80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2013 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2013  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  346  1e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.57132 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3347  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  51.9 
 
 		 160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52168  normal  0.409524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2755  WD40 domain-containing protein  51.9 
 
 		 160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4016  WD40 domain protein beta Propeller  52.63 
 
 		 169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.392857 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0522  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  46.75 
 
 		 172 aa  160  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0057  WD40 domain-containing protein  44.85 
 
 		 175 aa  151  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3979  hypothetical protein  37.96 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4021  WD40 domain protein beta Propeller  37.96 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2014  hypothetical protein  43.75 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.598603 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3466  WD40 domain protein beta Propeller  37.89 
 
 		 190 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2651  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  37.89 
 
 		 190 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.136026 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0056  WD40 domain-containing protein  39.02 
 
 		 184 aa  104  8e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4178  WD40 domain protein beta Propeller  41.41 
 
 		 197 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4138  WD40 domain protein beta Propeller  41.41 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0520  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  36.88 
 
 		 186 aa  99.8  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.118512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4015  WD40 domain protein beta Propeller  38.12 
 
 		 174 aa  94  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.482104 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2264  hypothetical protein  35.71 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0416  hypothetical protein  34.29 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03171  hypothetical protein  30.09 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.954075 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  37.18 
 
 		 441 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1631  WD40 domain-containing protein  42.47 
 
 		 347 aa  51.2  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  35.71 
 
 		 450 aa  50.8  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.41 
 
 		 430 aa  48.5  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  27.06 
 
 		 1279 aa  48.5  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  37.61 
 
 		 428 aa  48.5  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  32.14 
 
 		 446 aa  48.1  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0446  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  23.87 
 
 		 340 aa  47.8  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  28.32 
 
 		 444 aa  47.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  28.32 
 
 		 450 aa  47.8  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2260  WD40 domain-containing protein  36.79 
 
 		 348 aa  47.8  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259667 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  28.32 
 
 		 450 aa  47.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  28.32 
 
 		 449 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  26.55 
 
 		 450 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.88 
 
 		 407 aa  47.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  31.62 
 
 		 428 aa  47  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  37.89 
 
 		 422 aa  46.6  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  27.43 
 
 		 449 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  37.89 
 
 		 422 aa  46.6  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  35.71 
 
 		 432 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109745  hitchhiker  0.0000339249 
 
 
-
 
NC_002620  TC0888  translocation protein TolB  26.75 
 
 		 426 aa  45.8  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  28.8 
 
 		 445 aa  45.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4536  translocation protein TolB  35.71 
 
 		 432 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  27.43 
 
 		 462 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  28.32 
 
 		 560 aa  45.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  33.33 
 
 		 445 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0924  WD40 domain protein beta Propeller  30.83 
 
 		 618 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0358135  normal  0.463223 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  32.17 
 
 		 427 aa  43.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0012  WD40 domain-containing protein  29.32 
 
 		 620 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  26.23 
 
 		 713 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.17 
 
 		 407 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  29.31 
 
 		 669 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0588  WD40 domain protein beta Propeller  29.52 
 
 		 439 aa  43.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000301748  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  26.79 
 
 		 450 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  30.94 
 
 		 1059 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2217  translocation protein TolB  29.93 
 
 		 436 aa  43.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  30.39 
 
 		 1028 aa  42.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1743  translocation protein TolB  29.86 
 
 		 421 aa  42.7  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00450172  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0010  WD40 domain-containing protein  29.79 
 
 		 560 aa  42.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.348529  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1569  WD40 domain-containing protein  29.55 
 
 		 449 aa  42.7  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  44.83 
 
 		 708 aa  42.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  28.81 
 
 		 424 aa  42  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  32.35 
 
 		 996 aa  42.4  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  30.22 
 
 		 432 aa  42.4  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  32.11 
 
 		 439 aa  42  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  33.33 
 
 		 442 aa  41.6  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  33.33 
 
 		 1111 aa  42  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0692  translocation protein TolB  32 
 
 		 417 aa  41.6  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00862547  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08230  WD40 domain protein beta Propeller  29.11 
 
 		 918 aa  41.6  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  28.67 
 
 		 444 aa  41.6  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  29.06 
 
 		 461 aa  41.6  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  35.38 
 
 		 615 aa  41.6  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  26.9 
 
 		 572 aa  41.2  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  29.41 
 
 		 436 aa  41.2  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  30.83 
 
 		 567 aa  41.2  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.31 
 
 		 428 aa  41.2  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0200  translocation protein TolB  25.89 
 
 		 399 aa  40.8  0.009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000701864  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  28.67 
 
 		 444 aa  40.8  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  31.65 
 
 		 448 aa  40.8  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  28.67 
 
 		 444 aa  40.8  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  39.39 
 
 		 316 aa  40.8  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>