More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2330 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  100 
 
 		 407 aa  817    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1138  C-terminal processing peptidase-2  59.02 
 
 		 412 aa  471  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0605  carboxyl-terminal protease  58.77 
 
 		 413 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0620  carboxyl-terminal protease  58.77 
 
 		 413 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210968  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2052  carboxyl-terminal protease  58.19 
 
 		 416 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.774311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3440  C-terminal processing peptidase-2  60.95 
 
 		 417 aa  458  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0509581  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  58.38 
 
 		 413 aa  456  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  59.75 
 
 		 409 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07301  carboxyl-terminal processing protease  42.72 
 
 		 444 aa  355  5.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  44.96 
 
 		 425 aa  355  7.999999999999999e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  42.48 
 
 		 444 aa  355  8.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  45.26 
 
 		 430 aa  352  8.999999999999999e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  45.85 
 
 		 428 aa  350  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  44.78 
 
 		 444 aa  351  2e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  45.26 
 
 		 449 aa  351  2e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  42.34 
 
 		 444 aa  349  4e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  45 
 
 		 430 aa  350  4e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  46.84 
 
 		 430 aa  348  1e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  44.68 
 
 		 427 aa  346  3e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07361  carboxyl-terminal processing protease  42.13 
 
 		 434 aa  346  4e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775451 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0110  C-terminal processing peptidase-2  41.89 
 
 		 434 aa  345  8.999999999999999e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.196179  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07501  carboxyl-terminal processing protease  43.08 
 
 		 433 aa  345  1e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07911  carboxyl-terminal processing protease  43.64 
 
 		 450 aa  342  5e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal  0.0109245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  46.49 
 
 		 429 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  44.47 
 
 		 453 aa  334  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  45.21 
 
 		 426 aa  329  4e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21861  carboxyl-terminal protease  47.24 
 
 		 446 aa  328  8e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13600  predicted protein  48.27 
 
 		 389 aa  318  1e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.29725  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  43.37 
 
 		 434 aa  317  3e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  46.11 
 
 		 457 aa  314  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  46.11 
 
 		 436 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  46.56 
 
 		 394 aa  309  4e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1850  peptidase S41A, C-terminal protease  47.38 
 
 		 429 aa  309  6.999999999999999e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333848  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  42.11 
 
 		 447 aa  307  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  44.39 
 
 		 446 aa  306  4.0000000000000004e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  43.09 
 
 		 431 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  41.76 
 
 		 440 aa  303  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03601  carboxyl-terminal protease  44.53 
 
 		 436 aa  303  5.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  44.31 
 
 		 434 aa  302  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  40.9 
 
 		 440 aa  298  8e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  43.52 
 
 		 429 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  44.38 
 
 		 428 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  43.52 
 
 		 427 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  43.79 
 
 		 431 aa  293  5e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1614  carboxyl-terminal protease  41.69 
 
 		 458 aa  292  9e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1589  carboxyl-terminal protease  41.69 
 
 		 458 aa  292  9e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46670  predicted protein  40.43 
 
 		 476 aa  261  1e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698625  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4901  carboxyl-terminal protease  39.79 
 
 		 410 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  36.9 
 
 		 452 aa  236  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  35.88 
 
 		 476 aa  236  7e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  36.18 
 
 		 397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  36.04 
 
 		 439 aa  231  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  40.13 
 
 		 428 aa  230  3e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  37.33 
 
 		 438 aa  227  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  34.67 
 
 		 398 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  39.51 
 
 		 410 aa  225  9e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  36.91 
 
 		 401 aa  225  1e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  37.64 
 
 		 443 aa  225  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  40.43 
 
 		 433 aa  225  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  33.6 
 
 		 418 aa  224  3e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  36.6 
 
 		 422 aa  223  4e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  37.43 
 
 		 445 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  36.83 
 
 		 462 aa  223  4.9999999999999996e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  38.78 
 
 		 402 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  37.68 
 
 		 455 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  38.34 
 
 		 387 aa  221  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  41.01 
 
 		 417 aa  222  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  36.06 
 
 		 443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  38.78 
 
 		 402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  36.39 
 
 		 446 aa  221  3e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  38.98 
 
 		 482 aa  219  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  38.98 
 
 		 482 aa  219  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  35.99 
 
 		 423 aa  219  6e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  37.09 
 
 		 445 aa  219  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  40.94 
 
 		 436 aa  219  7e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  35.54 
 
 		 432 aa  219  7.999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  40.94 
 
 		 436 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  40 
 
 		 400 aa  218  2e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  36.7 
 
 		 445 aa  217  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  36.7 
 
 		 445 aa  217  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  37.46 
 
 		 383 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  38.51 
 
 		 468 aa  218  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  36.83 
 
 		 441 aa  216  4e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  34.94 
 
 		 444 aa  216  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  38.5 
 
 		 437 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  35.13 
 
 		 439 aa  216  5e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  34.86 
 
 		 444 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  37.19 
 
 		 439 aa  216  7e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  39.81 
 
 		 438 aa  215  9e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  35.85 
 
 		 439 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  36.97 
 
 		 457 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  39.11 
 
 		 450 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  39.87 
 
 		 377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  39.36 
 
 		 444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  36.31 
 
 		 444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  38.01 
 
 		 438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  38.01 
 
 		 438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  39.4 
 
 		 476 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  37.95 
 
 		 438 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  36.96 
 
 		 418 aa  213  7e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>