298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2250 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2250  recombination protein F  100 
 
 		 387 aa  760    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.122677 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  55.65 
 
 		 371 aa  396  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  54.31 
 
 		 384 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3391  recombination protein F  57.1 
 
 		 376 aa  364  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1725  recombination protein F  54.38 
 
 		 390 aa  360  2e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2248  recombination protein F  60.05 
 
 		 377 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1094  recombination protein F  55.41 
 
 		 380 aa  349  4e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1123  recombination protein F  55.41 
 
 		 380 aa  349  4e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16931  recombination protein F  45.71 
 
 		 352 aa  266  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.919518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20191  recombination protein F  43.87 
 
 		 348 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1145  recombination protein F  43.87 
 
 		 348 aa  262  8e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  39.2 
 
 		 374 aa  246  4e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0394  recombination protein F  46.93 
 
 		 364 aa  246  4.9999999999999997e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  37.74 
 
 		 360 aa  246  6.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  36.96 
 
 		 369 aa  245  9e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  39.77 
 
 		 369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  39.89 
 
 		 372 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  39.35 
 
 		 374 aa  243  3.9999999999999997e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  39.77 
 
 		 366 aa  243  5e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  37.89 
 
 		 374 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  36.29 
 
 		 373 aa  239  5e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  37.4 
 
 		 374 aa  238  2e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  32.52 
 
 		 361 aa  237  3e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  32.52 
 
 		 361 aa  237  3e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  38.61 
 
 		 373 aa  237  3e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  36.93 
 
 		 370 aa  235  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  36.93 
 
 		 370 aa  235  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1935  recombination protein F  48.28 
 
 		 353 aa  233  3e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  35.29 
 
 		 375 aa  233  6e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  35.29 
 
 		 375 aa  233  6e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  35.29 
 
 		 375 aa  233  6e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  35.56 
 
 		 375 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  35.56 
 
 		 375 aa  232  9e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  35.03 
 
 		 375 aa  230  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  35.03 
 
 		 375 aa  230  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  35.03 
 
 		 375 aa  230  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  35.03 
 
 		 375 aa  230  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  35.03 
 
 		 375 aa  229  8e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  35.95 
 
 		 371 aa  228  1e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.23 
 
 		 386 aa  222  9e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  36.22 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  35.41 
 
 		 375 aa  218  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  38.34 
 
 		 371 aa  216  5e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.39 
 
 		 372 aa  216  5e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  37.1 
 
 		 371 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  39.54 
 
 		 392 aa  211  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.49 
 
 		 364 aa  209  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  34.5 
 
 		 365 aa  208  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  33.04 
 
 		 362 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  34.22 
 
 		 364 aa  206  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  36.19 
 
 		 365 aa  204  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00040  DNA replication and repair protein RecF  36.25 
 
 		 390 aa  202  9e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17601  putative DNA repair and genetic recombination protein RecF  35.47 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22781  recombination protein F  46.09 
 
 		 352 aa  200  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  30.89 
 
 		 364 aa  199  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  36.53 
 
 		 359 aa  198  1.0000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0003  recombination protein F  35.03 
 
 		 368 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00792918  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0003  DNA replication and repair protein RecF  36.13 
 
 		 397 aa  196  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.46 
 
 		 359 aa  194  3e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  35.29 
 
 		 370 aa  194  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.4 
 
 		 381 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321306  normal  0.933031 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0004  recombination protein F  36.54 
 
 		 376 aa  189  7e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366352  unclonable  0.0000000175389 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.77 
 
 		 377 aa  189  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00040  recombination protein F  36.96 
 
 		 390 aa  189  9e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000332989  normal  0.373412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  34.26 
 
 		 398 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  37.18 
 
 		 370 aa  186  6e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17801  putative DNA repair and genetic recombination protein RecF  34.72 
 
 		 297 aa  186  7e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.172283  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.52 
 
 		 420 aa  185  9e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000011529  hitchhiker  0.000000444236 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  36.76 
 
 		 369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00030  recF protein  35.83 
 
 		 378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.172429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2450  DNA replication and repair protein RecF  35.83 
 
 		 366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.38 
 
 		 378 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  35.8 
 
 		 371 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.74 
 
 		 376 aa  183  6e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.35 
 
 		 399 aa  182  8.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  36.11 
 
 		 401 aa  182  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0004  recombination protein F  34.17 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0716162 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0003  DNA replication and repair protein RecF  37.3 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0004  recombination protein F  36.46 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000897119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  37 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0004  recombination protein F  34.17 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0005  recombination protein F  36.34 
 
 		 377 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000288317  hitchhiker  0.00404548 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0012  recombination protein F  34.17 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121144 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.49 
 
 		 380 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0003  DNA replication and repair protein RecF  36 
 
 		 360 aa  180  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1665  DNA replication and repair protein RecF  32.43 
 
 		 297 aa  180  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0004  recombination protein F  36.9 
 
 		 377 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0533102  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.75 
 
 		 397 aa  179  5.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.37 
 
 		 398 aa  179  8e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0004  recombination protein F  33.33 
 
 		 420 aa  179  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  36.03 
 
 		 382 aa  178  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0004  DNA replication and repair protein RecF  36.01 
 
 		 391 aa  178  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00428915 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00040  DNA replication and repair protein RecF  34.79 
 
 		 414 aa  177  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.89 
 
 		 363 aa  175  9.999999999999999e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  33.78 
 
 		 401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0004  recombination protein F  32.79 
 
 		 386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187663 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17641  putative DNA repair and genetic recombination protein RecF  35.34 
 
 		 265 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.674364  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0005  Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway)- like protein  32.43 
 
 		 390 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  37.11 
 
 		 371 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2214  DNA replication and repair protein RecF  35.28 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>