49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2576 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2576  hypothetical protein  100 
 
 		 504 aa  985    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000057775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1070  peptidase M50  49.19 
 
 		 493 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0318096 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2489  peptidase M50  47.92 
 
 		 492 aa  428  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.896404  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0417  peptidase M50  45.74 
 
 		 500 aa  424  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.807166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4976  peptidase M50  44.07 
 
 		 505 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2388  peptidase M50  49.4 
 
 		 499 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2035  peptidase M50  45.73 
 
 		 501 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2061  peptidase M50  45.73 
 
 		 501 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2307  predicted protein  31.03 
 
 		 420 aa  173  5.999999999999999e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00988345 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0087  hypothetical protein  33.5 
 
 		 503 aa  157  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2814  peptidase M50  28.54 
 
 		 494 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3285  peptidase M50  28.54 
 
 		 494 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00379295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4003  peptidase M50  28.47 
 
 		 493 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0618882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3438  peptidase M50  27.05 
 
 		 491 aa  124  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.526789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5131  peptidase M50  28.03 
 
 		 493 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.628863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3897  peptidase M50  27.52 
 
 		 499 aa  120  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.725325  normal  0.5726 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33462  predicted protein  28.5 
 
 		 684 aa  117  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1470  peptidase M50  28.41 
 
 		 369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1707  peptidase M50  28.84 
 
 		 491 aa  112  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.195139  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1182  peptidase M50  30.24 
 
 		 326 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44486  predicted protein  29.06 
 
 		 834 aa  104  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.330794  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0719  zinc metalloprotease  38.41 
 
 		 369 aa  97.8  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2060  peptidase M50  30.14 
 
 		 364 aa  96.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1296  peptidase M50  33.5 
 
 		 381 aa  92.4  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3483  peptidase M50  31.55 
 
 		 388 aa  90.5  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1514  peptidase M50  29.86 
 
 		 392 aa  88.6  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4461  peptidase M50  29.45 
 
 		 315 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4470  peptidase M50  30.77 
 
 		 322 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.503859 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4480  peptidase M50  29.9 
 
 		 315 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.948254  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1446  peptidase M50  26.07 
 
 		 550 aa  85.1  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4325  peptidase M50  30.41 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1984  peptidase M50  26.46 
 
 		 341 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186308  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1977  peptidase M50  31.02 
 
 		 378 aa  83.2  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2383  peptidase M50  29.15 
 
 		 383 aa  80.5  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.796244 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0506  peptidase M50  27.95 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0921606  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0500  peptidase M50  29.68 
 
 		 342 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.394939  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0291  peptidase M50  24.29 
 
 		 368 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00037958 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0463  peptidase M50  27.06 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1675  zinc protease, putative  31.87 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2710  peptidase M50  26.13 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5617  peptidase M50  25.98 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0258  peptidase M50  29.25 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0511  peptidase M50  28.42 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1523  peptidase M50  31.82 
 
 		 423 aa  70.1  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.379776  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1247  peptidase M50  25.71 
 
 		 379 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3682  peptidase M50  27.01 
 
 		 378 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0908  zinc protease  29.76 
 
 		 422 aa  50.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00811957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  24.09 
 
 		 370 aa  45.8  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  24.32 
 
 		 364 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>