More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10070 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0767  serine hydroxymethyltransferase  74.29 
 
 
445 aa  640  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10070  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 
425 aa  865  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.9411  normal  0.116151 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0535  Glycine hydroxymethyltransferase  73.57 
 
 
434 aa  626  1e-178  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0657  Glycine hydroxymethyltransferase  75 
 
 
452 aa  616  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2884  Glycine hydroxymethyltransferase  73.46 
 
 
442 aa  610  1e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2501  Glycine hydroxymethyltransferase  70.45 
 
 
427 aa  599  1e-170  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1189  serine hydroxymethyltransferase  70.5 
 
 
432 aa  593  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.5975e-08 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1115  serine hydroxymethyltransferase  70.26 
 
 
435 aa  589  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234213  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3847  Glycine hydroxymethyltransferase  71.36 
 
 
420 aa  589  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0424  Glycine hydroxymethyltransferase  71.97 
 
 
422 aa  590  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3186  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3596  Glycine hydroxymethyltransferase  71.66 
 
 
447 aa  585  1e-166  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2353  serine hydroxymethyltransferase  71.02 
 
 
423 aa  584  1e-165  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0383526  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13350  serine hydroxymethyltransferase  70.71 
 
 
423 aa  581  1e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0694  serine hydroxymethyltransferase  68.32 
 
 
429 aa  581  1e-165  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1663  Glycine hydroxymethyltransferase  68.33 
 
 
435 aa  582  1e-165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27940  serine hydroxymethyltransferase  68.56 
 
 
430 aa  583  1e-165  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.958283  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3705  serine hydroxymethyltransferase  67.82 
 
 
453 aa  573  1e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18800  serine hydroxymethyltransferase  70.87 
 
 
412 aa  569  1e-161  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3130  Glycine hydroxymethyltransferase  69.47 
 
 
432 aa  563  1e-159  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11114  serine hydroxymethyltransferase  68.51 
 
 
426 aa  559  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.66035e-14  normal  0.472146 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0754  Glycine hydroxymethyltransferase  68.02 
 
 
428 aa  560  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128225  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5659  Glycine hydroxymethyltransferase  72.32 
 
 
421 aa  556  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04680  serine hydroxymethyltransferase  66.99 
 
 
426 aa  556  1e-157  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21370  serine hydroxymethyltransferase  67.22 
 
 
422 aa  551  1e-156  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.100651  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4629  Glycine hydroxymethyltransferase  66.35 
 
 
430 aa  550  1e-155  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.162942 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2989  Glycine hydroxymethyltransferase  68.25 
 
 
440 aa  549  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3981  Glycine hydroxymethyltransferase  70.94 
 
 
434 aa  550  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.638114 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0469  serine hydroxymethyltransferase  62.11 
 
 
474 aa  510  1e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996315  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  61.45 
 
 
432 aa  489  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  58.8 
 
 
417 aa  490  1e-137  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  57.45 
 
 
418 aa  488  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  55.96 
 
 
411 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  56.69 
 
 
411 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  58.39 
 
 
415 aa  483  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  58.95 
 
 
431 aa  483  1e-135  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  56.97 
 
 
438 aa  478  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  2.80655e-05  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  57.48 
 
 
417 aa  479  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  57.62 
 
 
424 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  55 
 
 
423 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  58.27 
 
 
429 aa  475  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  57.24 
 
 
417 aa  478  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  56.09 
 
 
412 aa  476  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  56.16 
 
 
417 aa  475  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.0982e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6283  glycine hydroxymethyltransferase  57.78 
 
 
419 aa  472  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1851  serine hydroxymethyltransferase  58.07 
 
 
417 aa  471  1e-132  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  57.14 
 
 
415 aa  471  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  54.76 
 
 
423 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  55.24 
 
 
423 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  57.48 
 
 
417 aa  473  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  56.66 
 
 
415 aa  471  1e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  57.35 
 
 
417 aa  470  1e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  57.87 
 
 
417 aa  470  1e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  57.59 
 
 
433 aa  471  1e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  54.76 
 
 
416 aa  471  1e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  56.1 
 
 
431 aa  469  1e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  56.53 
 
 
416 aa  471  1e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  57.59 
 
 
417 aa  471  1e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  56.9 
 
 
415 aa  471  1e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2165  serine hydroxymethyltransferase  56.43 
 
 
414 aa  468  1e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.675395  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  54.29 
 
 
423 aa  469  1e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  56.1 
 
 
431 aa  469  1e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  57.62 
 
 
433 aa  471  1e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1035  serine hydroxymethyltransferase  54.18 
 
 
425 aa  469  1e-131  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  56.9 
 
 
415 aa  470  1e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  56.94 
 
 
427 aa  470  1e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2113  serine hydroxymethyltransferase  56.44 
 
 
424 aa  467  1e-130  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  55.87 
 
 
431 aa  468  1e-130  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  56.42 
 
 
415 aa  467  1e-130  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  56.42 
 
 
413 aa  467  1e-130  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4132  serine hydroxymethyltransferase  57.04 
 
 
417 aa  465  1e-130  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  5.88766e-06  normal  0.517769 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  55.19 
 
 
439 aa  465  1e-130  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  56.04 
 
 
418 aa  465  1e-130  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1537  serine hydroxymethyltransferase  56.87 
 
 
435 aa  466  1e-130  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0106  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  57.38 
 
 
433 aa  466  1e-130  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0417  serine hydroxymethyltransferase  54.95 
 
 
420 aa  465  1e-130  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  57.14 
 
 
417 aa  465  1e-130  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  56.9 
 
 
417 aa  464  1e-130  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  55.42 
 
 
412 aa  465  1e-130  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2305  serine hydroxymethyltransferase  58.55 
 
 
434 aa  466  1e-130  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8588  serine hydroxymethyltransferase  57.48 
 
 
420 aa  465  1e-130  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  57.14 
 
 
417 aa  467  1e-130  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  55.72 
 
 
413 aa  468  1e-130  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3004  serine hydroxymethyltransferase  57.86 
 
 
432 aa  465  1e-130  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21133  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 
440 aa  467  1e-130  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  56.77 
 
 
417 aa  461  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0004  serine hydroxymethyltransferase  55.71 
 
 
416 aa  463  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4877  serine hydroxymethyltransferase  56.77 
 
 
417 aa  464  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.402887  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  54.83 
 
 
412 aa  464  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4632  serine hydroxymethyltransferase  56.29 
 
 
417 aa  461  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  56.25 
 
 
417 aa  461  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  52.12 
 
 
423 aa  462  1e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1912  serine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 
430 aa  464  1e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  55.19 
 
 
438 aa  464  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1344  serine hydroxymethyltransferase  57.14 
 
 
417 aa  460  1e-128  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538197  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2110  serine hydroxymethyltransferase  56.32 
 
 
434 aa  460  1e-128  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2044  serine hydroxymethyltransferase  56.72 
 
 
414 aa  461  1e-128  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110649  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  56.87 
 
 
419 aa  459  1e-128  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  5.84892e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  56.09 
 
 
434 aa  460  1e-128  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0629  serine hydroxymethyltransferase  53.77 
 
 
432 aa  461  1e-128  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  52.37 
 
 
427 aa  459  1e-128  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>