More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1978 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1978  thioredoxin  100 
 
 		 111 aa  230  6e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.274716  normal  0.21653 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1747  thioredoxin-related  46.08 
 
 		 128 aa  100  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.711938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  42.16 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3164  Thioredoxin domain protein  45.1 
 
 		 115 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2011  thioredoxin domain-containing protein  43.27 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0149  thioredoxin domain-containing protein  41.9 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.55638  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0032  Thioredoxin domain protein  44.55 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  44.9 
 
 		 108 aa  93.6  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  41.94 
 
 		 106 aa  93.6  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0030  thioredoxin domain protein  44.55 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  41 
 
 		 107 aa  93.6  9e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0459  Thioredoxin domain protein  48.04 
 
 		 114 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2121  Thioredoxin domain protein  42 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.427267 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  38.1 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  41.75 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  40.21 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  40.21 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  40.21 
 
 		 107 aa  92  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  40.21 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  41.24 
 
 		 105 aa  91.7  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  39 
 
 		 107 aa  91.3  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  42 
 
 		 108 aa  90.5  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  38.24 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  40 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  39.78 
 
 		 106 aa  90.1  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  40 
 
 		 107 aa  90.1  9e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  35.58 
 
 		 104 aa  90.1  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  35.35 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  38.61 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  38.38 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  48.75 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  37.25 
 
 		 107 aa  88.6  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  37.25 
 
 		 107 aa  88.6  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  41.18 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  37.25 
 
 		 107 aa  88.6  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  41.35 
 
 		 310 aa  88.2  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  37.11 
 
 		 106 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  39 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  38 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  38.14 
 
 		 106 aa  88.6  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  39.18 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  37.63 
 
 		 105 aa  87.8  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  38.38 
 
 		 104 aa  87.8  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  34.34 
 
 		 109 aa  87.4  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  40.86 
 
 		 110 aa  87.4  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  40.21 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  37.11 
 
 		 106 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  37.11 
 
 		 106 aa  87.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  37.14 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  39 
 
 		 109 aa  87.4  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  39 
 
 		 105 aa  87  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  35.35 
 
 		 108 aa  87  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0160  thioredoxin-related  38 
 
 		 111 aa  87  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  36.08 
 
 		 106 aa  86.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  37.11 
 
 		 106 aa  86.7  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  38.14 
 
 		 106 aa  86.7  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  40.38 
 
 		 280 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  35.92 
 
 		 125 aa  86.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  37.76 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  37.86 
 
 		 165 aa  86.3  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  36.73 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  37 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  37 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  37 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  35.71 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  39.78 
 
 		 109 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  36.08 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  36.08 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  36.73 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  37.25 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  37.25 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  37.62 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  37.62 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  37 
 
 		 107 aa  85.5  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  38.14 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  35.71 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  40 
 
 		 108 aa  84.7  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  39 
 
 		 108 aa  84.7  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  36 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  36.08 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  38.38 
 
 		 109 aa  84.3  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  36 
 
 		 148 aa  84  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  40.45 
 
 		 109 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  32.67 
 
 		 103 aa  84  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  39.78 
 
 		 109 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  39.78 
 
 		 109 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  36.36 
 
 		 108 aa  83.6  8e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  39.78 
 
 		 109 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  39 
 
 		 107 aa  83.6  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  39.81 
 
 		 282 aa  83.6  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  35.71 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  42.17 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  33.67 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  36.89 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  34 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  37.14 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  37.76 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2143  Thioredoxin domain protein  37 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  37.5 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  34 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>