More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_R0018 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_R0018  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.916069 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0052  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.786637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0003  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0157571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0054  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAAlaVIMSS1309149  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0382478  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAAlaVIMSS1309124  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.127335  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0013  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0927028  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0030  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0510531  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0023  tRNA-Ala  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.756244  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0023  tRNA-Ala  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00039  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000221447  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00040  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000022346  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0035  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000057464  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0036  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000163432  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0060  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0168409 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0187  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5048  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000423557  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0059  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0062  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4679  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000870415  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04529  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000000942406  normal  0.305986 
 
 
-
 
NC_003295  RS04531  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000151858  normal  0.305986 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4680  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267016  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1301  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00804048  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2968  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00156309  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2669  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0062  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0051  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138749  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAAlaVIMSS1309073  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2008  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0027  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.00000000000168426  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0030  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000620846  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2969  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0013859  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0048  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000617749  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0045  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.215104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5047  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000162268  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2646  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0177514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAAlaVIMSS1309346  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.190165 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2604  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0335338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0060  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00115408  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0059  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00107174  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3626  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00292958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0045  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0148496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0021  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.584667  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t18  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000569276  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0042  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0039  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000491618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0041  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00270764  hitchhiker  0.00379847 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0050  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21974  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0040  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00260551  hitchhiker  0.00377232 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2546  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0594848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0049  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.661163 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0053  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522841 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0051  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.517344 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0050  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00234368 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0029  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000636082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0032  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000439194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0455  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.654471  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0049  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000594982  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2555  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000235232  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1300  hypothetical protein  89.04 
 
 		 147 bp  81.8  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00987773  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAAlaVIMSS1309191  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0046  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0265781  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13041  hypothetical protein  89.04 
 
 		 165 bp  81.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.195099 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2554  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000251345  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2645  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0670079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2775  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.466623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2776  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.453071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3627  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00311856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0014  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000183317  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2670  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2603  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0323459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4597  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0017  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000742006  normal  0.411264 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2547  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.03374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0038  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000499676  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0040  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.403518  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0064  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.478576 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0041  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148903  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0057  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00550972  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0056  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0181776  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0021  tRNA-Ala  93.22 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.656534 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3161t  tRNA-Val  92.73 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0030  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0386  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0050  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.142623  normal  0.530513 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0011  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.454361  hitchhiker  0.00914283 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3082  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0011  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0110448 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0002  tRNA-Ala  88.89 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0004  tRNA-Ala  88.89 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1997  tRNA-Ala  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1995  tRNA-Ala  89.66 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4222  tRNA-Ala  89.66 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.27944e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0066  tRNA-Ala  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361397 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0088  tRNA-Ala  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000415947  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1985  tRNA-Ala  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000056627  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4221  tRNA-Ala  89.66 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0091  tRNA-Ala  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000846369  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0035  tRNA-Ala  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222164  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>