More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2604 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 		 195 aa  392  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  64.52 
 
 		 206 aa  253  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  63.73 
 
 		 207 aa  251  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  62.83 
 
 		 214 aa  251  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  61.45 
 
 		 205 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  61.45 
 
 		 205 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  58.82 
 
 		 208 aa  228  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  53.61 
 
 		 211 aa  218  5e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  54.05 
 
 		 200 aa  204  7e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  54.4 
 
 		 197 aa  203  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0606  cytochrome c oxidase subunit III  52.82 
 
 		 201 aa  201  4e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  52.75 
 
 		 201 aa  201  5e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1775  cytochrome c oxidase, subunit III  51.6 
 
 		 201 aa  201  6e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.556435  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06401  cytochrome c oxidase, subunit III  53.8 
 
 		 207 aa  200  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04411  cytochrome c oxidase, subunit III  52.13 
 
 		 206 aa  200  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.738181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04681  cytochrome c oxidase, subunit III  50.25 
 
 		 200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  54.75 
 
 		 210 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0443  cytochrome c oxidase, subunit III  50.25 
 
 		 200 aa  198  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.547798  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04991  cytochrome c oxidase, subunit III  50.25 
 
 		 200 aa  198  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.487367  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  55.49 
 
 		 198 aa  196  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1756  cytochrome c oxidase subunit III  50.51 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  43 
 
 		 200 aa  160  8.000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  46.28 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  44.56 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0276  cytochrome c oxidase, subunit III  46.24 
 
 		 204 aa  155  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.0430335 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  44.32 
 
 		 204 aa  155  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  45.16 
 
 		 229 aa  147  8e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3575  cytochrome c oxidase subunit III  46.49 
 
 		 222 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515089  normal  0.0102703 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  38.69 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  41.71 
 
 		 208 aa  134  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3100  cytochrome c oxidase subunit III  41.3 
 
 		 222 aa  131  7.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0979  cytochrome c oxidase subunit III  39.9 
 
 		 198 aa  124  9e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.139868  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  38.02 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  36.46 
 
 		 194 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  38.69 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  37.89 
 
 		 198 aa  115  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  35.85 
 
 		 213 aa  115  6e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  38.42 
 
 		 197 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  41.51 
 
 		 294 aa  114  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  35.98 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0039  cytochrome c oxidase, subunit III  39.87 
 
 		 304 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  37.44 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  34.72 
 
 		 292 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  37.44 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  37.69 
 
 		 197 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  37.69 
 
 		 197 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  37.69 
 
 		 197 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  35.53 
 
 		 200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  38.5 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  37.5 
 
 		 220 aa  111  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  38 
 
 		 208 aa  111  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  37.71 
 
 		 283 aa  111  6e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  39.77 
 
 		 180 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  34.2 
 
 		 292 aa  110  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  37.11 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  38.12 
 
 		 295 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  35.07 
 
 		 215 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  38.12 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  36.92 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  34.76 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  36 
 
 		 205 aa  108  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  34.9 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  36.98 
 
 		 220 aa  109  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  40.49 
 
 		 291 aa  108  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0918  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 273 aa  108  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.163295  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  38.16 
 
 		 205 aa  108  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  36.95 
 
 		 203 aa  108  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0523  cytochrome c oxidase subunit III  35.12 
 
 		 292 aa  108  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  34.54 
 
 		 203 aa  108  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  35.33 
 
 		 202 aa  108  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04023  cytochrome C oxidase subunit III  41.91 
 
 		 291 aa  108  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0882  cytochrome c oxidase, subunit III  37.18 
 
 		 293 aa  107  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  35.05 
 
 		 212 aa  107  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0904  cytochrome c oxidase subunit III  36.13 
 
 		 284 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199365  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  33.64 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  36.95 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  34.9 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0233  cytochrome c oxidase subunit III  37.23 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.496819  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  32.98 
 
 		 208 aa  105  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  33.64 
 
 		 224 aa  105  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1249  cytochrome c oxidase, subunit III  37.82 
 
 		 293 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  36.76 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0472  cytochrome c oxidase, subunit III  39.86 
 
 		 292 aa  105  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1383  cytochrome c oxidase, subunit III  40.44 
 
 		 293 aa  105  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0679531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  34.72 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  39.86 
 
 		 439 aa  105  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  35.47 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  34.72 
 
 		 199 aa  105  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  39.71 
 
 		 291 aa  105  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  40.44 
 
 		 293 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  35.75 
 
 		 298 aa  105  6e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1401  cytochrome c oxidase, subunit III  31.66 
 
 		 291 aa  104  7e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.129461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  33.97 
 
 		 211 aa  104  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0330  cytochrome c oxidase, subunit III  40.44 
 
 		 288 aa  104  8e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.625024  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  40.44 
 
 		 295 aa  104  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4583  cytochrome c oxidase, subunit III  34.65 
 
 		 284 aa  104  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1045  cytochrome c oxidase subunit III  34.15 
 
 		 292 aa  104  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0586  cytochrome c oxidase subunit III  39.86 
 
 		 292 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141909  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  34.34 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  38.93 
 
 		 279 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.562387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>