79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10023 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10023  transcriptional regulator  100 
 
 
256 aa  511  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0736  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 
288 aa  55.8  6e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  50.91 
 
 
252 aa  53.1  4e-06  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 
145 aa  52.4  6e-06  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4333  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 
190 aa  50.4  2e-05  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  36.11 
 
 
190 aa  50.4  3e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4633  DNA-binding protein  36.11 
 
 
190 aa  50.4  3e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0622  DNA-binding protein  36.11 
 
 
190 aa  50.4  3e-05  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.475485  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  36.11 
 
 
190 aa  50.4  3e-05  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4631  DNA-binding protein  36.11 
 
 
190 aa  50.4  3e-05  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4613  DNA-binding protein  36.11 
 
 
190 aa  50.4  3e-05  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  36.11 
 
 
190 aa  50.4  3e-05  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  36.11 
 
 
190 aa  50.4  3e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5130  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.56 
 
 
188 aa  50.4  3e-05  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.87177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  36.11 
 
 
190 aa  50.4  3e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2039  DNA-binding protein  33.72 
 
 
178 aa  50.1  4e-05  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  8.24446e-05  hitchhiker  5.01479e-19 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3505  transcriptional regulator, XRE family  35.19 
 
 
97 aa  48.5  9e-05  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
256 aa  48.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  2.31765e-08  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01392  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.56 
 
 
178 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1740  DNA-binding protein  32.56 
 
 
178 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.89008e-05  hitchhiker  2.35786e-17 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2225  XRE family transcriptional regulator  32.56 
 
 
178 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.639128 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01402  hypothetical protein  32.56 
 
 
178 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1613  DNA-binding protein  32.56 
 
 
178 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  32.56 
 
 
178 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2212  transcriptional regulator, XRE family  32.56 
 
 
178 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7511  transcriptional regulator, XRE family  41.1 
 
 
283 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1354  XRE family transcriptional regulator  44.87 
 
 
190 aa  45.8  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0758784  decreased coverage  0.00460659 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 
190 aa  45.4  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5954  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 
187 aa  45.4  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1579  transcriptional regulator  25.9 
 
 
182 aa  45.4  0.0009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  26.83 
 
 
105 aa  44.7  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0887  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 
218 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1139  transcriptional regulator  40.74 
 
 
232 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0958639 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  38.96 
 
 
255 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0894  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 
278 aa  45.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4106  transcriptional regulator, XRE family  39.76 
 
 
207 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0938506  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  33.98 
 
 
187 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  53.66 
 
 
201 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  31.33 
 
 
182 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1096  helix-turn-helix domain-containing protein  34.18 
 
 
182 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1556  transcriptional regulator, XRE family  34.67 
 
 
178 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  45.28 
 
 
196 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1719  XRE family transcriptional regulator  33.77 
 
 
178 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.499876  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  31.11 
 
 
206 aa  43.5  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5267  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 
190 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.782951 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  38.33 
 
 
215 aa  43.5  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 
192 aa  43.5  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  4.81124e-09  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3019  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 
198 aa  43.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 
69 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7796  putative transcriptional regulator, XRE family  30.95 
 
 
271 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 
69 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  39.77 
 
 
183 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1783  XRE family transcriptional regulator  32.47 
 
 
178 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1722  transcriptional regulator, XRE family  34.67 
 
 
185 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.185673  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 
69 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1737  XRE family transcriptional regulator  33.77 
 
 
185 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 
201 aa  43.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  52.38 
 
 
196 aa  43.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1982  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 
175 aa  43.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.623481  normal  0.364753 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 
202 aa  43.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 
211 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5637  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 
227 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.76756  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 
201 aa  42.7  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3781  transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 
279 aa  42.7  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 
211 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 
227 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  44.68 
 
 
255 aa  42.4  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.93278e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  31.88 
 
 
185 aa  42.4  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6405  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 
189 aa  42.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146143  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0402  transcriptional regulator, XRE family  35.62 
 
 
189 aa  42.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.699228  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  30.15 
 
 
195 aa  42.4  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  29.91 
 
 
194 aa  42.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2231  XRE family transcriptional regulator  42 
 
 
187 aa  42  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  2.45077e-05 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2735  helix-turn-helix domain-containing protein  42.11 
 
 
104 aa  42  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2198  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 
201 aa  42  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1035  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 
179 aa  42  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.7846e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  40.38 
 
 
68 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 
191 aa  42  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  35.85 
 
 
218 aa  42  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>