15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10039 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10039  secreted proline rich protein mtc28 (proline rich 28 kDa antigen)  100 
 
 
310 aa  607  1e-172  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.768071 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6055  hypothetical protein  49.84 
 
 
320 aa  247  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342819  normal  0.445072 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0852  hypothetical protein  49.83 
 
 
327 aa  243  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0559953 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5390  hypothetical protein  50.18 
 
 
297 aa  226  5e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5479  hypothetical protein  50.18 
 
 
297 aa  226  5e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.846329  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5766  hypothetical protein  50.18 
 
 
297 aa  226  5e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555782  normal  0.844624 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4785  putative lipoprotein  35.14 
 
 
223 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.860651 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11034  lipoprotein lpqT  35.14 
 
 
226 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4251  putative lipoprotein  36.97 
 
 
219 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.574926  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4630  putative lipoprotein  36.97 
 
 
219 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.368951  normal  0.388459 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4337  putative lipoprotein  36.97 
 
 
219 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.47243  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0313  Lipoprotein LpqT, predicted  33.93 
 
 
209 aa  86.3  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.621091  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1941  putative lipoprotein  32.93 
 
 
217 aa  85.1  1e-15  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.946468  normal  0.897742 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0519  Lipoprotein LpqT, predicted  33.33 
 
 
209 aa  85.1  2e-15  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5212  LpqN  23.93 
 
 
245 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.14833  normal  0.148833 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>