More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2225 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  100 
 
 
142 aa  288  2e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23091  50S ribosomal protein L16  79.72 
 
 
158 aa  238  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17581  50S ribosomal protein L16  76.22 
 
 
160 aa  236  8e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17331  50S ribosomal protein L16  79.56 
 
 
160 aa  236  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.613797  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17421  50S ribosomal protein L16  79.56 
 
 
160 aa  236  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16711  50S ribosomal protein L16  82.09 
 
 
179 aa  234  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1643  50S ribosomal protein L16  78.1 
 
 
160 aa  234  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  82.98 
 
 
141 aa  233  8e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19961  50S ribosomal protein L16  77.7 
 
 
161 aa  233  9e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.64825  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1122  50S ribosomal protein L16  77.7 
 
 
161 aa  233  9e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  81.56 
 
 
142 aa  232  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0369  50S ribosomal protein L16  76.92 
 
 
158 aa  232  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  81.02 
 
 
140 aa  232  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1962  50S ribosomal protein L16  76.92 
 
 
158 aa  229  7.000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  81.16 
 
 
139 aa  229  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  76.81 
 
 
137 aa  222  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  76.81 
 
 
139 aa  219  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  76.81 
 
 
139 aa  219  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  74.26 
 
 
144 aa  215  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  74.07 
 
 
144 aa  209  7e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  74.07 
 
 
144 aa  209  7e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  69.72 
 
 
144 aa  209  9e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  71.01 
 
 
145 aa  208  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  71.01 
 
 
145 aa  208  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  68.97 
 
 
144 aa  206  7e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  69.72 
 
 
144 aa  206  9e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  68.31 
 
 
145 aa  206  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  69.63 
 
 
142 aa  205  1e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  69.12 
 
 
147 aa  204  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0687  50S ribosomal protein L16  69.01 
 
 
140 aa  204  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  69.85 
 
 
151 aa  204  5e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  68.31 
 
 
141 aa  202  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  69.34 
 
 
145 aa  202  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2326  50S ribosomal protein L16  64.08 
 
 
144 aa  201  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000195214  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  71.11 
 
 
139 aa  199  8e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0633  50S ribosomal protein L16  68.15 
 
 
140 aa  199  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966771  hitchhiker  0.00000000446584 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0458  50S ribosomal protein L16  69.85 
 
 
149 aa  199  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100115  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0118  50S ribosomal protein L16  66.2 
 
 
144 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312557  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0481  50S ribosomal protein L16  69.85 
 
 
149 aa  198  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.663076  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  68.89 
 
 
140 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0940  50S ribosomal protein L16  68.15 
 
 
140 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00197835  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3321  50S ribosomal protein L16  68.15 
 
 
140 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000147904 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2171  ribosomal protein L16  68.09 
 
 
140 aa  198  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.501834  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3660  50S ribosomal protein L16  68.15 
 
 
145 aa  197  3.9999999999999996e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506256  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  67.15 
 
 
138 aa  196  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1233  50S ribosomal protein L16  65 
 
 
139 aa  195  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0112  50S ribosomal protein L16  63.38 
 
 
144 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000501448  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1074  50S ribosomal protein L16  66.67 
 
 
140 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000319005  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  68.89 
 
 
144 aa  193  6e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1918  50S ribosomal protein L16  64.96 
 
 
138 aa  193  6e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.573905 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5188  50S ribosomal protein L16  63.38 
 
 
144 aa  193  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000330931  unclonable  1.07151e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0138  50S ribosomal protein L16  63.38 
 
 
144 aa  193  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0117  50S ribosomal protein L16  63.38 
 
 
144 aa  193  7e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000995896  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0117  50S ribosomal protein L16  63.38 
 
 
144 aa  193  7e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000580753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0113  50S ribosomal protein L16  63.38 
 
 
144 aa  193  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.719700000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0111  50S ribosomal protein L16  63.38 
 
 
144 aa  193  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0117  50S ribosomal protein L16  63.38 
 
 
144 aa  193  7e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167847  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0148  50S ribosomal protein L16  63.38 
 
 
144 aa  193  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0129  50S ribosomal protein L16  63.38 
 
 
144 aa  193  7e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.87351e-62 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  68.15 
 
 
139 aa  193  8.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0222  50S ribosomal protein L16  66.21 
 
 
144 aa  192  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000752115  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  67.86 
 
 
139 aa  192  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0111  50S ribosomal protein L16  63.38 
 
 
144 aa  192  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000578104  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0715  50S ribosomal protein L16  67.15 
 
 
137 aa  192  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.77301  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0405  ribosomal protein L16  67.86 
 
 
145 aa  192  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2222  50S ribosomal protein L16  67.41 
 
 
139 aa  192  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157972  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1353  50S ribosomal protein L16  65 
 
 
140 aa  191  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  68.15 
 
 
139 aa  190  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0293  50S ribosomal protein L16  71.11 
 
 
143 aa  190  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00638417  normal  0.0397052 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2057  50S ribosomal protein L16  68.15 
 
 
139 aa  190  6e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00129703  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0232  50S ribosomal protein L16  65.19 
 
 
143 aa  190  6e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0708  50S ribosomal protein L16  60.56 
 
 
141 aa  190  7e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000940858  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3155  50S ribosomal protein L16  65.93 
 
 
140 aa  189  9e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.647303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0609  ribosomal protein L16  65.19 
 
 
140 aa  189  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.817649 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1939  50S ribosomal protein L16  65.19 
 
 
138 aa  189  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2416  50S ribosomal protein L16  68.15 
 
 
139 aa  189  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0283  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 
138 aa  188  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000045602  normal  0.0248702 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1940  50S ribosomal protein L16  64.44 
 
 
138 aa  188  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0274  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 
138 aa  188  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000119561  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2025  50S ribosomal protein L16  64.44 
 
 
138 aa  188  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.755365  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23400  LSU ribosomal protein L16P  64.79 
 
 
143 aa  188  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000203395  hitchhiker  0.00000101059 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09930  LSU ribosomal protein L16P  65.96 
 
 
140 aa  187  2.9999999999999997e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.11543  hitchhiker  0.0000034816 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3017  50S ribosomal protein L16  61.97 
 
 
151 aa  187  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00890597  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0256  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 
138 aa  187  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00173139  normal  0.0172892 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3454  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 
138 aa  187  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000581922  decreased coverage  0.00396929 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2752  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 
138 aa  187  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000962733  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0334  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 
138 aa  187  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000896805  normal  0.0198335 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0355  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 
138 aa  187  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000176857  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0190  50S ribosomal protein L16  64.23 
 
 
140 aa  186  8e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.307321 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1860  50S ribosomal protein L16  64.79 
 
 
141 aa  186  8e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0761083  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2148  50S ribosomal protein L16  68.89 
 
 
138 aa  186  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0586575  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3797  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 
138 aa  185  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3485  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 
138 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00369776  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2625  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 
138 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.623647  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3769  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 
138 aa  185  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000165417  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3061  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 
138 aa  185  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000117854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1931  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 
138 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000246201  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3310  50S ribosomal protein L16  63.24 
 
 
138 aa  185  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000336027  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3739  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 
138 aa  185  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3162  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 
138 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000364503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>