47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2048 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0332  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  87.03 
 
 
737 aa  1306  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0306945  normal  0.0992407 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2048  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  100 
 
 
734 aa  1490  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.55767  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0402  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  84.89 
 
 
742 aa  1284  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.671863 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4668  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  87.14 
 
 
738 aa  1336  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.298458  normal  0.0126467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0399  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  84.69 
 
 
738 aa  1280  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.992775 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17271  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  77.55 
 
 
742 aa  1202  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4104  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  88.01 
 
 
742 aa  1314  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17021  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  77.42 
 
 
742 aa  1198  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16401  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  77.85 
 
 
742 aa  1205  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17151  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  77.55 
 
 
742 aa  1202  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2745  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  79.92 
 
 
746 aa  1204  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1615  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  77.15 
 
 
742 aa  1201  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.687689  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4670  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  85.58 
 
 
742 aa  1311  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.497119  normal  0.71822 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1083  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  77.28 
 
 
742 aa  1182  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2406  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  83 
 
 
741 aa  1256  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185378  hitchhiker  4.43533e-06 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2567  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  80.73 
 
 
742 aa  1212  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0839858  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19581  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  77.28 
 
 
742 aa  1182  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1994  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  86.7 
 
 
735 aa  1310  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.28805  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0546  photosystem I core protein PsaB  82.37 
 
 
743 aa  1244  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0256  photosystem I core protein PsaB  78.54 
 
 
742 aa  1182  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4143  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  88.01 
 
 
742 aa  1314  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00848687  normal  0.293188 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23471  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  74.57 
 
 
749 aa  1179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4669  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  45.62 
 
 
753 aa  592  1e-168  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.33052  normal  0.086374 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2405  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  46.21 
 
 
752 aa  595  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191664  hitchhiker  4.13722e-05 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0547  photosystem I core protein PsaA  45.14 
 
 
752 aa  589  1e-167  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483497  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2049  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  44.78 
 
 
763 aa  575  1e-163  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.986911  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0403  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  45.11 
 
 
751 aa  573  1e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.709622 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4671  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  44.59 
 
 
756 aa  572  1e-162  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4142  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  44.78 
 
 
754 aa  569  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0335436  normal  0.190714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4103  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  44.78 
 
 
754 aa  569  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17281  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  41.74 
 
 
767 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.72658  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17161  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  41.82 
 
 
767 aa  548  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1995  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  43.42 
 
 
767 aa  545  1e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1616  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  41.99 
 
 
767 aa  544  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.165391  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0331  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  43.02 
 
 
767 aa  538  1e-151  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.151933  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1082  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  41.45 
 
 
768 aa  538  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19571  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  42.06 
 
 
768 aa  538  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.300705  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17031  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  42.09 
 
 
760 aa  532  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23481  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  40.95 
 
 
776 aa  516  1e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.735278 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16391  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  40.32 
 
 
773 aa  506  1e-142  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.647233  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0219  photosystem P840 reaction center, large subunit  36.25 
 
 
731 aa  48.9  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118063  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1976  photosystem P840 reaction center, large subunit  36.25 
 
 
734 aa  48.5  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  3.29009e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2693  photosystem P840 reaction center, large subunit  36.25 
 
 
731 aa  48.1  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00010493  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0182  photosystem P840 reaction center, large subunit  35 
 
 
731 aa  47.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  1.0763e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0343  photosystem P840 reaction center, large subunit  35 
 
 
731 aa  47  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  2.49067e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0274  photosystem P840 reaction center, large subunit  33.75 
 
 
731 aa  45.8  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  5.80216e-08  unclonable  3.20304e-06 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0305  photosystem P840 reaction center, large subunit  33.75 
 
 
733 aa  45.8  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464493 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>