186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10072 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  100 
 
 
349 aa  679  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12583  glutamine ABC transporter membrane protein  76.22 
 
 
349 aa  495  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.658592 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  25.94 
 
 
401 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  26.43 
 
 
401 aa  104  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  25.94 
 
 
401 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  25.94 
 
 
401 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  25.94 
 
 
401 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  26.17 
 
 
399 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  26.17 
 
 
399 aa  102  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  25.94 
 
 
401 aa  99.8  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1672  hypothetical protein  24.94 
 
 
397 aa  99  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  26.37 
 
 
401 aa  97.4  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3268  ABC transporter, permease protein, putative  25.14 
 
 
354 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.398205  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  24.59 
 
 
354 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  21.09 
 
 
400 aa  95.1  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  24.86 
 
 
354 aa  94.4  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  24.31 
 
 
354 aa  94  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1917  protein of unknown function DUF214  24.63 
 
 
401 aa  93.6  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  24.59 
 
 
354 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  24.31 
 
 
354 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  24.31 
 
 
354 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2876  ABC-type transport system, putative permease component  24.63 
 
 
401 aa  91.3  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3256  ABC transporter permease  24.03 
 
 
354 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3023  ABC transporter permease  24.03 
 
 
354 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.7303  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3254  putative ABC transporter, permease protein  24.03 
 
 
354 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  23.54 
 
 
399 aa  87  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  24.4 
 
 
377 aa  86.7  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1924  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
399 aa  86.3  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.745521  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  20.21 
 
 
381 aa  83.6  5e-15  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  23.94 
 
 
401 aa  83.2  6e-15  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1185  hypothetical protein  24.38 
 
 
397 aa  82  1e-14  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291724  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  25.82 
 
 
397 aa  80.1  6e-14  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0870  ABC transporter, permease protein  25.31 
 
 
400 aa  79.3  9e-14  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  25.21 
 
 
397 aa  78.6  1e-13  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  24.93 
 
 
349 aa  78.6  1e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  24.93 
 
 
349 aa  78.6  1e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1327  protein of unknown function DUF214  24.26 
 
 
400 aa  78.6  2e-13  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.674334  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1758  peptide ABC transporter permease  22.44 
 
 
350 aa  75.5  1e-12  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  2.6517e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0381  hypothetical protein  25.26 
 
 
381 aa  75.1  2e-12  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3627  protein of unknown function DUF214  27.6 
 
 
355 aa  74.3  3e-12  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00453674  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1242  hypothetical protein  24.66 
 
 
400 aa  73.2  6e-12  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  22.68 
 
 
356 aa  73.2  7e-12  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0348  protein of unknown function DUF214  26.12 
 
 
368 aa  72  1e-11  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1952  ABC transporter, permease protein  20.75 
 
 
350 aa  70.5  4e-11  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3252  hypothetical protein  22.73 
 
 
406 aa  70.1  5e-11  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1280  protein of unknown function DUF214  22.92 
 
 
397 aa  70.1  5e-11  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0216848  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0829  protein of unknown function DUF214  26.18 
 
 
400 aa  70.1  6e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0687  peptide ABC transporter permease  22.74 
 
 
357 aa  68.6  1e-10  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3712  hypothetical protein  26.26 
 
 
400 aa  68.2  2e-10  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.37 
 
 
375 aa  68.6  2e-10  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3776  hypothetical protein  29.19 
 
 
380 aa  67  5e-10  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71489  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1934  hypothetical protein  24.58 
 
 
331 aa  66.6  7e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  27.08 
 
 
400 aa  64.7  2e-09  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1858  hypothetical protein  18.89 
 
 
352 aa  63.9  4e-09  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5886  hypothetical protein  25.14 
 
 
378 aa  63.9  4e-09  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  22.75 
 
 
410 aa  62  2e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  24.45 
 
 
378 aa  61.2  2e-08  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1044  hypothetical protein  23.64 
 
 
400 aa  60.8  3e-08  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1005  ABC transporter, permease protein  19.38 
 
 
349 aa  60.5  4e-08  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3304  hypothetical protein  23.24 
 
 
380 aa  60.1  6e-08  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.578664  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3894  hypothetical protein  24.42 
 
 
402 aa  60.1  6e-08  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5592  protein of unknown function DUF214  25.34 
 
 
378 aa  60.1  6e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00756234  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3382  protein of unknown function DUF214  24.92 
 
 
368 aa  59.7  7e-08  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4558  protein of unknown function DUF214  25.41 
 
 
378 aa  58.2  2e-07  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.987497  normal  0.0915843 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0469  protein of unknown function DUF214  24.38 
 
 
386 aa  58.2  2e-07  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4425  protein of unknown function DUF214  25.41 
 
 
378 aa  58.2  2e-07  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144574  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  23.73 
 
 
376 aa  57.8  3e-07  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  25.21 
 
 
378 aa  57.4  3e-07  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  26.42 
 
 
377 aa  57.4  4e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  21.84 
 
 
381 aa  56.6  6e-07  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0121  permease, putative  21.27 
 
 
362 aa  56.6  6e-07  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1222  hypothetical protein  26.32 
 
 
398 aa  55.8  9e-07  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  23.58 
 
 
412 aa  55.8  1e-06  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2384  hypothetical protein  21.25 
 
 
351 aa  55.5  1e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2430  hypothetical protein  21.25 
 
 
351 aa  55.5  1e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.591526  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0146  ABC transporter, permease protein  24.86 
 
 
378 aa  55.1  2e-06  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0104  protein of unknown function DUF214  22.97 
 
 
378 aa  55.5  2e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.33773  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1034  ABC transporter, permease protein  24.86 
 
 
378 aa  55.1  2e-06  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778603  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0102  ABC transporter, permease protein, putative  22.97 
 
 
378 aa  55.5  2e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0172  efflux ABC transporter, permease protein  24.86 
 
 
378 aa  55.1  2e-06  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.776599  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0811  peptide ABC transporter permease  19.19 
 
 
348 aa  55.1  2e-06  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.461832  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2626  efflux ABC transporter, permease protein  24.86 
 
 
378 aa  55.1  2e-06  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  24.86 
 
 
378 aa  55.1  2e-06  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1293  hypothetical protein  25.14 
 
 
384 aa  55.1  2e-06  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  23.77 
 
 
366 aa  53.1  6e-06  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0167  hypothetical protein  27.88 
 
 
380 aa  53.5  6e-06  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  24.03 
 
 
402 aa  53.1  8e-06  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  23.36 
 
 
380 aa  52.8  9e-06  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  24.31 
 
 
378 aa  52.4  1e-05  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  21.82 
 
 
416 aa  52.4  1e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7011  hypothetical protein  24.86 
 
 
378 aa  51.2  2e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0792174  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  21.17 
 
 
400 aa  51.6  2e-05  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  7.60178e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  22.42 
 
 
397 aa  52  2e-05  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2114  hypothetical protein  31.2 
 
 
380 aa  50.8  3e-05  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  2.13217e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0734  peptide ABC transporter permease  18.7 
 
 
353 aa  50.1  6e-05  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  22.7 
 
 
376 aa  49.7  7e-05  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2993  protein of unknown function DUF214  24.93 
 
 
375 aa  49.7  8e-05  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3777  hypothetical protein  25.53 
 
 
383 aa  49.7  8e-05  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1218  DevC protein  20.89 
 
 
389 aa  49.7  8e-05  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.188524  normal  0.730906 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  24.34 
 
 
850 aa  49.3  9e-05  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>