25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2554 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2554  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  313  4e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.165189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4493  hydrogenase maturation protease  47.89 
 
 		 151 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0011  hydrogenase maturation protease  41.13 
 
 		 143 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0013  hydrogenase maturation protease  41.13 
 
 		 143 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5168  hydrogenase maturation protease  45.14 
 
 		 169 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.234349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4665  hypothetical protein  39.71 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4247  hydrogenase maturation protease  40.58 
 
 		 173 aa  100  9e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2717  hypothetical protein  37.93 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2475  hydrogenase maturation protease  46.09 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3538  hypothetical protein  35.66 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2794  hypothetical protein  36.05 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2717  hypothetical protein  37.12 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1555  peptidase M52, hydrogen uptake protein  35.71 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.0326576 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1369  hypothetical protein  36.17 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0079  hydrogenase maturation protease  28.67 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.882887  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2862  hypothetical protein  35.17 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2949  hydrogenase maturation protease  35.17 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109087  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2747  hydrogenase maturation protease  33.57 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3043  hydrogenase maturation protease  34.48 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000605484  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4112  HoxW protein  31.85 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0111777  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0113  HoxW protein  32.86 
 
 		 180 aa  53.9  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.486904  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1675  HoxW protein  30 
 
 		 181 aa  50.4  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.111038  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1526  HoxW protein  24.82 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000960813  hitchhiker  0.00380568 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2251  hydrogenase maturation protease  25.17 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012018  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  27.63 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>