More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2271 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  100 
 
 
183 aa  371  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  68.97 
 
 
182 aa  254  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  67.24 
 
 
184 aa  253  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  69.41 
 
 
183 aa  242  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  64.16 
 
 
195 aa  241  3.9999999999999997e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  65.17 
 
 
184 aa  236  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  67.65 
 
 
183 aa  234  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  66.47 
 
 
183 aa  232  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  52.6 
 
 
187 aa  180  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25181  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 
189 aa  178  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  49.71 
 
 
186 aa  178  4e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  52.6 
 
 
187 aa  177  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  49.71 
 
 
186 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03121  NUDIX hydrolase  53.75 
 
 
189 aa  175  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0212  NUDIX hydrolase  51.43 
 
 
186 aa  174  5e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.465676  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  51.45 
 
 
187 aa  174  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0238  NUDIX hydrolase  50.29 
 
 
186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03191  NUDIX hydrolase  49.71 
 
 
186 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.798424  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  40.33 
 
 
186 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  42.77 
 
 
186 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 
179 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  43.12 
 
 
171 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
176 aa  120  8e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 
176 aa  120  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  37.04 
 
 
179 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  37.04 
 
 
179 aa  117  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  37.04 
 
 
179 aa  117  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  37.04 
 
 
179 aa  117  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  37.04 
 
 
179 aa  117  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  37.04 
 
 
179 aa  117  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  37.04 
 
 
179 aa  117  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
179 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  41.42 
 
 
179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  36.42 
 
 
179 aa  115  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  36.42 
 
 
179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  38.22 
 
 
179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 
183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  35.85 
 
 
176 aa  112  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 
180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  36.65 
 
 
179 aa  111  6e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  39.24 
 
 
177 aa  111  7.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 
166 aa  110  9e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  40.82 
 
 
171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  40.97 
 
 
185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  36.02 
 
 
184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  42.11 
 
 
214 aa  108  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  37.34 
 
 
194 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  42.14 
 
 
164 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  35.91 
 
 
204 aa  106  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  35.98 
 
 
194 aa  105  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 
182 aa  105  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
190 aa  104  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2834  NUDIX hydrolase  39.05 
 
 
169 aa  103  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  34.16 
 
 
178 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  38.67 
 
 
180 aa  103  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  29.89 
 
 
177 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1886  NUDIX hydrolase  42.33 
 
 
172 aa  102  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.556059 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  33.33 
 
 
185 aa  102  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 
180 aa  102  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 
208 aa  102  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 
180 aa  102  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  38.67 
 
 
189 aa  101  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
180 aa  100  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 
176 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 
179 aa  100  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 
169 aa  100  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0268  NUDIX hydrolase  42.04 
 
 
165 aa  100  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.880251  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1429  NUDIX hydrolase  40.51 
 
 
176 aa  100  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.742876  normal  0.0486947 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
281 aa  99.8  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  42.34 
 
 
173 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 
173 aa  99  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 
184 aa  99  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
173 aa  98.2  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 
172 aa  98.2  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 
184 aa  98.2  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2211  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 
164 aa  97.8  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 
177 aa  97.8  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
173 aa  97.4  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 
203 aa  97.1  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 
178 aa  96.7  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1768  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
175 aa  96.7  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00835912  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1537  MutT/nudix family protein  36.52 
 
 
184 aa  95.5  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.652785  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
171 aa  95.9  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  39.76 
 
 
207 aa  94.7  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1507  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
201 aa  94.7  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.694951  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  30.3 
 
 
187 aa  94.7  7e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  39.34 
 
 
176 aa  94.4  8e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  35.36 
 
 
199 aa  94.4  8e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  37.09 
 
 
199 aa  92.8  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  39.46 
 
 
180 aa  93.2  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0830  NUDIX hydrolase  38.85 
 
 
177 aa  93.2  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.66661  normal  0.255619 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1336  NUDIX hydrolase  41.46 
 
 
171 aa  93.2  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.723792 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  37.7 
 
 
176 aa  92.8  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3241  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
200 aa  92  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 
192 aa  92  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0604  MutT/nudix family protein  36.09 
 
 
182 aa  91.7  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 
203 aa  91.3  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  32.76 
 
 
205 aa  90.5  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 
175 aa  90.5  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 
183 aa  90.5  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>