21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2135 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2135  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  455  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.392364  normal  0.325855 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0883  hypothetical protein  45.21 
 
 
220 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.878941  hitchhiker  0.00169245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0475  hypothetical protein  43.13 
 
 
227 aa  190  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.770893  normal  0.0933349 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3744  hypothetical protein  37.67 
 
 
229 aa  189  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.111036 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1910  hypothetical protein  39.52 
 
 
234 aa  188  8e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0310  hypothetical protein  40.28 
 
 
234 aa  175  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.132673 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4379  hypothetical protein  37.98 
 
 
233 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4441  hypothetical protein  37.22 
 
 
233 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.19207 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1830  hypothetical protein  37.68 
 
 
218 aa  145  3e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0825  hypothetical protein  36.41 
 
 
219 aa  141  8e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10371  hypothetical protein  33.01 
 
 
212 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264953  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10371  hypothetical protein  32.04 
 
 
213 aa  136  2e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0967  hypothetical protein  31.37 
 
 
213 aa  135  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13951  hypothetical protein  35.44 
 
 
218 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.104858 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10601  hypothetical protein  32.86 
 
 
215 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0378  hypothetical protein  32.86 
 
 
215 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.308219  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09081  hypothetical protein  32.04 
 
 
214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09341  hypothetical protein  31.4 
 
 
214 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.15373  hitchhiker  0.0000911335 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_10386  predicted protein  29.61 
 
 
198 aa  102  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.679286  normal  0.383918 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_7373  predicted protein  29.61 
 
 
198 aa  102  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.479255  hitchhiker  0.00736413 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49633  predicted protein  25.36 
 
 
332 aa  60.8  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>