More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2297 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2297  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  100 
 
 
397 aa  803  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66755  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1424  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  71.28 
 
 
392 aa  578  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2163  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  71.61 
 
 
387 aa  568  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273645  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2116  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  71.61 
 
 
387 aa  568  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0283  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  69.23 
 
 
389 aa  557  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0438498 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07571  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  70.77 
 
 
390 aa  548  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1653  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  68.99 
 
 
390 aa  530  1e-149  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0705  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  67.18 
 
 
390 aa  526  1e-148  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0493  transaldolase B  73.09 
 
 
332 aa  474  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.466389  normal  0.164229 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1834  transaldolase  68.58 
 
 
334 aa  471  1e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3045  transaldolase B  68.81 
 
 
329 aa  464  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111322  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1851  transaldolase B  64.67 
 
 
332 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05761  transaldolase B  65.85 
 
 
332 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05211  transaldolase B  62.24 
 
 
339 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05751  transaldolase B  59.75 
 
 
333 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0519  transaldolase B  60 
 
 
333 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.882158  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05831  transaldolase B  57.93 
 
 
333 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.675554  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05451  transaldolase B  60.13 
 
 
333 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.514007  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1167  transaldolase B  58.93 
 
 
319 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0516908  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1231  transaldolase B  59.75 
 
 
319 aa  366  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164617  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1075  transaldolase B  58.62 
 
 
319 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170663  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0204  transaldolase B  58.81 
 
 
317 aa  363  3e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28222  transaldolase  55.76 
 
 
316 aa  362  4e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.562417  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2069  transaldolase B  58.07 
 
 
318 aa  357  2e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.851541  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1049  transaldolase B  58.07 
 
 
318 aa  356  4e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00112286  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2514  transaldolase B  59.19 
 
 
316 aa  355  1e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.38793  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3546  transaldolase B  56.88 
 
 
318 aa  353  3e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2967  transaldolase B  56.57 
 
 
318 aa  353  3e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  4.61015e-05  normal  0.264438 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27340  transaldolase B  59.69 
 
 
322 aa  353  3e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22140  transaldolase B  59.69 
 
 
322 aa  353  3e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2089  transaldolase B  58.13 
 
 
318 aa  353  3e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.466177  normal  0.339985 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3049  transaldolase B  56.57 
 
 
318 aa  353  4e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00546599  normal  0.166064 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3622  transaldolase B  59.12 
 
 
317 aa  352  7e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.517107  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3588  transaldolase  57.32 
 
 
317 aa  351  1e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4104  transaldolase B  57.98 
 
 
320 aa  351  1e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.559408  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0008  transaldolase B  57.32 
 
 
317 aa  351  1e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00008  hypothetical protein  57.32 
 
 
317 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3147  transaldolase B  56.27 
 
 
318 aa  350  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000170325  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00008  transaldolase B  57.32 
 
 
317 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0007  transaldolase B  57.32 
 
 
338 aa  351  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0008  transaldolase B  57.32 
 
 
317 aa  350  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0009  transaldolase B  57.32 
 
 
338 aa  350  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.703316  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3647  transaldolase B  57.32 
 
 
317 aa  350  2e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0688  transaldolase B  57.94 
 
 
317 aa  350  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0573478  hitchhiker  0.00205888 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0009  transaldolase B  57.32 
 
 
317 aa  350  2e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.967516  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0913  transaldolase B  57.76 
 
 
317 aa  350  3e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.507004  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0007  transaldolase B  57.01 
 
 
317 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0007  transaldolase B  57.01 
 
 
317 aa  349  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.411691  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0007  transaldolase B  57.01 
 
 
317 aa  349  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.811187  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0007  transaldolase B  57.01 
 
 
317 aa  349  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0007  transaldolase B  57.01 
 
 
317 aa  349  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.111561  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0521  transaldolase B  58.31 
 
 
316 aa  348  9e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0570  transaldolase B  57.32 
 
