61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10061 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10061  cellulase celA1  100 
 
 
380 aa  763  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0549134  normal  0.652249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5837  cellulase  60 
 
 
341 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5680  cellulase  61.9 
 
 
329 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5390  cellulase  61.9 
 
 
329 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.217743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5301  cellulase  61.9 
 
 
329 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.104046  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1003  cellulase  60.74 
 
 
330 aa  360  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3907  endoglucanase  44.86 
 
 
323 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0234  1, 4-beta cellobiohydrolase  47.22 
 
 
422 aa  238  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1657  glycoside hydrolase family protein  49.48 
 
 
495 aa  223  5e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0958307  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  47.37 
 
 
469 aa  215  9e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  45.96 
 
 
491 aa  215  1e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  45.26 
 
 
459 aa  215  1e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7197  cellulase  43.49 
 
 
393 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3501  cellulase  44.92 
 
 
346 aa  204  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  43.54 
 
 
446 aa  203  4e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4622  cellulase  43.39 
 
 
870 aa  199  5e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  45.02 
 
 
448 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  42.32 
 
 
441 aa  192  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01440  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  38.6 
 
 
439 aa  189  6e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13180  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  39.25 
 
 
359 aa  182  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0603055  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  41.36 
 
 
437 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6330  Cellulase  42.21 
 
 
326 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.708114  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  44.11 
 
 
487 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  42.66 
 
 
456 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3215  glycoside hydrolase family 6  42.36 
 
 
438 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1738  glycoside hydrolase family 6  34.05 
 
 
419 aa  170  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304195  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2166  Cellulase  41.89 
 
 
465 aa  169  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2132  Cellulase  37.66 
 
 
394 aa  169  8e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0518  Cellulase  36.18 
 
 
371 aa  168  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2131  Cellulase  37.29 
 
 
350 aa  161  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4617  cellulase  39.51 
 
 
341 aa  158  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0135  cellulase  34.36 
 
 
469 aa  155  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3078  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.29 
 
 
469 aa  137  3e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3077  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  33.88 
 
 
487 aa  135  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1070  Cellulase  40.71 
 
 
361 aa  133  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00218389  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3602  glycoside hydrolase family 6  42.86 
 
 
434 aa  112  7e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0359346  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0236  glycoside hydrolase family 6  36.42 
 
 
501 aa  110  4e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01273  cellobiohydrolase (nonreducing end) (Eurofung)  29.01 
 
 
393 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.951317 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  28.71 
 
 
1209 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05282  Beta-1,4-glucan-cellobiohydrolyase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS7]  29.21 
 
 
450 aa  98.6  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  28.1 
 
 
655 aa  87  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  29.23 
 
 
646 aa  84.3  3e-15  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_003296  RS03897  exoglucanase A  26.78 
 
 
572 aa  79.3  9e-14  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.216755  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  27.15 
 
 
611 aa  79  1e-13  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1251  fibronectin, type III domain-containing protein  26.76 
 
 
497 aa  78.2  2e-13  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0553  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.86 
 
 
639 aa  76.3  8e-13  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  25.13 
 
 
1128 aa  76.3  8e-13  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  27.2 
 
 
605 aa  75.9  1e-12  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  27.9 
 
 
767 aa  75.1  2e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  25.74 
 
 
623 aa  74.7  2e-12  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0598  cellulase  23.78 
 
 
628 aa  73.6  5e-12  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.120048  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04176  exoglucanase A  26.18 
 
 
548 aa  72.4  1e-11  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  27.42 
 
 
590 aa  71.2  3e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  27.42 
 
 
588 aa  70.9  3e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2947  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.74 
 
 
452 aa  69.7  9e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  4.58427e-05  hitchhiker  0.00017321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.76 
 
 
633 aa  67.8  3e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2272  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)-like  26.89 
 
 
791 aa  65.1  2e-09  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  25.27 
 
 
596 aa  64.3  4e-09  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  26.13 
 
 
589 aa  59.7  7e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  25.94 
 
 
620 aa  58.5  2e-07  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  25.62 
 
 
743 aa  52  2e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>