More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2231 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  100 
 
 		 210 aa  422  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  68.57 
 
 		 210 aa  308  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1293  50S ribosomal protein L4  71.43 
 
 		 210 aa  308  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000205733  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  65.71 
 
 		 210 aa  297  7e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  65.38 
 
 		 211 aa  294  6e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  65.38 
 
 		 211 aa  294  6e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  63.64 
 
 		 212 aa  290  1e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  63.46 
 
 		 210 aa  281  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23031  50S ribosomal protein L4  57.42 
 
 		 211 aa  254  8e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16771  50S ribosomal protein L4  58.37 
 
 		 211 aa  252  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0375  50S ribosomal protein L4  59.33 
 
 		 211 aa  251  4.0000000000000004e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1956  50S ribosomal protein L4  57.42 
 
 		 211 aa  248  5e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20021  50S ribosomal protein L4  54.55 
 
 		 212 aa  242  3e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1128  50S ribosomal protein L4  54.55 
 
 		 211 aa  241  6e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17391  50S ribosomal protein L4  56 
 
 		 210 aa  239  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17641  50S ribosomal protein L4  56 
 
 		 210 aa  239  2e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1649  50S ribosomal protein L4  56 
 
 		 210 aa  238  5e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17481  50S ribosomal protein L4  55.5 
 
 		 210 aa  237  9e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.533381  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  47.85 
 
 		 207 aa  194  5.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  47.39 
 
 		 207 aa  194  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40690  Plastid ribosomal protein L4 large ribosomal subunit  47.12 
 
 		 251 aa  192  2e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  46.41 
 
 		 207 aa  191  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  46.41 
 
 		 207 aa  191  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  45.24 
 
 		 206 aa  191  7e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  46.41 
 
 		 207 aa  191  7e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  46.41 
 
 		 207 aa  191  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  46.41 
 
 		 207 aa  191  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  46.41 
 
 		 207 aa  191  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  46.41 
 
 		 207 aa  191  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  46.41 
 
 		 207 aa  191  7e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  46.41 
 
 		 207 aa  191  7e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  46.41 
 
 		 207 aa  191  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  47.12 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  47.87 
 
 		 207 aa  189  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  47.87 
 
 		 207 aa  189  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  45.93 
 
 		 207 aa  187  8e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  45.45 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  53.63 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  46.89 
 
 		 207 aa  185  4e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  45.89 
 
 		 206 aa  185  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  45.45 
 
 		 207 aa  184  8e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  43.87 
 
 		 206 aa  182  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  44.5 
 
 		 204 aa  180  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  44.5 
 
 		 204 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  43.58 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  43.54 
 
 		 206 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  46.38 
 
 		 206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  45.59 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  47.52 
 
 		 209 aa  178  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  42.86 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  44.12 
 
 		 208 aa  177  8e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  41.71 
 
 		 208 aa  175  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  43.75 
 
 		 206 aa  175  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  44.02 
 
 		 205 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  41.23 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  44.71 
 
 		 207 aa  170  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  43.48 
 
 		 207 aa  170  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  43.41 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  43 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  44.83 
 
 		 206 aa  167  8e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  42.58 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  42.51 
 
 		 207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  45.36 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  43.2 
 
 		 209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0080  50S ribosomal protein L4  44.06 
 
 		 206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186923 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  40.19 
 
 		 207 aa  162  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  43.15 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  42.11 
 
 		 207 aa  161  5.0000000000000005e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0857  50S ribosomal protein L4  43 
 
 		 205 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  39.02 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  42.33 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0627  ribosomal protein L4  44.32 
 
 		 200 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000698865  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4547  50S ribosomal protein L4  44.32 
 
 		 200 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0714588  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0961  50S ribosomal protein L4  44.62 
 
 		 204 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000392469  hitchhiker  0.00000164794 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  45.56 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  46.45 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  43.89 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5078  50S ribosomal protein L4  43.24 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647229  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  41.87 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000129639  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05720  50S ribosomal protein L4  40.1 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316206  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4275  50S ribosomal protein L4  43.3 
 
 		 201 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000159231  unclonable  0.00000000000448849 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0225  ribosomal protein L4/L1e  51.52 
 
 		 210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0455  50S ribosomal protein L4  43.78 
 
 		 200 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.035261  unclonable  0.000000191468 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0485  50S ribosomal protein L4  43.78 
 
 		 200 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00632251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4748  50S ribosomal protein L4  43.78 
 
 		 200 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000074471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0422  50S ribosomal protein L4  43.28 
 
 		 202 aa  155  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00655238  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0488  50S ribosomal protein L4  43.78 
 
 		 200 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114619  normal  0.070368 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2645  50S ribosomal protein L4  38.16 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264538  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4506  ribosomal protein L4/L1e  43.5 
 
 		 292 aa  153  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0459  50S ribosomal protein L4  42.36 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  46.2 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0720  50S ribosomal protein L4  44.75 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000427281  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0370  50S ribosomal protein L4  44.63 
 
 		 201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0394  ribosomal protein L4/L1e  44.13 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000162947  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3635  50S ribosomal protein L4  44.13 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871014  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3806  50S ribosomal protein L4  44.13 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000172532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3513  50S ribosomal protein L4  44.13 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109628  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3743  50S ribosomal protein L4  44.13 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.521499  normal  0.0176443 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3614  50S ribosomal protein L4  44.13 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000161283  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3635  50S ribosomal protein L4  44.13 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00226471  normal  0.236826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>