51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10004 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  364  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  72.46 
 
 
190 aa  236  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  72.46 
 
 
190 aa  236  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  72.46 
 
 
190 aa  236  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  67.26 
 
 
185 aa  213  2e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  65.09 
 
 
188 aa  204  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  59.33 
 
 
180 aa  166  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  65.12 
 
 
217 aa  156  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00080644  normal  0.335319 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  54.89 
 
 
166 aa  153  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0004  protein of unknown function DUF721  58.94 
 
 
184 aa  152  3e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0005  protein of unknown function DUF721  61.6 
 
 
143 aa  149  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00151548  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0005  protein of unknown function DUF721  50 
 
 
188 aa  132  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  58.91 
 
 
198 aa  128  4e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  50.43 
 
 
185 aa  125  4e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06889e-13 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  41.42 
 
 
185 aa  123  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  59.02 
 
 
201 aa  123  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  1.27236e-08 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  46.77 
 
 
196 aa  121  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  49.58 
 
 
134 aa  121  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  43.45 
 
 
266 aa  119  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  48.36 
 
 
273 aa  118  5e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  47.06 
 
 
173 aa  118  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  49.23 
 
 
187 aa  117  8e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  46.4 
 
 
177 aa  114  1e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  48.8 
 
 
217 aa  114  1e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  45.3 
 
 
196 aa  111  6e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  39.51 
 
 
188 aa  108  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0004  hypothetical protein  42.24 
 
 
164 aa  107  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  40.52 
 
 
179 aa  106  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  40.52 
 
 
183 aa  104  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0005  protein of unknown function DUF721  42.74 
 
 
207 aa  104  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0005  protein of unknown function DUF721  46.4 
 
 
171 aa  101  8e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  40.83 
 
 
206 aa  93.6  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  43.36 
 
 
172 aa  92.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  43.62 
 
 
173 aa  85.5  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0004  protein of unknown function DUF721  45.31 
 
 
171 aa  85.1  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00476655  normal  0.0907524 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  30.33 
 
 
155 aa  69.3  3e-11  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0005  protein of unknown function DUF721  37.23 
 
 
117 aa  68.6  6e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444406 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1433  Zn-ribbon-containing RNA-binding protein  36.19 
 
 
156 aa  67.4  1e-10  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  38.03 
 
 
152 aa  59.3  3e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  31.51 
 
 
151 aa  54.7  8e-07  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  27.37 
 
 
153 aa  54.3  9e-07  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  25 
 
 
160 aa  51.6  7e-06  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  32.53 
 
 
159 aa  50.8  1e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  32.89 
 
 
168 aa  48.9  4e-05  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.16141e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0004  protein of unknown function DUF721  32.63 
 
 
105 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0095  hypothetical protein  23.53 
 
 
101 aa  47  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.437017  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1258  hypothetical protein  37.5 
 
 
169 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0095  Zn-ribbon-containing protein  22.99 
 
 
101 aa  45.4  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142092  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  29.58 
 
 
149 aa  45.1  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  22.47 
 
 
300 aa  43.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2691  protein of unknown function DUF721  30.59 
 
 
95 aa  42  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>