More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2308 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  100 
 
 
372 aa  750    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  56.71 
 
 
376 aa  423  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  58.63 
 
 
375 aa  414  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  56.08 
 
 
369 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  56.08 
 
 
369 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4863  glycine cleavage system T protein  55.53 
 
 
378 aa  400  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  56.91 
 
 
375 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  55.01 
 
 
374 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  51.34 
 
 
381 aa  389  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1647  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  55.8 
 
 
381 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  54.55 
 
 
365 aa  386  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21611  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  50.14 
 
 
372 aa  378  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.532359 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  49.86 
 
 
372 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18191  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  48.73 
 
 
359 aa  344  1e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18781  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.32 
 
 
370 aa  328  8e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.05 
 
 
364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.42 
 
 
370 aa  325  1e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.87 
 
 
364 aa  323  4e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.78 
 
 
366 aa  322  5e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.78 
 
 
366 aa  322  8e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  49.3 
 
 
360 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.78 
 
 
366 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.78 
 
 
366 aa  318  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.78 
 
 
366 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  48.37 
 
 
372 aa  318  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.51 
 
 
366 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.51 
 
 
366 aa  317  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.51 
 
 
366 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1780  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.6 
 
 
370 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.655467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.51 
 
 
366 aa  317  2e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.51 
 
 
366 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18781  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.33 
 
 
370 aa  313  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.63 
 
 
366 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.37 
 
 
360 aa  309  5e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.81 
 
 
360 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.09 
 
 
360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  44.66 
 
 
365 aa  306  3e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  42.31 
 
 
364 aa  302  6.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  44.69 
 
 
367 aa  295  9e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.41 
 
 
364 aa  293  3e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  42.66 
 
 
361 aa  292  5e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  42.86 
 
 
371 aa  291  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  39.34 
 
 
357 aa  291  1e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.05 
 
 
364 aa  288  7e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  44.11 
 
 
370 aa  288  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  42.7 
 
 
363 aa  288  1e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  41.32 
 
 
365 aa  287  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  45.38 
 
 
367 aa  287  2e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.28 
 
 
368 aa  287  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1720  glycine cleavage system T protein  45.26 
 
 
365 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.845128 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  43.77 
 
 
371 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  45.6 
 
 
351 aa  283  4.0000000000000003e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  40.49 
 
 
360 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0136  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.41 
 
 
368 aa  282  8.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  46.7 
 
 
364 aa  281  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.9 
 
 
365 aa  281  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  38.8 
 
 
360 aa  280  4e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  45.28 
 
 
381 aa  279  6e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3073  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.96 
 
 
370 aa  277  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.116584 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  41.53 
 
 
389 aa  277  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0155  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.13 
 
 
368 aa  277  2e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.843588  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  43.56 
 
 
366 aa  275  7e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  41.64 
 
 
366 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.78 
 
 
363 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.98 
 
 
441 aa  272  6e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.61 
 
 
360 aa  272  7e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.01 
 
 
362 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  42.97 
 
 
375 aa  270  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2759  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.99 
 
 
363 aa  271  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.81 
 
 
360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0662  glycine cleavage system T protein  41.3 
 
 
360 aa  270  4e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  44.03 
 
 
381 aa  269  5e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3437  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.98 
 
 
366 aa  268  8e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.74 
 
 
370 aa  268  8e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.4 
 
 
363 aa  268  1e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0446  glycine cleavage system T protein  43.06 
 
 
361 aa  268  1e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.190481  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.08 
 
 
359 aa  268  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  41.32 
 
 
366 aa  266  2.9999999999999995e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  44.66 
 
 
369 aa  266  5e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4451  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.84 
 
 
369 aa  266  5.999999999999999e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0863  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.96 
 
 
365 aa  265  8.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.86 
 
 
369 aa  265  8.999999999999999e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3916  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.23 
 
 
365 aa  265  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0132  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.32 
 
 
360 aa  265  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0117  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.6 
 
 
360 aa  265  1e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0045  glycine cleavage system T protein  46.15 
 
 
379 aa  265  1e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3830  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.96 
 
 
365 aa  265  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.434299  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01654  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.58 
 
 
369 aa  265  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0599  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.36 
 
 
362 aa  265  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.611166 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.34 
 
 
430 aa  264  2e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.11 
 
 
380 aa  264  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.16 
 
 
403 aa  264  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0867  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.69 
 
 
365 aa  263  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  39.19 
 
 
364 aa  262  6e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  42.31 
 
 
369 aa  262  8.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0350  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.04 
 
 
360 aa  261  1e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.536076  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.18 
 
 
365 aa  261  1e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3205  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.51 
 
 
363 aa  261  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000683742  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.27 
 
 
363 aa  261  2e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0838  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.29 
 
 
371 aa  260  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>