15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_B2640 on replicon NC_007595
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007595  Synpcc7942_B2640  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  292  1e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4439  hypothetical protein  51.43 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7004  hypothetical protein  48.98 
 
 
139 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0486  hypothetical protein  48.96 
 
 
151 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.240352  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0011  hypothetical protein  35.97 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.808442  normal  0.0183228 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0010  hypothetical protein  35.97 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2416  hypothetical protein  44.78 
 
 
123 aa  65.5  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82077  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6129  hypothetical protein  33.67 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386671  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4899  hypothetical protein  30.3 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.348391  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2917  hypothetical protein  38.33 
 
 
84 aa  47  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.862357  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3483  hypothetical protein  43.75 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2919  hypothetical protein  36.07 
 
 
179 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2375  hypothetical protein  40 
 
 
73 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0792048  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2709  hypothetical protein  38.78 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3394  hypothetical protein  38.78 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.46136 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>