More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2541 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2541  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 137 aa  273  5e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00272416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1767  50S ribosomal protein L19  79.17 
 
 		 120 aa  198  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00973634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1743  50S ribosomal protein L19  79.17 
 
 		 120 aa  198  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1043  50S ribosomal protein L19  79.17 
 
 		 120 aa  196  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00000555964  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2549  50S ribosomal protein L19  77.69 
 
 		 130 aa  192  9e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000188294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0439  ribosomal protein L19  77.5 
 
 		 120 aa  191  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123556  normal  0.5766 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1023  ribosomal protein L19  74.17 
 
 		 120 aa  188  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00623227 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05301  50S ribosomal protein L19  74.79 
 
 		 159 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05001  50S ribosomal protein L19  73.95 
 
 		 159 aa  184  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0268  50S ribosomal protein L19  72.44 
 
 		 127 aa  183  8e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.118712  normal  0.0551314 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0643  50S ribosomal protein L19  72.88 
 
 		 158 aa  181  3e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.886918 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05391  50S ribosomal protein L19  73.5 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.589917  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0475  50S ribosomal protein L19  71.9 
 
 		 156 aa  179  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1716  50S ribosomal protein L19  71.19 
 
 		 150 aa  179  1e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06821  50S ribosomal protein L19  72.88 
 
 		 158 aa  178  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1808  50S ribosomal protein L19  70.59 
 
 		 162 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0350868  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05311  50S ribosomal protein L19  71.43 
 
 		 162 aa  175  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.105613 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04761  ribosomal protein L19  72.41 
 
 		 163 aa  174  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.603852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07350  ribosomal protein L19  53.28 
 
 		 124 aa  136  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 		 114 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0714  50S ribosomal protein L19  55.65 
 
 		 116 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000264859  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01708  50S ribosomal protein L19  57.39 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0189538  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  57.02 
 
 		 115 aa  130  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  55.86 
 
 		 115 aa  130  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  54.55 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1580  50S ribosomal protein L19  56.14 
 
 		 120 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 		 114 aa  127  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5201  50S ribosomal protein L19  62.38 
 
 		 134 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  55.96 
 
 		 113 aa  126  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4734  50S ribosomal protein L19  62.38 
 
 		 134 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3100  50S ribosomal protein L19  54.95 
 
 		 117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026861  normal  0.106468 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1360  50S ribosomal protein L19  54.95 
 
 		 117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1290  50S ribosomal protein L19  54.95 
 
 		 117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000003977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1171  50S ribosomal protein L19  54.95 
 
 		 117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251517  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2835  50S ribosomal protein L19  54.95 
 
 		 117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000148121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2917  50S ribosomal protein L19  54.95 
 
 		 117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000128835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3014  50S ribosomal protein L19  54.95 
 
 		 117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000550721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1257  50S ribosomal protein L19  54.95 
 
 		 117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000504967  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3101  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 177 aa  125  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.255374  normal  0.735203 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1213  50S ribosomal protein L19  54.95 
 
 		 117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000888328  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0956  50S ribosomal protein L19  62 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.670119 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1413  ribosomal protein L19  55.96 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000153602  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4210  50S ribosomal protein L19  59.82 
 
 		 180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 		 116 aa  124  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1533  ribosomal protein L19  62.73 
 
 		 118 aa  125  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00121036  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 114 aa  125  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2107  50S ribosomal protein L19  54.7 
 
 		 148 aa  124  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00250382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  53.64 
 
 		 115 aa  125  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  53.64 
 
 		 115 aa  125  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2510  ribosomal protein L19  54.62 
 
 		 140 aa  125  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  54.78 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5273  50S ribosomal protein L19  62 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1491  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 		 116 aa  124  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2409  50S ribosomal protein L19  53.51 
 
 		 116 aa  124  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.116113 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0849  ribosomal protein L19  55.26 
 
 		 117 aa  124  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  53.98 
 
 		 115 aa  123  7e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  55.86 
 
 		 113 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002539  LSU ribosomal protein L19p  54.95 
 
 		 117 aa  123  8.000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000131397  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03477  50S ribosomal protein L19  54.95 
 
 		 117 aa  123  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 114 aa  122  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  54.13 
 
 		 115 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  58.49 
 
 		 119 aa  123  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2751  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 		 117 aa  122  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000896071  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2917  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 		 117 aa  123  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000537691  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0198  ribosomal protein L19  53.98 
 
 		 115 aa  123  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000492639  normal  0.504324 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  53.1 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02495  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0233029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1068  ribosomal protein L19  54.46 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000854887  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1077  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00292053  hitchhiker  0.00675829 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2890  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00198618  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3845  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0054034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0650  50S ribosomal protein L19  57.66 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0345381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2995  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0184061  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02459  hypothetical protein  54.46 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0136468  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  52.25 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0226  50S ribosomal protein L19  53.45 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000854826  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2758  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0531203  normal  0.0143177 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2765  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315914  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0892  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 		 117 aa  121  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00545492  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1373  LSU ribosomal protein L19P  54.13 
 
 		 113 aa  121  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000974692  normal  0.351017 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0217  50S ribosomal protein L19  55 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_004310  BR1907  50S ribosomal protein L19  55.93 
 
 		 145 aa  121  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371938  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  53.15 
 
 		 114 aa  121  3e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4078  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 184 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  55.05 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3755  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 183 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.649636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  54.31 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1835  50S ribosomal protein L19  55.93 
 
 		 145 aa  121  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.610841  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0638  50S ribosomal protein L19  53.85 
 
 		 145 aa  121  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.056681 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1299  ribosomal protein L19  54.95 
 
 		 115 aa  120  5e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0178063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>