More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10053 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 
164 aa  328  2e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0035e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  83.14 
 
 
170 aa  276  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  84.39 
 
 
170 aa  263  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  81.4 
 
 
172 aa  262  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  81.4 
 
 
172 aa  262  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  81.4 
 
 
172 aa  262  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  78.66 
 
 
156 aa  253  6e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  77.19 
 
 
165 aa  248  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  73.99 
 
 
173 aa  248  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  71.19 
 
 
177 aa  242  2e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  74.4 
 
 
168 aa  232  2e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  73.94 
 
 
159 aa  229  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  70.41 
 
 
167 aa  219  1e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  68.07 
 
 
166 aa  217  6e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  63.98 
 
 
182 aa  214  3e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  60.21 
 
 
188 aa  214  4e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  65.34 
 
 
175 aa  212  2e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  82.79 
 
 
219 aa  212  2e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  60.1 
 
 
192 aa  212  2e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  66.26 
 
 
153 aa  212  2e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  68.42 
 
 
169 aa  211  3e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  64.12 
 
 
300 aa  211  3e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  62.3 
 
 
186 aa  210  5e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  79.51 
 
 
198 aa  210  6e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  59.57 
 
 
188 aa  209  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  82.79 
 
 
193 aa  209  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  79.2 
 
 
166 aa  208  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  63.1 
 
 
163 aa  208  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  60.1 
 
 
193 aa  207  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  71.81 
 
 
171 aa  207  6e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  57.14 
 
 
189 aa  206  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  64.94 
 
 
170 aa  205  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  75.41 
 
 
200 aa  197  5e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  73.88 
 
 
191 aa  196  1e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  75.41 
 
 
189 aa  196  1e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  75.41 
 
 
195 aa  195  2e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  56.61 
 
 
178 aa  194  5e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  77.27 
 
 
171 aa  187  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  77.05 
 
 
182 aa  185  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  47.67 
 
 
193 aa  179  1e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  54.49 
 
 
167 aa  179  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  58.27 
 
 
218 aa  174  6e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  66.13 
 
 
179 aa  172  1e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  56.92 
 
 
179 aa  162  2e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4401  single-strand binding protein  60.98 
 
 
201 aa  145  2e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000415912  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  47.27 
 
 
148 aa  144  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 
225 aa  130  1e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  47.54 
 
 
305 aa  125  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  48.76 
 
 
179 aa  122  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  46.46 
 
 
148 aa  118  3e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  44.44 
 
 
174 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  39.74 
 
 
164 aa  94.4  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  37.33 
 
 
170 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  42.55 
 
 
230 aa  90.1  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  37.33 
 
 
169 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  1.2759e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  37.33 
 
 
173 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  37.33 
 
 
173 aa  89.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.26746e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  37.33 
 
 
172 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  37.33 
 
 
173 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  38.02 
 
 
233 aa  89.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  37.33 
 
 
173 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.22021e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  37.33 
 
 
172 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  6.0973e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  37.97 
 
 
164 aa  89.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  36.67 
 
 
173 aa  88.2  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  36.67 
 
 
172 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  3.80691e-06  hitchhiker  4.31686e-07 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  48 
 
 
164 aa  87.8  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.39016e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  36.49 
 
 
191 aa  87.8  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  46.3 
 
 
240 aa  85.9  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  34.25 
 
 
188 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  37.93 
 
 
147 aa  85.1  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  40.19 
 
 
118 aa  84.7  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  42 
 
 
150 aa  83.6  1e-15  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  45 
 
 
150 aa  83.2  2e-15  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  38.68 
 
 
172 aa  82.4  2e-15  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  43.3 
 
 
138 aa  82.4  3e-15  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  35.48 
 
 
184 aa  82  3e-15  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  33.52 
 
 
166 aa  82.4  3e-15  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  33.87 
 
 
187 aa  81.6  4e-15  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  1.09058e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  38.32 
 
 
157 aa  82  4e-15  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0930  single-strand binding protein  40.59 
 
 
233 aa  80.9  7e-15  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  42.27 
 
 
163 aa  80.9  8e-15  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  7.13514e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  33.54 
 
 
143 aa  80.5  1e-14  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  8.57397e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  38.05 
 
 
114 aa  80.1  1e-14  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  35.76 
 
 
172 aa  79.7  2e-14  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  6.12973e-07  hitchhiker  1.72856e-11 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  38.1 
 
 
176 aa  79.3  2e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  38.1 
 
 
176 aa  79.3  2e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  38.1 
 
 
176 aa  79.3  2e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  38.1 
 
 
176 aa  79.3  2e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  35.98 
 
 
172 aa  79.7  2e-14  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  39 
 
 
154 aa  79.3  2e-14  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  38.1 
 
 
176 aa  79.3  2e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0023  single-strand binding protein  45 
 
 
151 aa  78.6  4e-14  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  8.13945e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  43.88 
 
 
148 aa  78.6  4e-14  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.23705e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  38.61 
 
 
188 aa  78.6  4e-14  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  37.74 
 
 
186 aa  78.2  5e-14  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  42.31 
 
 
149 aa  78.2  5e-14  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  37.74 
 
 
182 aa  78.2  5e-14  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  43 
 
 
169 aa  77.8  5e-14  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  33.14 
 
 
157 aa  77.8  5e-14  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1126  single-strand binding protein  34.81 
 
 
174 aa  77.8  7e-14  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>