36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10035 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10035  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  506  1e-142  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6059  hypothetical protein  73.54 
 
 
258 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5394  hypothetical protein  73.54 
 
 
258 aa  362  3e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5770  wyosine base formation  73.54 
 
 
258 aa  362  3e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0624769  normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5483  wyosine base formation  73.54 
 
 
258 aa  362  3e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308542  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0848  wyosine base formation  71.98 
 
 
260 aa  354  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.57773  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3832  wyosine base formation  63.75 
 
 
269 aa  296  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4430  Wyosine base formation domain protein  58.33 
 
 
264 aa  267  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16480  conserved hypothetical protein TIGR03084  56.15 
 
 
271 aa  261  9e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0690  Wyosine base formation domain protein  61.04 
 
 
261 aa  251  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4556  hypothetical protein  54.98 
 
 
266 aa  249  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67145  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4873  Wyosine base formation domain protein  56.2 
 
 
261 aa  229  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4764  wyosine base formation domain-containing protein  54.96 
 
 
268 aa  230  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  2.08476e-05 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2825  hypothetical protein  53.51 
 
 
260 aa  229  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7298  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4324  wyosine base formation  53.99 
 
 
269 aa  224  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0254069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3148  hypothetical protein  49.8 
 
 
269 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1710  hypothetical protein  51.97 
 
 
332 aa  215  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3207  hypothetical protein  47.22 
 
 
270 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113668  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3269  wyosine base formation  47.22 
 
 
270 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42708  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3218  wyosine base formation  47.22 
 
 
270 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0337846  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6990  wyosine base formation  43.97 
 
 
267 aa  201  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4597  wyosine base formation  45.06 
 
 
270 aa  201  1e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.992249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6694  wyosine base formation  48.21 
 
 
270 aa  200  2e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.288227 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2835  wyosine base formation  44.76 
 
 
284 aa  192  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6381  wyosine base formation  42.02 
 
 
266 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.0240218 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2706  wyosine base formation  41.6 
 
 
306 aa  184  1e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338329  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0559  wyosine base formation domain-containing protein  42.4 
 
 
264 aa  182  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0343  hypothetical protein  41.77 
 
 
264 aa  179  5e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1030  hypothetical protein  40.78 
 
 
269 aa  155  9e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.098599  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6364  Wyosine base formation domain protein  36.8 
 
 
250 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.24755 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1024  hypothetical protein  34.15 
 
 
259 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2414  hypothetical protein  36.14 
 
 
266 aa  129  4e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.096621  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4594  hypothetical protein  32.03 
 
 
266 aa  117  2e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2877  wyosine base formation  32.54 
 
 
265 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6362  hypothetical protein  28.77 
 
 
416 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13116  hypothetical protein  25.71 
 
 
283 aa  43.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>