More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10024 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  551  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5763  NLP/P60 protein  53.72 
 
 
362 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  55.56 
 
 
332 aa  130  4e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  53.4 
 
 
235 aa  119  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  39.75 
 
 
348 aa  116  4e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  39.67 
 
 
340 aa  115  8e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  51.49 
 
 
438 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  49.53 
 
 
164 aa  106  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  37.78 
 
 
337 aa  105  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  49.02 
 
 
400 aa  104  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  44.83 
 
 
347 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45.69 
 
 
321 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  49.07 
 
 
366 aa  102  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  52.83 
 
 
317 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  49.54 
 
 
370 aa  100  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  48.54 
 
 
452 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  47.12 
 
 
331 aa  99.8  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  45.45 
 
 
372 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  45.45 
 
 
372 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  45.3 
 
 
432 aa  99  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  45.3 
 
 
432 aa  99  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  39.33 
 
 
319 aa  98.2  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  48.91 
 
 
333 aa  98.2  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0298  NLP/P60 protein  46.09 
 
 
437 aa  98.2  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.283102  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  49.51 
 
 
349 aa  98.6  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  40.12 
 
 
394 aa  97.4  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  44.44 
 
 
370 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  47.17 
 
 
446 aa  97.1  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  44.55 
 
 
372 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  46.23 
 
 
350 aa  97.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  47.57 
 
 
459 aa  96.3  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2684  NLP/P60 protein  48.08 
 
 
232 aa  95.1  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  50 
 
 
337 aa  95.5  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.21 
 
 
531 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  51.02 
 
 
398 aa  94.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  43.12 
 
 
378 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  46.15 
 
 
417 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  42.2 
 
 
378 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  36.65 
 
 
306 aa  94  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  41.44 
 
 
535 aa  93.2  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  47.19 
 
 
293 aa  93.2  4e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  46.43 
 
 
222 aa  93.2  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  51.09 
 
 
390 aa  92.4  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  40 
 
 
348 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  40 
 
 
348 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.86 
 
 
556 aa  92  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  40 
 
 
363 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  44.44 
 
 
363 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  41.67 
 
 
363 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  40 
 
 
348 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  45.53 
 
 
388 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  41.9 
 
 
330 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  36 
 
 
265 aa  90.1  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.04581e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  46.08 
 
 
162 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  41.28 
 
 
348 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  36.36 
 
 
343 aa  90.5  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  38.18 
 
 
335 aa  89.7  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  46.39 
 
 
204 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  41.84 
 
 
361 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  41.84 
 
 
361 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  38.27 
 
 
323 aa  88.2  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  50 
 
 
380 aa  87  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  45.13 
 
 
374 aa  87  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  34.68 
 
 
327 aa  86.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  39.02 
 
 
469 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  42.05 
 
 
391 aa  86.7  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  44.21 
 
 
524 aa  86.3  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1562  NlpC/P60 family protein  50.67 
 
 
553 aa  85.9  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  2.46871e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  47.83 
 
 
392 aa  85.5  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  43.27 
 
 
388 aa  85.5  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5534  NLP/P60 protein  42.15 
 
 
420 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  44.23 
 
 
315 aa  85.5  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  39.1 
 
 
475 aa  85.5  1e-15  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  39.62 
 
 
340 aa  85.1  1e-15  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.44 
 
 
329 aa  85.1  1e-15  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  35.47 
 
 
467 aa  85.5  1e-15  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  39.1 
 
 
475 aa  85.5  1e-15  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  39.1 
 
 
475 aa  85.5  1e-15  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  39.62 
 
 
256 aa  84.3  2e-15  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  43.16 
 
 
298 aa  84  3e-15  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  40.57 
 
 
301 aa  83.2  4e-15  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0385  NLP/P60 protein  46.15 
 
 
360 aa  83.2  4e-15  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  41.05 
 
 
259 aa  83.2  4e-15  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  43.88 
 
 
345 aa  82.8  5e-15  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  39.62 
 
 
453 aa  83.2  5e-15  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  45.05 
 
 
375 aa  83.2  5e-15  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  40.5 
 
 
318 aa  83.2  5e-15  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  41.23 
 
 
374 aa  83.2  5e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  42.31 
 
 
388 aa  82.8  6e-15  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.43 
 
 
176 aa  82.8  6e-15  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  37.4 
 
 
469 aa  82.8  6e-15  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  40.21 
 
 
227 aa  82.8  6e-15  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  47.62 
 
 
373 aa  82.8  6e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5540  NLP/P60 protein  44.35 
 
 
473 aa  82.4  7e-15  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981915  normal  0.121534 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  41.41 
 
 
197 aa  82  1e-14  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  37.84 
 
 
467 aa  82  1e-14  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  47.57 
 
 
236 aa  81.6  1e-14  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  37.84 
 
 
467 aa  82  1e-14  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  37.93 
 
 
342 aa  82  1e-14  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  37.4 
 
 
469 aa  82  1e-14  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>