95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10036 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10036  integral membrane protein  100 
 
 
441 aa  846    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.43551 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6058  major facilitator superfamily transporter  66.03 
 
 
427 aa  565  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0849  major facilitator transporter  65.48 
 
 
454 aa  554  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.534463  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5393  putative integral membrane protein  67.62 
 
 
427 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5482  putative integral membrane protein  67.62 
 
 
427 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0695382  normal  0.381838 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5769  putative integral membrane protein  67.62 
 
 
427 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0822708  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4834  major facilitator superfamily MFS_1  44.14 
 
 
434 aa  296  5e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4220  major facilitator superfamily MFS_1  48.11 
 
 
441 aa  281  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.665807  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7077  major facilitator superfamily MFS_1  42.48 
 
 
436 aa  253  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5396  major facilitator superfamily MFS_1  36.89 
 
 
442 aa  202  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9367  hypothetical protein  36.61 
 
 
432 aa  199  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5841  hypothetical protein  36.26 
 
 
436 aa  193  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5077  major facilitator superfamily MFS_1  41.29 
 
 
416 aa  190  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4972  major facilitator superfamily MFS_1  38.83 
 
 
427 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3101  hypothetical protein  38.24 
 
 
433 aa  170  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3570  major facilitator superfamily protein  37.74 
 
 
441 aa  170  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.546301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9035  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 
434 aa  169  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0246012  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1610  major facilitator transporter  37.97 
 
 
450 aa  161  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37850  Major Facilitator Superfamily transporter  35.77 
 
 
432 aa  152  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4847  major facilitator superfamily MFS_1  37.96 
 
 
431 aa  139  7.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2529  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 
428 aa  138  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3708  major facilitator superfamily MFS_1  33.99 
 
 
435 aa  135  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4203  major facilitator superfamily MFS_1  34.18 
 
 
491 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.274526  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3360  major facilitator superfamily MFS_1  34.75 
 
 
453 aa  132  9e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4530  hypothetical protein  31.88 
 
 
462 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7320  major facilitator transporter  32.19 
 
 
476 aa  124  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38056  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  26.46 
 
 
688 aa  78.6  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  31.87 
 
 
424 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  27.67 
 
 
901 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  34.78 
 
 
411 aa  60.1  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4419  hypothetical protein  27.97 
 
 
533 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21441  putative multidrug efflux transporter, MFS family protein  26.54 
 
 
471 aa  57.4  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0501  major facilitator transporter  27.94 
 
 
529 aa  57  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406138  decreased coverage  0.00103191 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  25.59 
 
 
709 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0740  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 
725 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  32.84 
 
 
426 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  21.6 
 
 
397 aa  55.5  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 
426 aa  54.7  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0413  major facilitator transporter  25.92 
 
 
543 aa  54.3  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  25.48 
 
 
688 aa  53.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  30.16 
 
 
411 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  31.58 
 
 
405 aa  52.8  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  22.75 
 
 
730 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  27.62 
 
 
686 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 
451 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  35 
 
 
420 aa  51.2  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4679  major facilitator superfamily MFS_1  36.99 
 
 
409 aa  51.2  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.395256  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  29.91 
 
 
427 aa  50.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  25.28 
 
 
434 aa  50.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  29.63 
 
 
703 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  34.17 
 
 
433 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  28.89 
 
 
705 aa  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  25.47 
 
 
707 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  34.45 
 
 
427 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  29.45 
 
 
662 aa  47.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2016  MFS superfamily transporter  25.76 
 
 
459 aa  47  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.647427  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0655  MFS superfamily transporter  25.5 
 
 
460 aa  46.6  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  22.69 
 
 
417 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1937  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  33.11 
 
 
927 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1732  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  33.11 
 
 
927 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2296  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  33.11 
 
 
927 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200957  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2215  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  33.11 
 
 
927 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.360269  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0616  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  33.11 
 
 
927 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1647  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  33.11 
 
 
927 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0697  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  33.11 
 
 
927 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4597  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 
727 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  29.88 
 
 
414 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5404  major facilitator transporter  50 
 
 
418 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3736  major facilitator superfamily MFS_1  32.18 
 
 
432 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.854411  normal  0.0699565 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3682  major facilitator superfamily MFS_1  32.18 
 
 
432 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  30.39 
 
 
707 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0153  major facilitator transporter  26.68 
 
 
598 aa  45.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0060166 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  33.12 
 
 
461 aa  44.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  33.57 
 
 
434 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  22.69 
 
 
414 aa  44.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  36.84 
 
 
427 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  22.96 
 
 
414 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  40.91 
 
 
433 aa  44.3  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 
439 aa  43.9  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2897  putative transporter  26.09 
 
 
400 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000603201 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  24.48 
 
 
415 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2935  transporter, putative  26.09 
 
 
400 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00291638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  24.48 
 
 
417 aa  43.5  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2647  macrolide efflux protein  26.09 
 
 
400 aa  43.5  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376776  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2945  putative transporter  26.09 
 
 
400 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000764756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  24.48 
 
 
417 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2624  macrolide efflux protein  26.09 
 
 
400 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0728  major facilitator transporter  27.16 
 
 
543 aa  43.5  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.165324  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1155  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 
399 aa  43.5  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.128986 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  24.48 
 
 
415 aa  43.5  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  24.48 
 
 
417 aa  43.5  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1278  major facilitator superfamily MFS_1  29 
 
 
450 aa  43.5  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2702  major facilitator transporter  26.09 
 
 
400 aa  43.1  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00155167  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  24.27 
 
 
1833 aa  43.1  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  34.21 
 
 
418 aa  43.1  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>