128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10066 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_1821  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  60.87 
 
 
767 aa  935  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.111465 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0771  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  60.03 
 
 
741 aa  926  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318617  hitchhiker  5.06151e-07 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3617  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  60.6 
 
 
741 aa  910  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.162405  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3416  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  60.46 
 
 
741 aa  934  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2702  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  60.62 
 
 
740 aa  943  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.191551  normal  0.0232345 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2548  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  60.43 
 
 
742 aa  930  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00891697  hitchhiker  3.08445e-08 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2249  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  60.14 
 
 
743 aa  929  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.267042  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4382  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  77.42 
 
 
745 aa  1212  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000594787 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0369  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  74.33 
 
 
744 aa  1177  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2442  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  60.03 
 
 
742 aa  917  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  unclonable  6.48853e-11 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3132  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  61.22 
 
 
741 aa  922  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2159  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  59.73 
 
 
743 aa  922  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.171562  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5456  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  80.13 
 
 
747 aa  1264  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.897377  normal  0.0127926 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4080  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  60.16 
 
 
742 aa  941  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3645  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  76.58 
 
 
744 aa  1206  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000734043  normal  0.208006 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2588  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  60.92 
 
 
741 aa  952  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.540941  normal  0.0688936 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1986  monomeric isocitrate dehydrogenase  51.36 
 
 
722 aa  729  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.305088 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2086  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  74.59 
 
 
739 aa  1162  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2087  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  61.52 
 
 
740 aa  929  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10066  isocitrate dehydrogenase [NADP] icd2  100 
 
 
745 aa  1547  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.655644 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3267  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  62.97 
 
 
740 aa  971  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000676188 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2583  NADP-dependent isocitrate dehydrogenase  67.66 
 
 
741 aa  1052  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202906  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2468  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  61.19 
 
 
741 aa  953  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00290005  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1588  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  58.95 
 
 
744 aa  941  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0301338 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1399  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  50.82 
 
 
767 aa  759  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1135  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  50.41 
 
 
732 aa  746  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01563  socitrate dehydrogenase  59.46 
 
 
741 aa  927  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1883  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  60.43 
 
 
741 aa  947  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.615158  decreased coverage  3.95954e-08 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2535  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  61.11 
 
 
740 aa  953  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4274  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  59.21 
 
 
739 aa  884  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876075  normal  0.344018 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03994  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  58.86 
 
 
743 aa  912  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0694  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  52.89 
 
 
746 aa  821  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00369778  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0553  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  58.97 
 
 
741 aa  926  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04530  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent, monomeric type  59.13 
 
 
740 aa  890  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1324  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  59.49 
 
 
743 aa  942  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.74496e-15 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0734  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  57.57 
 
 
739 aa  880  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.373091  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0970  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  60.44 
 
 
735 aa  917  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19690  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent, monomeric type  57.63 
 
 
741 aa  875  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.864734  hitchhiker  0.00582457 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22050  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent, monomeric type  56.49 
 
 
746 aa  840  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0415129  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1645  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  59.78 
 
 
741 aa  905  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2518  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  82.12 
 
 
745 aa  1306  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.136367  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003959  isocitrate dehydrogenase [NADP]  60.81 
 
 
741 aa  954  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1089  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  61.04 
 
 
745 aa  953  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.911582  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37720  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent, monomeric type  56.89 
 
 
736 aa  838  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0949235  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3100  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  60.49 
 
 
739 aa  881  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2261  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  79.97 
 
 
745 aa  1250  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.252238  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28310  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent, Icd  61.5 
 
 
741 aa  971  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1559  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  75.64 
 
 
744 aa  1196  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0530122  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1721  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  59.76 
 
 
743 aa  935  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1624  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  60.43 
 
 
742 aa  948  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00119638  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0799  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  59.92 
 
 
739 aa  941  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1677  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  58.34 
 
 
739 aa  903  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2213  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  59.51 
 
 
741 aa  941  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0128694  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3684  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  60.43 
 
 
740 aa  926  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0513174  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02366  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  66.67 
 
 
739 aa  1025  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104903  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1648  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  59.49 
 
 
743 aa  934  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2901  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  59.35 
 
 
743 aa  940  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  2.48362e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2205  isocitrate dehydrogenase [NADP]  60.81 
 
 
742 aa  966  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0171  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  75.94 
 
 
746 aa  1214  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1876  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  60.92 
 
 
741 aa  949  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.436386  hitchhiker  2.29787e-05 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45017  predicted protein  54.55 
 
 
811 aa  827  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0053865  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1170  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  58.83 
 
 
739 aa  900  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7645e-10 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06770  isocitrate dehydrogenase (NADP)  60.11 
 
 
738 aa  929  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.665726  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2194  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  59.76 
 
 
743 aa  948  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  6.47255e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1465  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  60.05 
 
 
740 aa  937  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00781151  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1047  isocitrate dehydrogenase (NADP+)  52.99 
 
 
729 aa  806  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0617391  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2227  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  59.76 
 
 
743 aa  939  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.124629  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2203  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  59.02 
 
 
739 aa  881  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.199816  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2371  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  51.5 
 
 
731 aa  750  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0872233  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1684  isocitrate dehydrogenase (NADP+)  60.7 
 
 
742 aa  950  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  2.5647e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0532  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent, monomeric type  61.43 
 
 
742 aa  949  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1831  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  59.92 
 
 
740 aa  941  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.774798  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0525  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  61.65 
 
 
744 aa  964  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0755459  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0315  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  72.42 
 
 
739 aa  1121  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.789094  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3729  isocitrate dehydrogenase  80.32 
 
 
747 aa  1266  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0477  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  55.03 
 
 
738 aa  798  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1912  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  60.3 
 
 
742 aa  928  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1209  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  82.46 
 
 
750 aa  1278  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.766417  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2377  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  66.8 
 
 
743 aa  1033  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00123907  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1101  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  60.6 
 
 
739 aa  934  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1359  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent, monomeric type  58.7 
 
 
740 aa  911  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.34164e-09  hitchhiker  8.07469e-18 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4012  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  61.01 
 
 
741 aa  936  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.225038 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1354  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  69.78 
 
 
741 aa  1085  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.945441  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2897  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  60.3 
 
 
743 aa  966  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0583435  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0635  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  50.95 
 
 
734 aa  764  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.707304  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2629  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  60.78 
 
 
741 aa  951  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3356  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  59.89 
 
 
743 aa  917  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0469656  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3186  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent, monomeric type  60.33 
 
 
740 aa  935  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.467142  normal  0.225365 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0287  isocitrate dehydrogenase  71.74 
 
 
739 aa  1114  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3120  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent, monomeric type  74.87 
 
 
745 aa  1191  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4201  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent, monomeric type  79.65 
 
 
747 aa  1262  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3594  isocitrate dehydrogenase (NADP+)  61.55 
 
 
741 aa  946  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.942271 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5855  isocitrate dehydrogenase (NADP+)  59.76 
 
 
742 aa  921  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0781482  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0459  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent, monomeric type  59.24 
 
 
741 aa  932  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1410  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent, monomeric type  58.97 
 
 
741 aa  935  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1641  isocitrate dehydrogenase  57.34 
 
 
737 aa  887  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1606  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  61.05 
 
 
741 aa  959  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.601658  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0090  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  67.03 
 
 
747 aa  1051  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0350175  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3680  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  76.64 
 
 
745 aa  1212  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465452  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2300  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  74.83 
 
 
744 aa  1186  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.288016  hitchhiker  0.00925586 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>