71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10063 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10063  transmembrane protein  100 
 
 
346 aa  676  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.477127  normal  0.782331 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1433  hypothetical protein  57.6 
 
 
1003 aa  325  5e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207138  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1415  hypothetical protein  57.6 
 
 
1003 aa  325  5e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4654  hypothetical protein  58.36 
 
 
1004 aa  324  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344019  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1469  hypothetical protein  56.89 
 
 
1001 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.340756  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1814  hypothetical protein  57.65 
 
 
1002 aa  303  2e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.693843  normal  0.0180395 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13213  hypothetical protein  55.83 
 
 
992 aa  294  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3487  protein of unknown function UPF0182  53.98 
 
 
994 aa  293  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.879068  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1599  protein of unknown function UPF0182  49.65 
 
 
982 aa  269  4e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.217724  normal  0.364231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0941  hypothetical protein  51.9 
 
 
1001 aa  265  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07660  hypothetical protein  50 
 
 
988 aa  251  9e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.580652  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3037  protein of unknown function UPF0182  47.14 
 
 
985 aa  222  7e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4222  protein of unknown function UPF0182  45.82 
 
 
985 aa  199  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3729  hypothetical protein  40.26 
 
 
994 aa  190  3e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4110  hypothetical protein  39.93 
 
 
993 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3795  protein of unknown function UPF0182  40.49 
 
 
1007 aa  188  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.214749  normal  0.0401617 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3730  protein of unknown function UPF0182  40.15 
 
 
968 aa  184  2e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.155339  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0541  hypothetical protein  37.1 
 
 
1018 aa  183  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4377  hypothetical protein  37.63 
 
 
992 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1530  hypothetical protein  36 
 
 
1004 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0725  protein of unknown function UPF0182  34.83 
 
 
1018 aa  160  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0945  hypothetical protein  38.31 
 
 
1035 aa  156  5e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203937  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8343  hypothetical protein  39.52 
 
 
983 aa  156  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.715387 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27470  hypothetical protein  35.92 
 
 
1012 aa  155  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2885  protein of unknown function UPF0182  37.9 
 
 
980 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00214299 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0793  protein of unknown function UPF0182  39.92 
 
 
1007 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2952  hypothetical protein  39.13 
 
 
972 aa  149  6e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0447926  normal  0.518899 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2471  protein of unknown function UPF0182  35.96 
 
 
985 aa  141  1e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.677e-10 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3781  hypothetical protein  37.63 
 
 
1018 aa  137  3e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.568022  normal  0.0630741 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2749  hypothetical protein  34.13 
 
 
1006 aa  136  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.179531  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19540  hypothetical protein  32.14 
 
 
1029 aa  135  1e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.139911  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7927  protein of unknown function UPF0182  35.77 
 
 
962 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2461  protein of unknown function UPF0182  37.55 
 
 
1000 aa  121  2e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.947136  hitchhiker  8.99121e-06 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1871  protein of unknown function UPF0182  29.89 
 
 
949 aa  119  9e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.204028  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1193  protein of unknown function UPF0182  38.1 
 
 
1019 aa  119  1e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111199  normal  0.0369409 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19060  hypothetical protein  30.13 
 
 
1045 aa  116  7e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.569882  normal  0.89532 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14990  hypothetical protein  33.61 
 
 
1047 aa  114  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.589114  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2146  protein of unknown function UPF0182  30.58 
 
 
912 aa  109  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758786 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0780  Na+-driven multidrug efflux pump  29.5 
 
 
1079 aa  108  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1797  hypothetical protein  29.11 
 
 
932 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0653  hypothetical protein  29.71 
 
 
1016 aa  92  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.523938 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3465  protein of unknown function UPF0182  30.9 
 
 
896 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1115  hypothetical protein  34.39 
 
 
930 aa  89.7  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10710  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  27.69 
 
 
917 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1139  hypothetical protein  28.85 
 
 
909 aa  87.8  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.827602  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1161  hypothetical protein  28.2 
 
 
914 aa  86.3  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.100714  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2689  hypothetical protein  28.51 
 
 
890 aa  84  3e-15  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.958793  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4385  hypothetical protein  27.88 
 
 
919 aa  82.8  8e-15  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.182735 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0902  hypothetical protein  30.38 
 
 
892 aa  81.6  2e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193446  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2333  hypothetical protein  28.1 
 
 
894 aa  80.1  5e-14  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.280552  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3567  hypothetical protein  26.91 
 
 
900 aa  79.7  7e-14  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00412787  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1951  hypothetical protein  34.84 
 
 
988 aa  79.3  9e-14  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4195  hypothetical protein  31.61 
 
 
1004 aa  79.3  9e-14  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4155  hypothetical protein  31.61 
 
 
1004 aa  79.3  9e-14  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0814  protein of unknown function UPF0182  27.93 
 
 
891 aa  78.6  1e-13  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.297672  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2279  protein of unknown function UPF0182  27.2 
 
 
896 aa  79  1e-13  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.42741e-05 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2722  hypothetical protein  37.66 
 
 
991 aa  79  1e-13  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177747  hitchhiker  0.000114433 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2777  protein of unknown function UPF0182  27.42 
 
 
960 aa  76.3  7e-13  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.740282  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0938  hypothetical protein  34.29 
 
 
1019 aa  75.9  1e-12  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391922  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0908  protein of unknown function UPF0182  26.04 
 
 
945 aa  74.3  3e-12  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.747504  hitchhiker  0.000109139 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1303  hypothetical protein  28.02 
 
 
899 aa  70.9  3e-11  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.939701  normal  0.0211961 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3693  hypothetical protein  35.67 
 
 
996 aa  71.2  3e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5177  hypothetical protein  34.76 
 
 
1009 aa  69.7  7e-11  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197253 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0698  protein of unknown function UPF0182  30 
 
 
945 aa  68.2  2e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00837363  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0011  hypothetical protein  25.56 
 
 
918 aa  63.9  4e-09  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0011  hypothetical protein  25.19 
 
 
918 aa  63.5  6e-09  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0693  protein of unknown function UPF0182  25.29 
 
 
909 aa  50.8  3e-05  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0961  hypothetical protein  23.93 
 
 
872 aa  50.4  4e-05  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0949388  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2137  hypothetical protein  27.56 
 
 
874 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0489156 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2716  hypothetical protein  30.06 
 
 
992 aa  47.4  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.107653  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1783  hypothetical protein  25.79 
 
 
955 aa  43.1  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.890136  normal  0.25047 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>