56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1883 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1883  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  484  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1214  GUN4 domain-containing protein  49.35 
 
 
237 aa  236  3e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4714  GUN4 domain protein  49.55 
 
 
256 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.322945 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3036  GUN4-like  42.55 
 
 
240 aa  221  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082563 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2558  GUN4 domain protein  46.81 
 
 
243 aa  218  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3548  GUN4 domain protein  46.81 
 
 
243 aa  218  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4959  GUN4 domain protein  43.5 
 
 
254 aa  218  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.543373 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4830  GUN4-like  47.84 
 
 
279 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0208918 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1199  hypothetical protein  43.59 
 
 
242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1271  hypothetical protein  40.6 
 
 
239 aa  172  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0137  hypothetical protein  40.33 
 
 
238 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.649821  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07221  hypothetical protein  39.3 
 
 
259 aa  171  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.262793 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07691  hypothetical protein  40.16 
 
 
238 aa  171  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.627035  normal  0.0617778 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09351  hypothetical protein  41.07 
 
 
239 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10071  hypothetical protein  43.08 
 
 
244 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.922133  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09361  hypothetical protein  41.26 
 
 
239 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16361  hypothetical protein  40.35 
 
 
238 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0876  hypothetical protein  40.19 
 
 
239 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.837911  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_10367  predicted protein  45.89 
 
 
146 aa  145  8.000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1053  GUN4 domain protein  34.36 
 
 
670 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0234472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4987  GUN4 domain protein  38.17 
 
 
336 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.691295 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4617  GUN4 domain protein  38.76 
 
 
393 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0355945 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3945  GUN4-like  39.02 
 
 
305 aa  90.1  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0311749 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0178  GUN4-like  38.93 
 
 
559 aa  88.6  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000497221  normal  0.66578 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1622  GUN4 domain protein  39.39 
 
 
170 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00881494 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4610  GUN4 domain protein  35.07 
 
 
684 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2618  GUN4-like  30.14 
 
 
623 aa  83.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.0000189308  normal  0.347807 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2617  GUN4-like  36.73 
 
 
600 aa  80.9  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000986346  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0174  GUN4-like  38.52 
 
 
552 aa  81.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.646851 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1723  serine/threonine protein kinase  35.61 
 
 
494 aa  80.5  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.973997  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2446  GUN4 domain protein  27.44 
 
 
250 aa  78.6  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.786071  hitchhiker  0.0000000955131 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2743  GUN4 domain protein  32.87 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15980  predicted protein  39.64 
 
 
119 aa  77  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1722  serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 
505 aa  77  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0710398  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4973  GUN4-like  35.04 
 
 
338 aa  76.3  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  32.26 
 
 
888 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2272  GUN4 domain protein  34.23 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2323  GUN4 domain protein  34.23 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1623  GUN4-like  33.08 
 
 
562 aa  69.3  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.484626  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1918  GUN4-like  33.33 
 
 
135 aa  67.8  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.505634  normal  0.0848104 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0701  GUN4 domain protein  31.11 
 
 
165 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2959  GUN4 domain protein  26.97 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.165841 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3159  GUN4 domain protein  26.97 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  32 
 
 
818 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0730  GUN4 domain protein  31.11 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.384858  normal  0.0865709 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5109  GUN4 domain protein  29.6 
 
 
441 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2988  GUN4 domain protein  31.2 
 
 
240 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4854  GUN4 domain protein  34.38 
 
 
202 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  32 
 
 
887 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4843  GUN4 domain protein  33.86 
 
 
191 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.977893 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4076  GUN4 domain protein  31.01 
 
 
194 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4115  GUN4 domain protein  31.01 
 
 
194 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.657757  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4106  GUN4-like protein  27.66 
 
 
215 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3350  GUN4-like  31.39 
 
 
979 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3482  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.08 
 
 
490 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268767 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5443  GUN4 domain protein  29.79 
 
 
526 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>