292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10046 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  360  5e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  90.61 
 
 
181 aa  294  6e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  87.85 
 
 
181 aa  285  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  83.15 
 
 
252 aa  270  6e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5375  PadR family transcriptional regulator  87.06 
 
 
181 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5464  PadR family transcriptional regulator  87.06 
 
 
181 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5751  PadR family transcriptional regulator  87.06 
 
 
181 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.410016 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  70.69 
 
 
181 aa  208  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  69.36 
 
 
184 aa  204  5e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  55.03 
 
 
224 aa  201  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4194  transcriptional regulator, PadR-like family  71.12 
 
 
199 aa  198  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  62.92 
 
 
249 aa  193  9e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  56.98 
 
 
213 aa  190  8e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  53.8 
 
 
212 aa  189  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  55.37 
 
 
229 aa  187  6e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  54.65 
 
 
201 aa  182  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  54.44 
 
 
205 aa  178  3e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4562  transcriptional regulator PadR family protein  58.47 
 
 
211 aa  175  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605184  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2137  PadR family transcriptional regulator  53.12 
 
 
199 aa  174  8e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  53.14 
 
 
212 aa  171  7e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  50.86 
 
 
203 aa  170  8e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5080  PadR-like family transcriptional regulator  57.07 
 
 
212 aa  170  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.6626  hitchhiker  4.75922e-05 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5920  transcriptional regulator, PadR-like family  57.38 
 
 
198 aa  168  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  49.44 
 
 
202 aa  169  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  50.29 
 
 
227 aa  167  5e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  47.92 
 
 
213 aa  164  6e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  55.75 
 
 
272 aa  164  8e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4200  transcriptional regulator, PadR-like family  47.57 
 
 
209 aa  147  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3510  transcriptional regulator, PadR-like family  44.19 
 
 
198 aa  145  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  46.11 
 
 
187 aa  141  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  29.05 
 
 
191 aa  75.9  3e-13  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  38.79 
 
 
183 aa  75.1  5e-13  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3181  transcriptional regulator, PadR-like family  31.79 
 
 
177 aa  72  4e-12  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000117068  hitchhiker  5.06359e-10 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  32.96 
 
 
178 aa  67  1e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1535  transcriptional regulator, PadR-like family  31.58 
 
 
183 aa  67.4  1e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918183  normal  0.0405313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4407  transcriptional regulator protein-like protein  29.89 
 
 
176 aa  64.7  6e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0291759 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0038  transcriptional regulator, PadR-like family  39.8 
 
 
197 aa  63.2  2e-09  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  26.79 
 
 
165 aa  60.8  1e-08  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  26.19 
 
 
165 aa  60.1  2e-08  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  26.19 
 
 
165 aa  58.9  3e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  25 
 
 
165 aa  59.3  3e-08  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
179 aa  57.8  9e-08  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  39.29 
 
 
112 aa  57.4  1e-07  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  23.81 
 
 
165 aa  57  1e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  23.81 
 
 
165 aa  56.2  3e-07  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.5361e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  23.81 
 
 
165 aa  56.2  3e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15894e-06 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  23.81 
 
 
165 aa  56.2  3e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  26.47 
 
 
179 aa  55.8  3e-07  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  23.81 
 
 
165 aa  56.2  3e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  38.36 
 
 
114 aa  55.5  4e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  42.35 
 
 
183 aa  55.5  4e-07  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  30.23 
 
 
179 aa  55.1  6e-07  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  34.88 
 
 
177 aa  53.9  1e-06  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  24.55 
 
 
174 aa  53.5  1e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  29.19 
 
 
176 aa  54.3  1e-06  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  31.25 
 
 
195 aa  53.1  2e-06  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.19842e-06 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  31.54 
 
 
242 aa  52.8  3e-06  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4159  transcriptional regulator, PadR-like family  30.51 
 
 
176 aa  52.8  3e-06  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  29.38 
 
 
175 aa  52  4e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 
107 aa  51.6  5e-06  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  30.25 
 
 
168 aa  51.6  5e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  41.98 
 
 
191 aa  51.6  6e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2396  transcriptional regulator, PadR-like family  33.77 
 
 
111 aa  51.6  6e-06  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.109028  normal  0.171865 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0876  PadR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
179 aa  51.2  7e-06  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.184962  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1537  PadR-like family transcriptional regulator  28.82 
 
 
181 aa  50.8  1e-05  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1562  transcriptional regulator, PadR-like family  37.93 
 
 
186 aa  50.4  1e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.553173  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  41.46 
 
 
191 aa  50.8  1e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
154 aa  50.8  1e-05  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  32.19 
 
 
203 aa  50.8  1e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  35.71 
 
 
110 aa  50.1  2e-05  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
220 aa  49.7  2e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  23.95 
 
 
179 aa  50.1  2e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  25.34 
 
 
184 aa  49.7  2e-05  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1786  transcriptional regulator, PadR-like family  37.97 
 
 
186 aa  49.7  2e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
220 aa  49.7  2e-05  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5624  transcriptional regulator, PadR-like family  32.32 
 
 
191 aa  49.3  3e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  34.15 
 
 
111 aa  49.3  3e-05  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
213 aa  49.3  3e-05  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7568  transcriptional regulator, PadR-like family  39.39 
 
 
277 aa  49.3  3e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  34.52 
 
 
110 aa  49.3  3e-05  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  32.47 
 
 
179 aa  49.3  3e-05  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  36.59 
 
 
210 aa  49.3  3e-05  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  23.67 
 
 
185 aa  49.3  3e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0184  PadR-like family transcriptional regulator  26.56 
 
 
179 aa  49.3  3e-05  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  34.52 
 
 
110 aa  49.3  3e-05  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
127 aa  49.3  3e-05  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1669  PadR family transcriptional regulator  23.95 
 
 
179 aa  49.3  3e-05  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.107785  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0865  hypothetical protein  40.79 
 
 
179 aa  48.9  4e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  36.47 
 
 
177 aa  48.9  4e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  34.52 
 
 
110 aa  48.9  4e-05  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1578  PadR-like family transcriptional regulator  32.89 
 
 
185 aa  48.9  4e-05  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59882  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4863  transcriptional regulator, PadR-like family  28.74 
 
 
186 aa  48.9  4e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149571  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1645  transcriptional regulator  23.95 
 
 
179 aa  48.9  4e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  35.8 
 
 
119 aa  48.9  4e-05  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  38.89 
 
 
174 aa  48.5  5e-05  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  38.75 
 
 
263 aa  48.5  5e-05  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  36.71 
 
 
116 aa  48.5  5e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  30.52 
 
 
205 aa  48.5  5e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25120  predicted transcriptional regulator  42.5 
 
 
132 aa  48.5  5e-05  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3678  transcriptional regulator, PadR-like family  41.56 
 
 
238 aa  48.5  5e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>