More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2559 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2559  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 152 aa  299  8.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4542  50S ribosomal protein L9  69.74 
 
 		 152 aa  213  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.736351 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3244  50S ribosomal protein L9  67.76 
 
 		 152 aa  207  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.65089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2852  50S ribosomal protein L9  67.11 
 
 		 152 aa  206  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2542  50S ribosomal protein L9  65.1 
 
 		 152 aa  198  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2193  50S ribosomal protein L9  62.91 
 
 		 152 aa  196  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28961  50S ribosomal protein L9  64.24 
 
 		 152 aa  195  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18001  50S ribosomal protein L9  60.93 
 
 		 152 aa  193  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1272  50S ribosomal protein L9  60.93 
 
 		 152 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21431  50S ribosomal protein L9  60.93 
 
 		 152 aa  191  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18631  50S ribosomal protein L9  60.13 
 
 		 151 aa  182  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.58702  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1765  50S ribosomal protein L9  58.28 
 
 		 151 aa  178  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18631  50S ribosomal protein L9  58.28 
 
 		 151 aa  177  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18821  50S ribosomal protein L9  57.62 
 
 		 151 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0277205  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0329  50S ribosomal protein L9  60.26 
 
 		 152 aa  171  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.355323  normal  0.434143 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1460  50S ribosomal protein L9  59.73 
 
 		 152 aa  171  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0890745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2897  50S ribosomal protein L9  58.94 
 
 		 152 aa  165  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000174347  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0287  ribosomal protein L9  57.62 
 
 		 152 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0120134  normal  0.0123082 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  47.97 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  44.3 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  39.74 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  43.24 
 
 		 150 aa  103  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  45.58 
 
 		 153 aa  103  8e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  40.4 
 
 		 151 aa  103  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  38 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  40 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  41.22 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  43.24 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  43.05 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 151 aa  101  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 167 aa  100  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  46.26 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 148 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  36.24 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  38.26 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 148 aa  98.6  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  42.67 
 
 		 151 aa  98.6  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 148 aa  98.6  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10055  50S ribosomal protein L9  41.06 
 
 		 152 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.95125e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  43.05 
 
 		 171 aa  97.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3480  50S ribosomal protein L9  38.67 
 
 		 146 aa  97.4  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.34024  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  42.67 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  34.9 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1063  ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.342712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  41.5 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  41.1 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29830  Plastid ribosomal protein L9, imported to chloroplast, large ribosomal subunit  38.41 
 
 		 195 aa  95.9  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  40.67 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  40.67 
 
 		 151 aa  95.5  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5367  50S ribosomal protein L9  40.79 
 
 		 152 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5743  50S ribosomal protein L9  40.79 
 
 		 152 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5456  50S ribosomal protein L9  40.79 
 
 		 152 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166119  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 		 150 aa  94.4  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 151 aa  94  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 147 aa  93.6  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 151 aa  93.6  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  35.76 
 
 		 148 aa  93.6  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  35.81 
 
 		 149 aa  93.6  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0449  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00474942 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  42.95 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000928974  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  36.31 
 
 		 149 aa  92  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 167 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0877  50S ribosomal protein L9  39.07 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  39.22 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  33.33 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 		 168 aa  91.3  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0777  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 		 149 aa  91.3  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000131124  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 149 aa  90.9  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 149 aa  90.9  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 209 aa  90.5  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0571  ribosomal protein L9  34.23 
 
 		 150 aa  90.5  7e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.409562  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0586  50S ribosomal protein L9  41.61 
 
 		 150 aa  90.5  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.482938  hitchhiker  3.77539e-17 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1894  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 150 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000492255  hitchhiker  0.000000062237 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6208  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 150 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1871  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 150 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002335  LSU ribosomal protein L9p  37.58 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.178305  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  38.67 
 
 		 151 aa  90.1  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3589  50S ribosomal protein L9  36.91 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  33.54 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5171  50S ribosomal protein L9  39.33 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  40.67 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  36.73 
 
 		 149 aa  88.2  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  35.81 
 
 		 151 aa  88.2  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 153 aa  88.2  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1808  50S ribosomal protein L9  39.33 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>