More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1927 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 280 aa  573  1.0000000000000001e-162  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  68.1 
 
 		 282 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  68 
 
 		 278 aa  396  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  65.95 
 
 		 279 aa  384  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  64.77 
 
 		 281 aa  381  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  62.99 
 
 		 281 aa  371  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  63.35 
 
 		 281 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  67.5 
 
 		 280 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  58.62 
 
 		 407 aa  341  7e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  54.45 
 
 		 334 aa  300  2e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  51.07 
 
 		 277 aa  286  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  50.71 
 
 		 283 aa  275  7e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  50.71 
 
 		 323 aa  275  7e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  51.77 
 
 		 280 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  52.14 
 
 		 355 aa  271  1e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  51.79 
 
 		 368 aa  269  4e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  49.29 
 
 		 277 aa  265  8e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  49.82 
 
 		 284 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  47.52 
 
 		 284 aa  263  3e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  49.82 
 
 		 277 aa  261  6.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  52.31 
 
 		 279 aa  260  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  49.12 
 
 		 277 aa  260  2e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  48.41 
 
 		 292 aa  256  2e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  47.7 
 
 		 278 aa  254  9e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  44.72 
 
 		 284 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  44.72 
 
 		 284 aa  252  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  46.88 
 
 		 278 aa  252  5.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  48.21 
 
 		 279 aa  251  6e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  48.72 
 
 		 274 aa  251  7e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  49.82 
 
 		 278 aa  248  6e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  45.96 
 
 		 282 aa  246  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  46.83 
 
 		 287 aa  246  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  46.21 
 
 		 280 aa  243  1.9999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  44.68 
 
 		 278 aa  243  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  47.02 
 
 		 282 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  51.97 
 
 		 279 aa  240  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  45.88 
 
 		 278 aa  240  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  45.74 
 
 		 278 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  42.96 
 
 		 286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  46.48 
 
 		 278 aa  239  5e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  43.26 
 
 		 286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  43.62 
 
 		 286 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  43.26 
 
 		 286 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  45.55 
 
 		 277 aa  229  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  43.62 
 
 		 278 aa  228  6e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  43.57 
 
 		 284 aa  228  7e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  44.64 
 
 		 277 aa  226  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2471  diaminopimelate epimerase  43.6 
 
 		 309 aa  224  8e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  43.53 
 
 		 275 aa  225  8e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  43.53 
 
 		 275 aa  225  8e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3085  diaminopimelate epimerase  43.6 
 
 		 309 aa  224  8e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  42.81 
 
 		 275 aa  224  9e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  42.91 
 
 		 289 aa  224  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  43.53 
 
 		 275 aa  224  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  44.88 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  41.9 
 
 		 304 aa  223  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  44.48 
 
 		 276 aa  223  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  43.17 
 
 		 275 aa  223  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3102  diaminopimelate epimerase  42.91 
 
 		 309 aa  221  9e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  44.44 
 
 		 288 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3080  diaminopimelate epimerase  42.91 
 
 		 387 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6435  diaminopimelate epimerase  42.21 
 
 		 289 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  42.45 
 
 		 275 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  42.45 
 
 		 275 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  42.45 
 
 		 275 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  42.45 
 
 		 275 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  43.48 
 
 		 278 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  42.61 
 
 		 292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  42.31 
 
 		 292 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  42.27 
 
 		 315 aa  218  7e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  41.96 
 
 		 288 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  41.37 
 
 		 279 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  42.36 
 
 		 288 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  42.31 
 
 		 292 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  42.65 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  41.75 
 
 		 288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  42.67 
 
 		 299 aa  215  5e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2994  diaminopimelate epimerase  42.7 
 
 		 282 aa  215  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0384566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  43.36 
 
 		 287 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2809  diaminopimelate epimerase  42.03 
 
 		 275 aa  214  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.241517 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  41.67 
 
 		 288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3266  diaminopimelate epimerase  44.13 
 
 		 326 aa  213  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0214186 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  41.67 
 
 		 288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  40.57 
 
 		 290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  42.01 
 
 		 288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  41.67 
 
 		 288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  41.67 
 
 		 288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  41.67 
 
 		 288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  41.67 
 
 		 288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  41.67 
 
 		 288 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  41.52 
 
 		 283 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  42.51 
 
 		 286 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2542  diaminopimelate epimerase  43.01 
 
 		 277 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3739  diaminopimelate epimerase  46.21 
 
 		 278 aa  212  4.9999999999999996e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351695 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0197  diaminopimelate epimerase  41.52 
 
 		 289 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.925339  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  42.66 
 
 		 299 aa  212  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0899  diaminopimelate epimerase  41.58 
 
 		 294 aa  211  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5228  diaminopimelate epimerase  45.36 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  40.83 
 
 		 289 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  40.65 
 
 		 276 aa  211  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>