More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2072 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  100 
 
 
207 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  57.5 
 
 
223 aa  228  3e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  57.73 
 
 
248 aa  224  6e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  60.77 
 
 
246 aa  224  8e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  64.58 
 
 
242 aa  201  5e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  54.59 
 
 
247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  53.19 
 
 
286 aa  194  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  46.19 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  54.59 
 
 
261 aa  188  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  54.59 
 
 
261 aa  188  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  50.24 
 
 
237 aa  188  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  50.29 
 
 
259 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  48.26 
 
 
225 aa  182  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  56.69 
 
 
224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  56.34 
 
 
239 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  57.35 
 
 
239 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  51.25 
 
 
239 aa  175  4e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00151  heat shock protein GrpE  56.62 
 
 
239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  40.68 
 
 
274 aa  134  7.000000000000001e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  47.5 
 
 
213 aa  130  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  43.67 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  39.31 
 
 
225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  35.59 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  42.11 
 
 
204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  43.45 
 
 
192 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  38.73 
 
 
190 aa  112  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  35.33 
 
 
224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  34.54 
 
 
231 aa  112  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  34.29 
 
 
188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  34.29 
 
 
188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  34.29 
 
 
188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  34.29 
 
 
188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  34.29 
 
 
188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  34.5 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  33.55 
 
 
226 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  34.29 
 
 
188 aa  109  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  34.29 
 
 
188 aa  109  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  37.57 
 
 
210 aa  107  9.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  39.13 
 
 
208 aa  107  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  39.13 
 
 
208 aa  107  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  40.31 
 
 
197 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  35.53 
 
 
192 aa  106  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  36.18 
 
 
198 aa  106  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  33.14 
 
 
188 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  36.79 
 
 
206 aa  106  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  30.96 
 
 
225 aa  106  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  37.06 
 
 
221 aa  105  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  35.18 
 
 
204 aa  104  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  35.54 
 
 
260 aa  104  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  36.71 
 
 
204 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  41.54 
 
 
195 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  40.91 
 
 
210 aa  103  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  43.94 
 
 
202 aa  102  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  37.31 
 
 
198 aa  102  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  37.06 
 
 
181 aa  101  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  40.62 
 
 
208 aa  101  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  41.79 
 
 
194 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  36.73 
 
 
191 aa  99.8  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  38.97 
 
 
179 aa  99.4  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  35.86 
 
 
211 aa  97.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  39.85 
 
 
189 aa  97.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  34.19 
 
 
207 aa  97.1  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  37.27 
 
 
200 aa  96.3  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0259  GrpE protein  37.98 
 
 
205 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0957161  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  38.41 
 
 
174 aa  94.4  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  33.33 
 
 
265 aa  94.4  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2004  GrpE protein  36.36 
 
 
156 aa  93.2  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154374  normal  0.256466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6904  GrpE protein  36.42 
 
 
185 aa  93.6  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150675  normal  0.298497 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  40.15 
 
 
199 aa  92.8  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  34.67 
 
 
189 aa  92.4  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1583  GrpE protein  33.5 
 
 
206 aa  92  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.852741  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1423  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)-like  35.96 
 
 
215 aa  91.3  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0978  hypothetical protein  34.01 
 
 
205 aa  91.7  8e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.115351 
 
 
-
 
NC_002950  PG1775  grpE protein  36.42 
 
 
194 aa  91.3  9e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  33.57 
 
 
217 aa  91.3  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0635  GrpE protein  37.21 
 
 
209 aa  91.3  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.579743  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0113  GrpE protein  33.56 
 
 
299 aa  90.9  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0002175 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  35.59 
 
 
188 aa  90.9  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  34.51 
 
 
201 aa  90.9  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  35.47 
 
 
184 aa  90.9  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0463  GrpE protein  36.43 
 
 
215 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  34.29 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  33.57 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0474  GrpE protein  36.43 
 
 
215 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  38.35 
 
 
200 aa  89.7  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0450  GrpE protein  36.43 
 
 
215 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  35.23 
 
 
186 aa  89.4  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  34.29 
 
 
206 aa  89  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0674  grpE protein  33.12 
 
 
190 aa  88.6  6e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.04297  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0621  GrpE protein  38.1 
 
 
189 aa  88.6  6e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000112666  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  32.86 
 
 
206 aa  88.2  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1614  GrpE protein  36.42 
 
 
175 aa  88.2  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.245406  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  37.14 
 
 
178 aa  87.8  9e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  38.64 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3208  GrpE protein  31.55 
 
 
204 aa  87.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718226  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  32.26 
 
 
244 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  35.61 
 
 
181 aa  86.3  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1062  GrpE protein  37.58 
 
 
169 aa  86.3  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0506342  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  32.59 
 
 
243 aa  85.5  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  29.8 
 
 
218 aa  85.5  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>