e-06  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  22.97 
 
 
203 aa  52.4  4e-06  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0290  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
209 aa  52.8  4e-06  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547414  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
226 aa  52.4  5e-06  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  2.45295e-06 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
200 aa  52.4  5e-06  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
205 aa  52  6e-06  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  46.15 
 
 
198 aa  52  6e-06  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>