More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10068 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  100 
 
 
303 aa  610  1e-174  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  73.18 
 
 
311 aa  440  1e-122  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  72.43 
 
 
300 aa  441  1e-122  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  70.86 
 
 
300 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  70.86 
 
 
300 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  70.86 
 
 
300 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  70.2 
 
 
304 aa  414  1e-115  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  68.87 
 
 
303 aa  414  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  70.3 
 
 
302 aa  403  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.33 
 
 
298 aa  399  1e-110  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  65.35 
 
 
305 aa  396  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  71.1 
 
 
299 aa  391  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  67.97 
 
 
306 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  67.97 
 
 
306 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  68.32 
 
 
306 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  67.77 
 
 
305 aa  381  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.73 
 
 
307 aa  382  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.12 
 
 
304 aa  363  2e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.36 
 
 
312 aa  327  2e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.38 
 
 
298 aa  296  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.63 
 
 
312 aa  293  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  51.33 
 
 
316 aa  285  5e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.49 
 
 
326 aa  278  1e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.49 
 
 
317 aa  266  3e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.96 
 
 
305 aa  264  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.63 
 
 
298 aa  264  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.61 
 
 
301 aa  264  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.61 
 
 
298 aa  259  5e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  2.18148e-06 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.56 
 
 
324 aa  258  7e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.98 
 
 
307 aa  258  8e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.1 
 
 
297 aa  255  5e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.5 
 
 
290 aa  253  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  50.33 
 
 
306 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  48.74 
 
 
317 aa  247  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.84 
 
 
310 aa  246  5e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.23 
 
 
304 aa  246  5e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0665  short chain dehydrogenase  51.96 
 
 
301 aa  245  7e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000125417  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.28 
 
 
315 aa  243  2e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.93 
 
 
328 aa  242  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.57 
 
 
319 aa  242  7e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.93 
 
 
329 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 
312 aa  241  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  45.93 
 
 
329 aa  240  3e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  45.93 
 
 
333 aa  240  3e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3626  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.48 
 
 
306 aa  239  6e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.72 
 
 
320 aa  238  8e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.84 
 
 
312 aa  238  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.67 
 
 
303 aa  237  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  45.97 
 
 
302 aa  236  4e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.48 
 
 
306 aa  233  2e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.0957503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.56 
 
 
309 aa  232  5e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.3 
 
 
306 aa  232  6e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.61 
 
 
298 aa  229  6e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.468031  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
303 aa  228  7e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  43.42 
 
 
300 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.04 
 
 
327 aa  226  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.52 
 
 
309 aa  225  7e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37207  hitchhiker  0.00818757 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  46.86 
 
 
308 aa  223  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.14 
 
 
324 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.010862 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.43 
 
 
328 aa  222  5e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.31 
 
 
328 aa  221  8e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  39.8 
 
 
311 aa  221  8e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.4 
 
 
288 aa  221  9e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  37.84 
 
 
309 aa  221  1e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  37.25 
 
 
309 aa  220  2e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.19 
 
 
328 aa  219  4e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.75 
 
 
288 aa  219  4e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.19 
 
 
328 aa  219  4e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.99 
 
 
306 aa  219  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.58 
 
 
314 aa  217  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.52 
 
 
314 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0106464 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66520  putative short chain dehydrogenase  47.25 
 
 
309 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.973643  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5768  putative short chain dehydrogenase  46.6 
 
 
309 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4174  short chain dehydrogenase  45.07 
 
 
312 aa  214  2e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.865375  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  36.45 
 
 
309 aa  213  3e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0618  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.81 
 
 
328 aa  213  4e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.77353  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  41.14 
 
 
301 aa  212  7e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7668  putative short chain dehydrogenase  47.37 
 
 
318 aa  211  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685626  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  36.79 
 
 
309 aa  211  9e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.78 
 
 
289 aa  211  9e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.78 
 
 
289 aa  211  9e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.78 
 
 
289 aa  211  9e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.86 
 
 
305 aa  209  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1947  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.56 
 
 
308 aa  207  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.156536  normal  0.0102569 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.1 
 
 
305 aa  204  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  hitchhiker  0.00451656 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.74 
 
 
328 aa  205  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.392114 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1061  short chain dehydrogenase  44.55 
 
 
320 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  37.04 
 
 
300 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.98 
 
 
315 aa  203  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.41 
 
 
312 aa  203  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711865  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.1 
 
 
316 aa  202  5e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  36.7 
 
 
308 aa  201  1e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00455  probable oxidoreductase  37.66 
 
 
318 aa  194  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.36 
 
 
313 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.46 
 
 
271 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196171  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.93 
 
 
316 aa  192  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.22 
 
 
314 aa  189  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244541  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 
320 aa  189  7e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.756699  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.1 
 
 
284 aa  189  7e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.48 
 
 
306 aa  186  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>