More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10041 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
208 aa  411  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  71.15 
 
 
171 aa  200  1e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  71.15 
 
 
171 aa  200  1e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  73.79 
 
 
152 aa  197  1e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  67.83 
 
 
146 aa  180  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  67.13 
 
 
146 aa  176  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  44.86 
 
 
155 aa  80.5  2e-14  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  44.86 
 
 
155 aa  79.7  3e-14  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  44.86 
 
 
155 aa  79.7  3e-14  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  39.57 
 
 
150 aa  79.3  3e-14  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
143 aa  77  2e-13  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
146 aa  76.6  2e-13  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  39.86 
 
 
161 aa  75.9  4e-13  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  39.16 
 
 
149 aa  73.9  2e-12  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 
163 aa  73.9  2e-12  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  43.93 
 
 
147 aa  73.9  2e-12  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
142 aa  73.2  3e-12  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  41.13 
 
 
171 aa  70.9  1e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  40.19 
 
 
146 aa  71.2  1e-11  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  36.91 
 
 
151 aa  70.5  2e-11  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  40.77 
 
 
157 aa  70.5  2e-11  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  43.27 
 
 
161 aa  67.8  1e-10  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  42.99 
 
 
163 aa  67.8  1e-10  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  39.32 
 
 
159 aa  66.6  3e-10  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 
149 aa  66.6  3e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 
144 aa  66.6  3e-10  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
144 aa  63.9  1e-09  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  40.18 
 
 
151 aa  64.3  1e-09  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  46.24 
 
 
138 aa  63.5  2e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
149 aa  63.5  2e-09  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  42.53 
 
 
140 aa  62.8  4e-09  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  39.81 
 
 
151 aa  62.4  4e-09  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 
161 aa  60.8  2e-08  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 
139 aa  60.5  2e-08  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
141 aa  60.5  2e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 
178 aa  59.3  4e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
143 aa  58.5  6e-08  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  36.24 
 
 
165 aa  58.5  7e-08  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
173 aa  58.5  7e-08  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
173 aa  58.5  7e-08  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 
154 aa  58.2  9e-08  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
143 aa  57.4  1e-07  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
158 aa  57.4  1e-07  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
150 aa  57.4  2e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
172 aa  57.4  2e-07  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
147 aa  57  2e-07  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  47.06 
 
 
127 aa  57  2e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 
156 aa  57  2e-07  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 
174 aa  56.6  2e-07  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.03133e-10 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  38.02 
 
 
176 aa  56.2  3e-07  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  7.47398e-05 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
173 aa  55.8  4e-07  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 
143 aa  55.8  4e-07  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
151 aa  56.2  4e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 
168 aa  55.5  6e-07  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
148 aa  55.5  6e-07  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
156 aa  55.5  6e-07  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0044  MarR family transcriptional regulator  47.69 
 
 
193 aa  55.5  6e-07  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  24.8 
 
 
142 aa  55.5  6e-07  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 
151 aa  55.1  7e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  2.02401e-07 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  34.59 
 
 
157 aa  55.1  8e-07  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  34.62 
 
 
145 aa  54.7  9e-07  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 
163 aa  54.7  9e-07  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  41.1 
 
 
153 aa  54.3  1e-06  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
144 aa  54.3  1e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
159 aa  54.3  1e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6078  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 
143 aa  54.3  1e-06  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
142 aa  53.9  2e-06  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4248  transcriptional regulator, MarR family  41.05 
 
 
163 aa  53.9  2e-06  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
147 aa  53.1  2e-06  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
161 aa  53.5  2e-06  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 
149 aa  53.9  2e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 
147 aa  53.5  2e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  35.24 
 
 
150 aa  53.5  2e-06  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  30.93 
 
 
138 aa  53.5  2e-06  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  48.53 
 
 
138 aa  53.1  3e-06  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
142 aa  52.8  3e-06  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  33.04 
 
 
144 aa  53.1  3e-06  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 
162 aa  52.8  3e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
149 aa  53.1  3e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 
189 aa  52.8  4e-06  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
147 aa  52.4  4e-06  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  35.54 
 
 
164 aa  52.8  4e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  2.18689e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 
159 aa  52.8  4e-06  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  24.8 
 
 
142 aa  52.8  4e-06  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1208  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 
147 aa  52.4  5e-06  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00251951  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7850  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
143 aa  52.4  5e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172522  normal  0.477187 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  31.16 
 
 
145 aa  52.4  5e-06  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  34.92 
 
 
142 aa  52.4  5e-06  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 
154 aa  52  6e-06  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  43.66 
 
 
143 aa  52  6e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  43.66 
 
 
143 aa  52  6e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
152 aa  52  6e-06  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.49259e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  43.66 
 
 
143 aa  52  6e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
151 aa  52  7e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
151 aa  52  7e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
151 aa  52  7e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 
183 aa  51.2  9e-06  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  31.78 
 
 
154 aa  51.6  9e-06  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
178 aa  51.6  9e-06  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  37.61 
 
 
137 aa  51.2  1e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>