More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2111 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  100 
 
 
302 aa  596  1e-169  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  63.01 
 
 
297 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  62.2 
 
 
298 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  63.01 
 
 
297 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  66.1 
 
 
297 aa  371  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  62.8 
 
 
302 aa  372  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  60.27 
 
 
311 aa  360  1e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  57.05 
 
 
303 aa  329  3e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18441  ROK family protein  57.58 
 
 
304 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0926  sugar kinase  58.28 
 
 
297 aa  280  2e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1025  sugar kinase  56.31 
 
 
302 aa  278  6e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0410056  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  32.7 
 
 
323 aa  166  4e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  39.62 
 
 
318 aa  166  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  28.09 
 
 
313 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  34.77 
 
 
319 aa  160  3e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  33.87 
 
 
312 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  35.02 
 
 
342 aa  155  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  34.73 
 
 
314 aa  155  7e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  34.73 
 
 
314 aa  155  7e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  33.44 
 
 
313 aa  155  9e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1636  transcriptional regulator/sugar kinase  35.1 
 
 
300 aa  154  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.582275  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  32.92 
 
 
347 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  35.84 
 
 
303 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  35.8 
 
 
332 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  36.58 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  34.19 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  31.09 
 
 
316 aa  145  8.000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  29.3 
 
 
317 aa  145  1e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  34.82 
 
 
327 aa  143  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  34.82 
 
 
327 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  34.82 
 
 
327 aa  143  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  34.82 
 
 
327 aa  143  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  33.87 
 
 
327 aa  143  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  34.82 
 
 
327 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  33.76 
 
 
312 aa  143  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  34.82 
 
 
327 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  34.82 
 
 
327 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  35.6 
 
 
352 aa  143  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0384  ROK family protein  32.87 
 
 
292 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  34.87 
 
 
325 aa  142  5e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0398  ROK family protein  32.87 
 
 
292 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  32.28 
 
 
322 aa  142  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  33.78 
 
 
302 aa  142  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  34.82 
 
 
327 aa  142  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  31.49 
 
 
315 aa  142  9e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  31.49 
 
 
315 aa  142  9e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  32.26 
 
 
321 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  34.19 
 
 
327 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  34.19 
 
 
327 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  32.87 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0512  ROK family protein  31.14 
 
 
292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1094  ROK family protein  33.33 
 
 
332 aa  140  3e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000124678  hitchhiker  0.000000000129961 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0442  ROK family protein  32.18 
 
 
292 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  34.42 
 
 
315 aa  139  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2372  ROK family protein  36.22 
 
 
332 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.26662  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  32.13 
 
 
308 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  33.23 
 
 
321 aa  139  6e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0375  ROK family protein; glucokinase  32.18 
 
 
292 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1643  glucokinase  27.76 
 
 
313 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  30.82 
 
 
299 aa  138  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0463  ROK family protein  31.49 
 
 
292 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  35.69 
 
 
306 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0372  ROK family protein; glucokinase  32.18 
 
 
292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  32.45 
 
 
300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  34.47 
 
 
300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  35.69 
 
 
313 aa  136  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  32.18 
 
 
292 aa  136  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6585  ROK family protein  30.86 
 
 
278 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  35.39 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  31.31 
 
 
322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  33.33 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  29.52 
 
 
396 aa  133  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0329  ROK family glucokinase  32.25 
 
 
312 aa  133  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  35.29 
 
 
313 aa  133  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  30.72 
 
 
321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0770  glucose kinase  31.43 
 
 
322 aa  133  5e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000145403  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  31.63 
 
 
321 aa  132  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  36.54 
 
 
314 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  36.98 
 
 
361 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7038  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  34.13 
 
 
315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2184  ROK family protein  33.75 
 
 
328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000268105  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  33.44 
 
 
317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  31.27 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1875  glucokinase  30.23 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.173781  hitchhiker  0.00131381 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4328  ROK family protein  30.07 
 
 
276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  35.14 
 
 
314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0562  ROK family protein  28.9 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0661  ROK family protein  35.12 
 
 
321 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  31.97 
 
 
323 aa  126  4.0000000000000003e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  29.45 
 
 
317 aa  126  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  30.42 
 
 
396 aa  125  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  35.58 
 
 
312 aa  125  8.000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  31.01 
 
 
318 aa  125  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  28.34 
 
 
317 aa  125  1e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0335  ROK family protein  34.78 
 
 
327 aa  125  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  32.8 
 
 
314 aa  125  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4775  ROK family protein  36.9 
 
 
321 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  31.46 
 
 
314 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2015  ROK family protein  33.33 
 
 
330 aa  124  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.217755 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  28.76 
 
 
321 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>