More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2008 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2008  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  331  2e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1919  flavin reductase-like, FMN-binding  76.25 
 
 		 159 aa  260  4.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3170  flavin reductase domain protein FMN-binding  71.25 
 
 		 160 aa  254  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3504  flavin reductase domain protein FMN-binding  72.5 
 
 		 160 aa  254  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.507811  normal  0.0756522 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2602  flavin reductase domain protein FMN-binding  72.5 
 
 		 160 aa  254  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0643  flavin reductase domain protein FMN-binding  64.38 
 
 		 159 aa  221  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0543494  normal  0.644181 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1364  hypothetical protein  60.38 
 
 		 160 aa  202  1e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1114  hypothetical protein  59.75 
 
 		 160 aa  200  7e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14951  hypothetical protein  59.75 
 
 		 168 aa  198  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.431741 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08811  hypothetical protein  57.23 
 
 		 160 aa  193  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102678 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0917  hypothetical protein  58.39 
 
 		 162 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00504908  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09761  hypothetical protein  58.39 
 
 		 162 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.432138  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09651  hypothetical protein  58.39 
 
 		 162 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09781  hypothetical protein  58.39 
 
 		 162 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10001  hypothetical protein  56.6 
 
 		 160 aa  191  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.537095  normal  0.391839 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0327  hypothetical protein  56.6 
 
 		 160 aa  191  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217088  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2464  flavin reductase domain protein FMN-binding  55.62 
 
 		 159 aa  168  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0160  flavin reductase domain protein FMN-binding  51.25 
 
 		 159 aa  161  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0388  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  44.03 
 
 		 159 aa  144  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1253  flavin reductase-like, FMN-binding protein  39.29 
 
 		 164 aa  103  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.516374  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2731  flavin reductase-like domain-containing protein  37.41 
 
 		 164 aa  97.4  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.066131  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0162  flavin reductase-like protein  38.76 
 
 		 167 aa  91.7  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.48 
 
 		 174 aa  84  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 152 aa  83.6  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  32.31 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1643  flavin reductase-like protein  38.89 
 
 		 170 aa  80.9  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  31.41 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  30.82 
 
 		 430 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  31.91 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2966  flavin reductase domain protein FMN-binding  36 
 
 		 575 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  38.84 
 
 		 484 aa  79.7  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1034  flavin reductase domain-containing protein  32.47 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  30.13 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0666  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.04 
 
 		 575 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0685  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.04 
 
 		 575 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.25 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1857  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.67 
 
 		 574 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0693  flavin reductase domain-containing protein  36.43 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36317  predicted protein  32.54 
 
 		 588 aa  75.9  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 393 aa  75.5  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0873  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.11 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000143727  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.69 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  29.08 
 
 		 226 aa  74.7  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4700  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.83 
 
 		 179 aa  73.9  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.403241  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2695  flavin reductase domain-containing protein  36.75 
 
 		 178 aa  73.9  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2164  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0479  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.09 
 
 		 575 aa  73.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1163  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  35.46 
 
 		 582 aa  73.2  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2124  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.84 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5028  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.54 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296353  normal  0.178556 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.39 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.94 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5305  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.9 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6997  flavin reductase-like, FMN-binding protein  33.58 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974297 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0770  flavin reductase-like, FMN-binding  36.13 
 
 		 574 aa  72.8  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.97 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  29.79 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  29.79 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1255  flavin reductase domain-containing protein  37.04 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4081  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.77 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395144  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1802  flavin reductase-like, FMN-binding  35.34 
 
 		 574 aa  71.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  32.17 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  32.87 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4140  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  36.09 
 
 		 572 aa  71.2  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1439  flavin reductase-like, FMN-binding  34.59 
 
 		 579 aa  71.2  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0553  flavin reductase domain-containing protein  35.48 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2179  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.82 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.47 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1376  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  34.13 
 
 		 591 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0302  flavin reductase-like, FMN-binding  33.57 
 
 		 575 aa  69.7  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225736  normal  0.971222 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.29 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3806  flavin reductase domain-containing protein  34.26 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  30.87 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3429  flavin reductase domain-containing protein  32.35 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  30.87 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  30.87 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1803  flavin reductase-like, FMN-binding  35.29 
 
 		 570 aa  68.6  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  30.87 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  30.87 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  30.87 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  30.87 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  30.87 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1955  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.08 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0712  flavin reductase-like, FMN-binding  32.76 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1459  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.87 
 
 		 573 aa  67.8  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.91 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  31.58 
 
 		 204 aa  67.4  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2530  flavoprotein  34.04 
 
 		 582 aa  67  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.707378 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00571  flavoprotein  32.06 
 
 		 592 aa  67.4  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  29.01 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1781  flavin reductase-like, FMN-binding protein  35.61 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.160868  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3558  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.63 
 
 		 182 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2394  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.38 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00571453  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1335  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.17 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  29.45 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.91 
 
 		 330 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5120  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.16 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  32.12 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119390  Diflavin flavoprotein A 1-like protein  32.56 
 
 		 638 aa  65.5  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.254321  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1371  flavin reductase-like, FMN-binding  32.86 
 
 		 576 aa  65.1  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0697  flavin reductase-like, FMN-binding  31.4 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>