More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10034 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10034  fatty-acid-CoA ligase fadD34  100 
 
 
562 aa  1148  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.284875  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2129  acyltransferase family protein  29.51 
 
 
852 aa  213  5e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7006  AMP-dependent synthetase and ligase  32.22 
 
 
962 aa  211  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96639  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0194  acyl-CoA synthetase  29.51 
 
 
936 aa  209  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3393  AMP-dependent synthetase and ligase  30.81 
 
 
942 aa  209  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0997952  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2145  AMP-dependent synthetase and ligase  30.25 
 
 
958 aa  207  6e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3073  AMP-dependent synthetase and ligase  31.79 
 
 
653 aa  206  6e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168838  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  28.04 
 
 
581 aa  205  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0231  acyl-CoA synthetase  31.78 
 
 
608 aa  204  4e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.229667  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  29.17 
 
 
947 aa  203  5e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0626569  normal  0.797277 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  28.27 
 
 
581 aa  203  6e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1929  AMP-dependent synthetase and ligase  31.63 
 
 
648 aa  201  2e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362101  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7411  AMP-dependent synthetase and ligase  29.36 
 
 
587 aa  196  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  27.78 
 
 
7122 aa  196  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6493  AMP-dependent synthetase and ligase  29.85 
 
 
600 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.679743  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  31.34 
 
 
2721 aa  194  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5637  AMP-dependent synthetase and ligase  29.85 
 
 
600 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6002  AMP-dependent synthetase and ligase  29.85 
 
 
600 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  30.36 
 
 
1067 aa  193  7e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02801  hypothetical protein  29.27 
 
 
573 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  4.78815e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02851  putative saframycin Mx1 synthetase B  29.27 
 
 
576 aa  192  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  6.92091e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  28.19 
 
 
4317 aa  191  3e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  28.19 
 
 
4317 aa  190  6e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  29.17 
 
 
4317 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4912  amino acid adenylation domain protein  34.86 
 
 
1715 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.650159  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  30 
 
 
1776 aa  188  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18360  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.9 
 
 
577 aa  187  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3442  acyl-CoA synthetase  29.09 
 
 
576 aa  187  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3260  acyl-CoA synthetase  28.7 
 
 
563 aa  187  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3074  AMP-dependent synthetase and ligase  29.8 
 
 
603 aa  187  6e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0248989  normal  0.398199 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  28.27 
 
 
6889 aa  186  9e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3155  acyl-CoA synthetase  29.09 
 
 
576 aa  186  1e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  27.65 
 
 
4317 aa  185  1e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  31.58 
 
 
610 aa  185  1e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0943  AMP-binding domain-containing protein  31.24 
 
 
1035 aa  186  1e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1800  AMP-binding domain-containing protein  31.42 
 
 
610 aa  185  2e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  31.58 
 
 
599 aa  185  2e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1302  AMP-binding domain-containing protein  31.58 
 
 
610 aa  185  2e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0293  AMP-binding domain-containing protein  31.58 
 
 
599 aa  185  2e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117519  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3127  acyl-CoA synthetase  29.87 
 
 
576 aa  185  2e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274694  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0718  acyl-CoA synthetase  28.91 
 
 
573 aa  185  2e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1016  AMP-binding domain-containing protein  31.58 
 
 
599 aa  185  2e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322447  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8079  AMP-dependent synthetase and ligase  30.31 
 
 
949 aa  183  9e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00339839  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  27.92 
 
 
2997 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  30.45 
 
 
3208 aa  182  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6150  AMP-dependent synthetase and ligase  30.2 
 
 
594 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.102681  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2951  AMP-dependent synthetase and ligase  34.4 
 
 
577 aa  182  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982174  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  30.09 
 
 
4336 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  28.24 
 
 
579 aa  181  3e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2770  AMP-dependent synthetase and ligase  29.87 
 
 
584 aa  180  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4552  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.11 
 
 
563 aa  179  8e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0999  AMP-dependent synthetase and ligase  28.79 
 
 
706 aa  179  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771586  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  29.64 
 
 
4336 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  28.77 
 
 
1801 aa  179  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  29.03 
 
 
2820 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  26.06 
 
 
3099 aa  179  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  29.64 
 
 
1789 aa  178  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3394  acyl-CoA synthetase  31.39 
 
 
577 aa  178  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.682932  normal  0.36093 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1688  acyl-CoA synthetase  30.66 
 
 
568 aa  177  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.176255 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32420  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.92 
 
 
560 aa  177  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.300153  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  26.34 
 
 
614 aa  177  6e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0821  acyl-CoA synthetase  28.01 
 
 
585 aa  177  6e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2875  AMP-dependent synthetase and ligase  29.28 
 
 
958 aa  177  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255103  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  28.2 
 
 
597 aa  177  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  29.54 
 
 
2250 aa  177  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  9.13323e-05 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  27.02 
 
 
3718 aa  176  7e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.78 
 
 
544 aa  176  8e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  27.4 
 
 
597 aa  176  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10409  acyl-CoA synthetase  28.45 
 
 
585 aa  176  9e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  26.95 
 
 
611 aa  176  1e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2295  AMP-dependent synthetase and ligase  28.89 
 
 
839 aa  176  1e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3104  acyl-CoA synthetase  32.06 
 
 
601 aa  175  2e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12964  acyl-CoA synthetase  28.52 
 
 
619 aa  175  2e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3164  acyl-CoA synthetase  32.06 
 
 
601 aa  175  2e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254716  normal  0.383191 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3124  acyl-CoA synthetase  32.78 
 
 
601 aa  174  3e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  30.16 
 
 
4342 aa  174  4e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  26.22 
 
 
991 aa  174  4e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  28.04 
 
 
3231 aa  174  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  27.91 
 
 
4332 aa  173  6e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0418  AMP-dependent synthetase and ligase  30.41 
 
 
586 aa  173  7e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11209  acyl-CoA synthetase  29.55 
 
 
578 aa  173  8e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2989  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 
593 aa  172  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3423  acyl-CoA synthetase  30.17 
 
 
601 aa  172  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  29.1 
 
 
4342 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0272  acyl-CoA synthetase  30.4 
 
 
573 aa  172  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984727  normal  0.936672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11562  acyl-CoA synthetase  29.31 
 
 
584 aa  171  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0417  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 
586 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393755  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  27.48 
 
 
2762 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3965  AMP-dependent synthetase and ligase  34.26 
 
 
613 aa  171  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666614  normal  0.454806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8830  peptide synthetase  32.31 
 
 
574 aa  170  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426227  decreased coverage  0.000549729 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5195  amino acid adenylation domain protein  26.46 
 
 
2753 aa  170  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.628302 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4760  AMP-dependent synthetase and ligase  29.23 
 
 
597 aa  170  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0389  AMP-dependent synthetase and ligase  30.95 
 
 
586 aa  170  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  29.36 
 
 
755 aa  169  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  30.3 
 
 
3235 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  30.5 
 
 
609 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12944  acyl-CoA synthetase  27.3 
 
 
626 aa  168  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5217  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.26 
 
 
544 aa  168  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  27.99 
 
 
578 aa  168  3e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6079  AMP-dependent synthetase and ligase  31.07 
 
 
555 aa  168  3e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  hitchhiker  0.00908459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>