18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10065 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10065  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  265  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.814424 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3484  PilT protein domain protein  47.69 
 
 
130 aa  90.1  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3700  PilT protein domain protein  43.75 
 
 
130 aa  87.4  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2113  PilT protein-like  46.46 
 
 
100 aa  83.6  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1502  PilT protein-like  37.3 
 
 
133 aa  78.6  3e-14  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11735  hypothetical protein  39.06 
 
 
129 aa  68.2  3e-11  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5200  PilT domain-containing protein  42.19 
 
 
155 aa  68.6  3e-11  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10978  hypothetical protein  38.32 
 
 
127 aa  68.2  4e-11  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00025146  normal  0.536997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3094  PilT protein domain protein  38.17 
 
 
137 aa  61.6  3e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.492966 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3163  PilT protein domain protein  38.17 
 
 
138 aa  57  9e-08  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3666  PilT domain-containing protein  38.68 
 
 
131 aa  54.7  4e-07  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0676  PilT protein domain protein  35.71 
 
 
146 aa  53.5  8e-07  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2191  PilT domain-containing protein  35.48 
 
 
141 aa  53.5  9e-07  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10560  hypothetical protein  36.36 
 
 
137 aa  52.4  2e-06  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.020185 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1214  PilT domain-containing protein  34.59 
 
 
135 aa  49.7  1e-05  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0050  hypothetical protein  35.82 
 
 
140 aa  48.1  4e-05  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4637  PilT domain-containing protein  34.78 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1951  hypothetical protein  36.78 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>