51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2540 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2540  blue-copper-protein-like protein  100 
 
 		 153 aa  315  1e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00275414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2581  blue-copper-protein-like protein  52.21 
 
 		 147 aa  160  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3677  hypothetical protein  60.55 
 
 		 157 aa  148  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1576  hypothetical protein  49.02 
 
 		 167 aa  148  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0471287  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0385  hypothetical protein  41.38 
 
 		 146 aa  87.4  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2981  hypothetical protein  32.74 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.227676  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2109  hypothetical protein  37.25 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1949  hypothetical protein  33.64 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.129845  normal  0.699527 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5685  blue (type 1) copper domain protein  27.91 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4551  blue (type1) copper domain-containing protein  26.83 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2634  blue (type 1) copper domain protein  28.87 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6116  putative oxido-reductase protein CopI  26.4 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5106  blue (type 1) copper domain protein  28.33 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549955 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4902  blue (type1) copper domain-containing protein  24.35 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1092  blue (type 1) copper domain protein  26.32 
 
 		 165 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3487  blue (type1) copper domain-containing protein  27.64 
 
 		 170 aa  50.8  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4824  blue (type1) copper domain-containing protein  23.89 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.904248  normal  0.294152 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4603  blue (type1) copper domain-containing protein  24.78 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  29.51 
 
 		 272 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2197  blue (type 1) copper domain protein  28 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2721  blue (type1) copper domain-containing protein  28.1 
 
 		 166 aa  48.5  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0479159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1660  blue (type 1) copper domain protein  24.35 
 
 		 314 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1833  blue (type 1) copper domain protein  26.89 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584393 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9844  copper tolerance protein  25.95 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3015  hypothetical protein  31.58 
 
 		 123 aa  48.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0676858  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4269  blue (type1) copper domain-containing protein  25.81 
 
 		 161 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  25.55 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  27.82 
 
 		 119 aa  47  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2655  blue (type1) copper domain-containing protein  28.57 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1635  oxidoreductase  25.4 
 
 		 181 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.400621  normal  0.0387336 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1667  blue (type1) copper domain-containing protein  30.1 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2668  blue (type1) copper domain-containing protein  27.48 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  0.234604 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7873  blue (type 1) copper domain protein  27.78 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5863  blue (type 1) copper domain protein  28 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0734  blue (type 1) copper domain protein  26.02 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  28.69 
 
 		 104 aa  45.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1207  blue (type 1) copper domain protein  26.45 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9849  copper tolerance protein  25.6 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  27.27 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  26.27 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2601  blue (type1) copper domain-containing protein  28.85 
 
 		 160 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377321  normal  0.709674 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5030  blue (type1) copper domain-containing protein  27.48 
 
 		 159 aa  43.9  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4583  normal  0.77741 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2921  blue (type 1) copper domain protein  27.47 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0439603  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3583  hypothetical protein  22.1 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0348  blue (type1) copper domain-containing protein  23.48 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471869 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  26.27 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2159  plastocyanin/azurin family copper binding protein  23.72 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0076427  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27840  hypothetical protein  22.99 
 
 		 205 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  23.42 
 
 		 534 aa  40.8  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3980  blue (type 1) copper domain protein  26.19 
 
 		 166 aa  40.8  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  26.27 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>