65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1997 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1997  high light-inducible protein  100 
 
 		 72 aa  146  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1831  high light inducible protein  63.64 
 
 		 83 aa  78.2  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0824  high light inducible protein  60 
 
 		 83 aa  77.4  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2542  hypothetical protein  55.22 
 
 		 70 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0155  hypothetical protein  57.58 
 
 		 94 aa  73.2  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5010  high light inducible protein  53.03 
 
 		 71 aa  67.8  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2916  high light inducible protein  52.86 
 
 		 72 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000194255  normal  0.0166899 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16041  putative high light inducible protein  55.32 
 
 		 50 aa  60.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16731  putative high light inducible protein  55.32 
 
 		 50 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16861  putative high light inducible protein  55.32 
 
 		 50 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04401  putative high light inducible protein  48.94 
 
 		 50 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16621  putative high light inducible protein  55.32 
 
 		 50 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0646927  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1575  putative high light inducible protein  55.32 
 
 		 50 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0608  putative high light inducible protein  51.06 
 
 		 50 aa  53.9  0.0000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131116  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2064  hypothetical protein  48.94 
 
 		 63 aa  53.5  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0330706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1013  putative high light inducible protein  48.94 
 
 		 50 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18831  putative high light inducible protein  48.94 
 
 		 50 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15981  high light inducible protein  42.19 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15821  high light inducible protein-like protein  42.19 
 
 		 68 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04211  high light inducible protein  46.43 
 
 		 69 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15711  high light inducible protein  45 
 
 		 68 aa  50.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1481  high light inducible protein-like  45 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12921  high light inducible protein  43.33 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.872444  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1510  high light inducible protein-like  43.33 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.513618  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1411  high light inducible protein  53.06 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11391  hypothetical protein  39.68 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.846337  hitchhiker  0.00367136 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08911  hypothetical protein  42.86 
 
 		 72 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0672  CAB/ELIP/HLIP-related protein  55 
 
 		 58 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17481  high light inducible protein  42.86 
 
 		 72 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.598336  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0691  HLIP; single helix LHC light protein  55 
 
 		 58 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000595991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3583  CAB/ELIP/HLIP-like protein  42.86 
 
 		 56 aa  47.4  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13181  hypothetical protein  40.62 
 
 		 103 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.655932  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13041  high light inducible protein  40.62 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1228  high light inducible protein-like  40.62 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0175  CAB/ELIP/HLIP-related protein  42.86 
 
 		 56 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000121153  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13581  hypothetical protein  39.68 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.168907 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0578  high light inducible protein hli7  39.68 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13191  hypothetical protein  39.68 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.271888 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04321  hypothetical protein  39.68 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.57079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0553  high light inducible protein hli7  39.68 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0403179  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0509  high light inducible protein hli7  39.68 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0577746  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12381  hypothetical protein  39.68 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.990126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0433  hypothetical protein  38.1 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0358562  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1715  high light inducible protein hli7  39.68 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1759  CAB/ELIP/HLIP-related protein  46 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  68.57 
 
 		 55 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.941002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2720  CAB/ELIP/HLIP-related protein  46.94 
 
 		 54 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.556008  hitchhiker  0.0000310202 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18061  hypothetical protein  40.98 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.782005 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0946  high light inducible protein hli7  40.98 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.124508  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2057  CAB/ELIP/HLIP-related protein  50 
 
 		 59 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519028 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0874  high intensity light-inducible lhc-like protein  50 
 
 		 47 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0847  CAB/ELIP/HLIP family protein  50 
 
 		 47 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2818  high light inducible protein  61.11 
 
 		 59 aa  43.5  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0112403  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3554  high light inducible protein  42.86 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2576  hypothetical protein  38.98 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.783641  normal  0.106998 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1980  CAB/ELIP/HLIP superfamily  56.41 
 
 		 46 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.741013 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  45.45 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1574  ferrochelatase  58.82 
 
 		 388 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0243  high light inducible polypeptide HliC  50 
 
 		 47 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.331677  normal  0.425613 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0886  high light inducible protein  54.29 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.139188  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2095  ferrochelatase  55.88 
 
 		 387 aa  41.2  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17411  high light inducible protein  54.29 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1910  CAB/ELIP/HLIP-related protein  50 
 
 		 56 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0846233  normal  0.275472 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11651  hypothetical protein  41.07 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.12269 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0415  high light inducible protein  50 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>