 
317 aa  348  1e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3472  transaldolase B  56.6 
 
 
317 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.179148  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0803  transaldolase B  56.6 
 
 
317 aa  347  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.240224  normal  0.311976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3599  transaldolase B  57.01 
 
 
317 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83514  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1126  transaldolase B  57.19 
 
 
315 aa  346  3e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2054  transaldolase B  57.37 
 
 
319 aa  347  3e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.4803  normal  0.221848 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03321  transaldolase B  57.45 
 
 
319 aa  347  3e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1655  transaldolase B  56.21 
 
 
316 aa  346  5e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  2.43642e-07  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0086  transaldolase B  55.66 
 
 
316 aa  345  7e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.946439  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0564  transaldolase B  56.83 
 
 
316 aa  345  1e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0537  transaldolase B  55.97 
 
 
317 aa  344  2e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0700  transaldolase A  56.52 
 
 
315 aa  344  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0576  transaldolase B  56.29 
 
 
317 aa  343  3e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1280  transaldolase B  56.39 
 
 
318 aa  342  6e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.01503e-07  normal  0.0282739 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03170  transaldolase, putative  56.25 
 
 
323 aa  342  6e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3664  transaldolase B  55.73 
 
 
317 aa  342  6e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1044  transaldolase B  56.21 
 
 
318 aa  341  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  2.65536e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1074  transaldolase B  56 
 
 
318 aa  341  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3318  transaldolase B  58.44 
 
 
317 aa  341  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0830908  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1185  transaldolase B  56.39 
 
 
318 aa  341  2e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0507197  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1228  transaldolase B  58.13 
 
 
317 aa  340  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2734  transaldolase B  55.28 
 
 
317 aa  340  3e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000145141  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1251  transaldolase B  54.11 
 
 
316 aa  340  3e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  4.93372e-07  hitchhiker  0.00916637 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3859  transaldolase B  55.41 
 
 
317 aa  339  4e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1111  transaldolase B  55.9 
 
 
318 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.40039e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3245  transaldolase B  55.9 
 
 
318 aa  339  5e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000112094  decreased coverage  0.000667795 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1089  transaldolase B  57.1 
 
 
318 aa  339  6e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  6.75704e-05  normal  0.0360442 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2900  transaldolase B  55.56 
 
 
317 aa  339  6e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1145  transaldolase B  55.9 
 
 
318 aa  338  7e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000154463  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5675  transaldolase B  55.28 
 
 
317 aa  338  8e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.319134 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000494  transaldolase  56.52 
 
 
316 aa  337  3e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.237649  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3386  transaldolase B  57.74 
 
 
315 aa  336  4e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2104  transaldolase B  57.32 
 
 
317 aa  334  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1485  transaldolase B  56.17 
 
 
310 aa  335  1e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  3.65093e-10  normal  0.591576 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3095  transaldolase B  54.86 
 
 
316 aa  333  2e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.433626 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0674  transaldolase B  54.52 
 
 
316 aa  334  2e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181851  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06256  transaldolase B  56.21 
 
 
316 aa  333  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0696  transaldolase B  54.52 
 
 
316 aa  334  2e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136448 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2254  transaldolase B  57.23 
 
 
317 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.333089  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1931  transaldolase B  57.96 
 
 
308 aa  330  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.247297 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3234  transaldolase B  54.23 
 
 
324 aa  330  2e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1709  transaldolase B  56.78 
 
 
308 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.137258  hitchhiker  2.13936e-05 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3574  transaldolase B  56.78 
 
 
308 aa  329  4e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2168  transaldolase B  56.78 
 
 
308 aa  329  5e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3847  transaldolase B  56.92 
 
 
308 aa  329  6e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0962  transaldolase B  56.88 
 
 
317 aa  329  6e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.544979  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0752  transaldolase B  54.37 
 
 
315 aa  328  8e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1723  transaldolase B  56.88 
 
 
317 aa  328  1e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>