285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_R0020 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_R0020  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00624346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0048  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 74 bp  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0789708 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0059  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 74 bp  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000000338363  unclonable  0.0000000922471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0025  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 74 bp  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.086727 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0009  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 74 bp  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0008  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 74 bp  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.856422 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0040  tRNA-Asp  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.000000389023  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0002  tRNA-Asp  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.862537  normal  0.383164 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0027  tRNA-Asp  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAspVIMSS1309266  tRNA-Asp  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAAspVIMSS1309352  tRNA-Asp  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0875089  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0025  tRNA-Asp  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.883034 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.389049  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0043  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.101235  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAAspVIMSS1309155  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0722845  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAAspVIMSS1309079  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0016  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAAspVIMSS1309111  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAAspVIMSS1309200  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0997712 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0037  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0700091  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2259  tRNA-Asp  88.52 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.169626  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0043  tRNA-Asp  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.956354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2219  tRNA-Asp  88.52 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0045  tRNA-Asp  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  95 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.602947  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  95 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.520938  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2182  tRNA-Asp  95 
 
 		 79 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14012  tRNA-Asp  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.2553699999999997e-37  hitchhiker  0.00000344638 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2178  tRNA-Asp  95 
 
 		 79 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1738  tRNA-Asp  95 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000457664  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0016  tRNA-Asp  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.649998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0020  tRNA-Asp  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0057  tRNA-Asp  90.38 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.116847  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0046  tRNA-Asp  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0049  tRNA-Asp  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.221048  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1160  tRNA-Asp  95 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0165656  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1156  tRNA-Asp  95 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00893597  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1734  tRNA-Asp  95 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00000527786  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0046  tRNA-Asp  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.923307  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0051  tRNA-Asp  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0021  tRNA-Asp  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0039  tRNA-Asp  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299876 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4563  tRNA-Asp  87.3 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0027  tRNA-Asp  87.3 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.961867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0060  tRNA-Asp  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.285107  normal  0.0443211 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0026  tRNA-Asp  87.3 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.968227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0014  tRNA-Asp  87.3 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4316  tRNA-Asp  87.3 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0015  tRNA-Asp  87.3 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0014  tRNA-Asp  87.3 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.55678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0027  tRNA-Asp  87.3 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.76766  normal  0.328825 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0015  tRNA-Asp  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0055  tRNA-Asp  90 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.509832  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0036    90 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.132649  normal  0.79109 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0031  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06170  tRNA-Asp  90 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.58434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0034  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0659672  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0031  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0046  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA43  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353058 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0040  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.491584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0094  tRNA-Asp  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0096  tRNA-Asp  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0093  tRNA-Asp  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0044  tRNA-Asp  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0030  tRNA-Asp  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0073  tRNA-Asp  88.46 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.524429 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0060  tRNA-Asp  88.46 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.488944  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0006  tRNA-Asp  88.46 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108569 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01860  tRNA-Asp  88.46 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0074  tRNA-Asp  88.46 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.529781 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0006  tRNA-Asp  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000433123  normal  0.0757617 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0007  tRNA-Asp  88.46 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0059  tRNA-Asp  92.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.938712  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t12  tRNA-Asp  88.24 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0503237  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt02  tRNA-Asp  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00626728  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0298  tRNA-Asp  88.24 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00212865  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0025  tRNA-Asp  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0357766  normal  0.112448 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0046  tRNA-Asp  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000290325  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0013  tRNA-Asp  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0046  tRNA-Asp  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0034  tRNA-Asp  90.7 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.848663  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6033  tRNA-Asp  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.908357  normal  0.208238 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0014  tRNA-Asp  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0033  tRNA-Asp  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000000933276  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0033  tRNA-Asp  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0194372  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0034  tRNA-Asp  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0194372  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0031  tRNA-Asp  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000203604  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4562  tRNA-Asp  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0045  tRNA-Asp  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0021  tRNA-Asp  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0027  tRNA-Asp  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221595  normal  0.0673851 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0005  tRNA-Asp  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6034  tRNA-Asp  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.93695  normal  0.213156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0045  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0027  tRNA-Asp  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0556629  normal  0.064648 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0026  tRNA-Asp  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0364321  normal  0.064648 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0047  tRNA-Asp  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.31974 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0018  tRNA-Asp  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0034  tRNA-Asp  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.182102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>