More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2028 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  100 
 
 
353 aa  724  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  49.86 
 
 
364 aa  371  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  50 
 
 
361 aa  357  2e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  48.89 
 
 
364 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  48.61 
 
 
364 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  48.18 
 
 
361 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  44.35 
 
 
360 aa  322  7e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  43.79 
 
 
355 aa  312  6e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  45.35 
 
 
373 aa  305  8e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1413  mannosyltransferase  35.23 
 
 
354 aa  233  4e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.953806  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01121  hypothetical protein  35.23 
 
 
354 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  38.28 
 
 
370 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  37.1 
 
 
373 aa  184  2e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  37.83 
 
 
370 aa  175  1e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  37.36 
 
 
366 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  35.32 
 
 
395 aa  167  3e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  41.03 
 
 
381 aa  164  2e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  34.7 
 
 
386 aa  163  4e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  33.7 
 
 
346 aa  162  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  33.7 
 
 
346 aa  162  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 
369 aa  162  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  33.97 
 
 
382 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  34.04 
 
 
434 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  36.04 
 
 
400 aa  157  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 
382 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  35.97 
 
 
408 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 
374 aa  154  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  34.69 
 
 
435 aa  154  3e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  32.73 
 
 
370 aa  149  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  31.54 
 
 
336 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.85845e-05 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
375 aa  149  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  32.01 
 
 
378 aa  149  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  35.47 
 
 
371 aa  147  4e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  1.12819e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0881  glycosyl transferase group 1  34 
 
 
381 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0507523  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  31.72 
 
 
380 aa  145  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  33.01 
 
 
378 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  31.79 
 
 
371 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  35.21 
 
 
384 aa  144  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  33.83 
 
 
420 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  31 
 
 
374 aa  143  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  34.71 
 
 
394 aa  141  2e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  33.89 
 
 
373 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  35.21 
 
 
376 aa  139  8e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2312  hypothetical protein  28.92 
 
 
353 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.167078  normal  0.0536505 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2425  hypothetical protein  28.92 
 
 
353 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.274223  hitchhiker  0.000381891 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  30.55 
 
 
437 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 
374 aa  138  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3229  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 
371 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453901  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  30.68 
 
 
351 aa  137  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  33.46 
 
 
394 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2211  protein RfbU  28.62 
 
 
353 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00229627  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
372 aa  137  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0051  glycosyl transferase group 1  33.83 
 
 
366 aa  135  1e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  34.83 
 
 
417 aa  135  1e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0049  glycosyl transferase group 1  33.83 
 
 
366 aa  135  1e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  36.78 
 
 
381 aa  134  2e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  34.09 
 
 
382 aa  134  2e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 
393 aa  135  2e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.85 
 
 
369 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  28.36 
 
 
375 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6016  glycosyl transferase group 1  32.54 
 
 
380 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  33.56 
 
 
340 aa  134  4e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  33.21 
 
 
1261 aa  133  4e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  26.8 
 
 
381 aa  132  6e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  28.68 
 
 
375 aa  132  7e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 
366 aa  132  8e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2314  protein RfbU  28.62 
 
 
353 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  decreased coverage  0.00611992 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.44 
 
 
361 aa  132  1e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0663  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 
433 aa  132  1e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.002459  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  33.33 
 
 
430 aa  132  1e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0939  glycosyl transferase, group 1  34.67 
 
 
381 aa  131  2e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.872922  normal  0.705324 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
394 aa  131  2e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 
395 aa  131  2e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0741  glycosyl transferase group 1  33.97 
 
 
435 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
343 aa  130  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  33.46 
 
 
428 aa  130  4e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 
385 aa  130  5e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  31.41 
 
 
383 aa  130  5e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  1.99281e-05 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 
366 aa  129  8e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 
431 aa  128  1e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  9.53773e-05 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2183  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 
370 aa  128  2e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
374 aa  128  2e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  30.71 
 
 
397 aa  127  2e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2932  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 
442 aa  127  2e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  31.29 
 
 
381 aa  127  2e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0735  glycosyl transferase, group 1  31.1 
 
 
376 aa  127  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3164  glycosyl transferase group 1  32.41 
 
 
442 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6340  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
377 aa  127  4e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  28.21 
 
 
381 aa  127  4e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  33.46 
 
 
423 aa  126  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0427  glycosyl transferase, group 1  29.97 
 
 
376 aa  126  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0724204  normal  0.713037 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
398 aa  126  6e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  31.87 
 
 
443 aa  126  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  32.71 
 
 
381 aa  125  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  34.24 
 
 
389 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  30.52 
 
 
376 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  29.32 
 
 
374 aa  125  1e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 
393 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
850 aa  125  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 
366 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>