More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_B2654 on replicon NC_007595
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  236  8e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  62.39 
 
 
124 aa  150  7e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  41.23 
 
 
123 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  41.23 
 
 
123 aa  100  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  47.62 
 
 
388 aa  100  9e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  44.14 
 
 
125 aa  99  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.12 
 
 
393 aa  98.6  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  36.84 
 
 
124 aa  96.7  9e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  35.96 
 
 
124 aa  95.1  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  56.58 
 
 
119 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  56.58 
 
 
119 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  56.58 
 
 
119 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  56.58 
 
 
119 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  44.04 
 
 
119 aa  90.5  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2696  rhodanese domain-containing protein  53.95 
 
 
119 aa  89.4  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 
119 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 
119 aa  87.4  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  53.95 
 
 
119 aa  86.7  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 
119 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41 
 
 
389 aa  85.9  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  42.59 
 
 
123 aa  85.5  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  45.19 
 
 
126 aa  84.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  46.73 
 
 
119 aa  84.3  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2887  rhodanese-like protein  42.2 
 
 
119 aa  84  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52776  hitchhiker  0.0000448823 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  42.72 
 
 
480 aa  84  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  43.52 
 
 
120 aa  82.8  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  51.32 
 
 
119 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  43.27 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16580  Rhodanese-related sulfurtransferase  51.9 
 
 
106 aa  80.5  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0172752  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  41.07 
 
 
323 aa  80.5  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1406  rhodanese-like protein  40.37 
 
 
119 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700677  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  39.42 
 
 
126 aa  79  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  40.95 
 
 
361 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  36.52 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  35.51 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  37.89 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  41.3 
 
 
135 aa  74.7  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  37.89 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  40.59 
 
 
220 aa  73.6  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  43.37 
 
 
138 aa  73.6  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.11 
 
 
380 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  42.11 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0147  rhodanese domain-containing protein  45.45 
 
 
263 aa  72  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  43.01 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  33.04 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04370  Rhodanese-related sulfurtransferase  39.39 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155672 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  34.43 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  44.74 
 
 
130 aa  70.1  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0429  thiosulfate sulfurtransferase  38.14 
 
 
110 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0835156  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  42.11 
 
 
116 aa  70.5  0.000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  42.05 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 
129 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  40.22 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  39.09 
 
 
438 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  43.42 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2592  rhodanese domain-containing protein  41.33 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261053  normal  0.428361 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  39.02 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  41.76 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  39.24 
 
 
346 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  40.96 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  43.84 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  35.4 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1862  Rhodanese domain protein  35.65 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.364067  normal  0.0328946 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  38.26 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  42.53 
 
 
135 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1238  hypothetical protein  34.65 
 
 
115 aa  67  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  37.93 
 
 
130 aa  67  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  42.35 
 
 
114 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  35.65 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  40.96 
 
 
140 aa  67  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
134 aa  67  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  37.78 
 
 
117 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  44.58 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2086  rhodanese-like protein  33.03 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  37.93 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  34.55 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0398  thiosulfate sulfurtransferase  36.08 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0432  thiosulfate sulfurtransferase  36.08 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.822865  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  35.64 
 
 
113 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  32.2 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4804  thiosulfate sulfurtransferase  34.38 
 
 
109 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.598839  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  34.95 
 
 
354 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  39.77 
 
 
113 aa  65.5  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  29.06 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  34.74 
 
 
480 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  33.33 
 
 
99 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  31.9 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  34.07 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  36.94 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1666  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  40.43 
 
 
378 aa  65.1  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28085  normal  0.198345 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  40.79 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  39.09 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  37.35 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  40.28 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0887  rhodanese-like protein  40.22 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  38.74 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  32.17 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>