More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10055 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10055  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 152 aa  300  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.95125e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5367  50S ribosomal protein L9  76.97 
 
 		 152 aa  235  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5743  50S ribosomal protein L9  76.97 
 
 		 152 aa  235  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5456  50S ribosomal protein L9  76.97 
 
 		 152 aa  235  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166119  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6031  50S ribosomal protein L9  74 
 
 		 151 aa  224  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.827335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0877  50S ribosomal protein L9  72.67 
 
 		 151 aa  222  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  66.67 
 
 		 150 aa  195  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  67.55 
 
 		 150 aa  194  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  62.16 
 
 		 151 aa  182  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  55.33 
 
 		 152 aa  171  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  54.97 
 
 		 148 aa  160  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  53.02 
 
 		 148 aa  159  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  53.02 
 
 		 148 aa  158  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  52.32 
 
 		 151 aa  156  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  52.67 
 
 		 148 aa  153  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  52.32 
 
 		 148 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  53.69 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  52.32 
 
 		 148 aa  149  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  51.97 
 
 		 149 aa  147  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  52.35 
 
 		 151 aa  147  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  50 
 
 		 148 aa  146  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  53.64 
 
 		 148 aa  144  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  48.67 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  50.34 
 
 		 151 aa  136  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  48.32 
 
 		 148 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  47.65 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  44.3 
 
 		 149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  46.98 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  48.32 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  46.31 
 
 		 153 aa  121  4e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  47.33 
 
 		 148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  44 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  43.05 
 
 		 151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  40.94 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  42.38 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  45.03 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  44.67 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  41.18 
 
 		 150 aa  107  8.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0311  ribosomal protein L9  42 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0979697 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  41.72 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  42 
 
 		 189 aa  101  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  42.38 
 
 		 149 aa  100  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0760  50S ribosomal protein L9  44.08 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.242158  hitchhiker  0.000000266441 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2559  50S ribosomal protein L9  41.06 
 
 		 152 aa  97.8  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  42 
 
 		 189 aa  97.8  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  40.4 
 
 		 150 aa  97.8  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  41.61 
 
 		 189 aa  97.8  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  39.33 
 
 		 147 aa  97.4  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0222  ribosomal protein L9  37.91 
 
 		 151 aa  97.4  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  40.79 
 
 		 149 aa  97.1  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000928974  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0287  ribosomal protein L9  38.56 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0120134  normal  0.0123082 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3281  50S ribosomal protein L9  42.11 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.134585  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0738  50S ribosomal protein L9  38.41 
 
 		 191 aa  95.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823068  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_002950  PG0597  50S ribosomal protein L9  38.82 
 
 		 179 aa  94.7  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002335  LSU ribosomal protein L9p  39.74 
 
 		 150 aa  94.4  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.178305  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  35.95 
 
 		 149 aa  94  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  35.53 
 
 		 148 aa  94  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  42 
 
 		 168 aa  94  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4209  50S ribosomal protein L9  42.11 
 
 		 150 aa  93.6  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.828057  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18001  50S ribosomal protein L9  37.75 
 
 		 152 aa  93.6  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4665  50S ribosomal protein L9  44.6 
 
 		 148 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0656931 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3589  50S ribosomal protein L9  38.56 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0889  50S ribosomal protein L9  43.24 
 
 		 194 aa  93.2  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  36.24 
 
 		 148 aa  92.8  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4931  50S ribosomal protein L9  44.6 
 
 		 148 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100703 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  38 
 
 		 179 aa  92  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  34.39 
 
 		 149 aa  91.3  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1051  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 192 aa  90.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289991 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2510  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 194 aa  90.9  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.531472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1403  50S ribosomal protein L9  41.03 
 
 		 150 aa  90.9  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0571  ribosomal protein L9  36.84 
 
 		 150 aa  90.9  6e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.409562  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  40.67 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0418  ribosomal protein L9  38.56 
 
 		 150 aa  90.5  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.291311  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 		 189 aa  90.5  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04070  50S ribosomal protein L9  40.13 
 
 		 149 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3790  ribosomal protein L9  40.13 
 
 		 149 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00574678  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4673  50S ribosomal protein L9  40.13 
 
 		 149 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04032  hypothetical protein  40.13 
 
 		 149 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3810  50S ribosomal protein L9  40.13 
 
 		 149 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0581092 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5718  50S ribosomal protein L9  40.13 
 
 		 149 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.595872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4447  50S ribosomal protein L9  40.13 
 
 		 149 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4736  50S ribosomal protein L9  40.13 
 
 		 149 aa  90.5  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257928  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4764  50S ribosomal protein L9  40.13 
 
 		 149 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1194  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 192 aa  90.1  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.762079  normal  0.0731596 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4542  50S ribosomal protein L9  32.43 
 
 		 152 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.736351 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  40.4 
 
 		 167 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0449  50S ribosomal protein L9  37.25 
 
 		 150 aa  89.4  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00474942 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4790  50S ribosomal protein L9  39.47 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.131212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4812  50S ribosomal protein L9  39.47 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0162172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4754  50S ribosomal protein L9  39.47 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1894  50S ribosomal protein L9  40.38 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000492255  hitchhiker  0.000000062237 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1780  50S ribosomal protein L9  39.35 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6208  50S ribosomal protein L9  40.38 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1216  50S ribosomal protein L9  40.26 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  32.45 
 
 		 170 aa  89.4  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1808  50S ribosomal protein L9  39.35 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1871  50S ribosomal protein L9  40.38 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>