284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2394 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2394  Na+/H+ antiporter  100 
 
 
593 aa  1137    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00954713  hitchhiker  0.00302602 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3229  sodium/hydrogen exchanger  57.6 
 
 
652 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2891  sodium/hydrogen exchanger  57.6 
 
 
652 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1446  sodium/hydrogen exchanger  56.91 
 
 
641 aa  445  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0859  sodium/hydrogen exchanger  49.14 
 
 
640 aa  436  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2740  Sodium/hydrogen exchanger  44.26 
 
 
629 aa  418  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0888  sodium/hydrogen exchanger  57.83 
 
 
628 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.043911 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0956  sodium/hydrogen exchanger  44.97 
 
 
639 aa  405  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  42.54 
 
 
637 aa  278  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000727  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  39.17 
 
 
599 aa  254  4.0000000000000004e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04922  Na+/K+/H+ antiporter  40.97 
 
 
597 aa  253  8.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1467  sodium/hydrogen exchanger  40 
 
 
601 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4254  sodium/hydrogen exchanger  42.23 
 
 
601 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4152  sodium/hydrogen exchanger  41.5 
 
 
608 aa  248  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.561792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  41.02 
 
 
601 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5185  sodium/hydrogen exchanger  46.91 
 
 
660 aa  245  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1024  Sodium/hydrogen exchanger  37.04 
 
 
602 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30796  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0472  CPA1 family Na+/H+ antiporter  40.83 
 
 
399 aa  245  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0494569  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  41.75 
 
 
741 aa  244  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05361  CPA1 family Na+/H+ antiporter  40.31 
 
 
399 aa  244  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  37.61 
 
 
651 aa  243  9e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3909  Na+/H+ antiporter  36.74 
 
 
607 aa  242  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  37.67 
 
 
619 aa  241  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16030  putative sodium/hydrogen antiporter  41.5 
 
 
611 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  37.58 
 
 
602 aa  240  6.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0220  hypothetical protein  40.71 
 
 
598 aa  239  9e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  35.32 
 
 
610 aa  239  1e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1380  putative sodium/hydrogen antiporter  41.5 
 
 
611 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00463957  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04971  CPA1 family Na+/H+ antiporter  42.12 
 
 
401 aa  235  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  35.37 
 
 
622 aa  235  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  37.56 
 
 
760 aa  231  4e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05271  CPA1 family Na+/H+ antiporter  41.86 
 
 
401 aa  231  4e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0377759  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  39.67 
 
 
637 aa  229  7e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  34.62 
 
 
611 aa  229  1e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2400  sodium/hydrogen exchanger  38.01 
 
 
625 aa  226  6e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000130765  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  33.1 
 
 
612 aa  225  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1861  sodium/hydrogen exchanger  38.81 
 
 
719 aa  225  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1871  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.45 
 
 
666 aa  224  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00461  Na+/H+ antiporter  39.39 
 
 
569 aa  222  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  40.35 
 
 
617 aa  222  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0146  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  38.57 
 
 
763 aa  221  3e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269507 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1998  sodium/hydrogen exchanger  36.49 
 
 
616 aa  219  7e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112153 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0156  sodium/hydrogen exchanger  38.33 
 
 
764 aa  219  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06781  putative Na+/H+ antiporter, CPA1 family  42.34 
 
 
421 aa  217  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  35.04 
 
 
596 aa  213  9e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.4 
 
 
596 aa  213  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.04 
 
 
596 aa  213  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.04 
 
 
596 aa  213  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2147  sodium/hydrogen exchanger  35.96 
 
 
670 aa  212  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251145  normal  0.368531 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2324  sodium/hydrogen exchanger  36.19 
 
 
670 aa  212  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.339898  normal  0.580137 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2537  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.5 
 
 
669 aa  212  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.04 
 
 
596 aa  212  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2224  sodium/hydrogen exchanger  35.96 
 
 
673 aa  212  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00760493  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.04 
 
 
596 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00005477  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  35.04 
 
 
596 aa  211  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  41.75 
 
 
620 aa  211  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  35.39 
 
 
623 aa  210  6e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2109  sodium/hydrogen exchanger  35.89 
 
 
643 aa  206  8e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04731  CPA1 family Na+/H+ antiporter  40.91 
 
 
402 aa  206  8e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.281963  normal  0.831051 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03225  Na(+):H(+) antiporter, CPA1 family protein  36.97 
 
 
625 aa  206  9e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05281  CPA1 family Na+/H+ antiporter  40.95 
 
 
414 aa  206  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0626531  normal  0.0646135 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1805  CPA1 family Na+/H+ antiporter  40.95 
 
 
414 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2321  sodium/hydrogen exchanger  37.56 
 
 
660 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.545125  hitchhiker  0.000203679 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2065  sodium/hydrogen exchanger  37.56 
 
 
660 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000562767  hitchhiker  0.000963897 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2308  sodium/hydrogen exchanger  37.65 
 
 
660 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2017  sodium/hydrogen exchanger  37.65 
 
 
660 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000155921  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2318  sodium/hydrogen exchanger  38.18 
 
 
599 aa  203  7e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0395796  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0521  Sodium/hydrogen exchanger  35.21 
 
 
604 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1732  sodium/hydrogen exchanger  39.14 
 
 
702 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0477  sodium/hydrogen exchanger  38.05 
 
 
616 aa  201  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0802705  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0640  CPA1 family Na+/H+ antiporter  43.11 
 
 
421 aa  199  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  36.73 
 
 
617 aa  196  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1720  CPA1 family Na+/H+ antiporter  41.43 
 
 
414 aa  194  3e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0042  sodium/hydrogen exchanger  35.55 
 
 
607 aa  190  5e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126585  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  37.5 
 
 
626 aa  189  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0424  sodium/hydrogen exchanger  38.46 
 
 
852 aa  189  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0868  Na(+):H(+) antiporter  34.05 
 
 
606 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  37.56 
 
 
628 aa  184  3e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2077  Na+/H+ antiporter, putative  32.45 
 
 
595 aa  182  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  36.78 
 
 
630 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  35.07 
 
 
617 aa  176  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0759  sodium/hydrogen exchanger  36.54 
 
 
584 aa  173  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135673  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4282  sodium/hydrogen exchanger  35.59 
 
 
609 aa  170  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19170  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  30.73 
 
 
640 aa  128  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.490991  normal  0.0684118 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3821  sodium/hydrogen exchanger  34.19 
 
 
407 aa  127  7e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  29.7 
 
 
597 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  30.09 
 
 
598 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  28.36 
 
 
596 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  28.07 
 
 
597 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  27.95 
 
 
597 aa  104  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  26.09 
 
 
498 aa  104  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  29.76 
 
 
597 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0122  sodium/hydrogen exchanger  27.89 
 
 
570 aa  99  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  27.14 
 
 
616 aa  97.4  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  29.35 
 
 
597 aa  97.1  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  27.88 
 
 
626 aa  96.3  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1831  sodium/hydrogen exchanger  28.82 
 
 
598 aa  96.3  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205605 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  29.1 
 
 
597 aa  94.7  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  28.07 
 
 
573 aa  93.6  9e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  26.34 
 
 
509 aa  92  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>