More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1842 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3904  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  74.88 
 
 
422 aa  672    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1842  transposase IS605  100 
 
 
422 aa  879    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.119511 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4459  transposase, IS605 OrfB family  49.62 
 
 
398 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3144  transposase, IS605 OrfB family  49.24 
 
 
398 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.545249 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4215  transposase, IS605 OrfB family  48.23 
 
 
405 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4578  IS891/IS1136/IS1341 transposase  47.95 
 
 
407 aa  363  4e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3974  transposase, IS605 OrfB family  47.17 
 
 
405 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.766899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1224  transposase, IS605 OrfB family  51.2 
 
 
425 aa  349  5e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3994  transposase, IS605 OrfB family  49.49 
 
 
396 aa  342  5e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.437884  normal  0.653956 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2909  transposase, IS605 OrfB family  49.49 
 
 
396 aa  342  5e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0546  transposase, IS605 OrfB family  49.47 
 
 
406 aa  338  8e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3945  transposase, IS605 OrfB family  50.27 
 
 
413 aa  336  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1635  IS891/IS1136/IS1341 transposase  48 
 
 
403 aa  333  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2185  transposase, IS605 OrfB family  44.42 
 
 
401 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2247  transposase, IS605 OrfB family  44.42 
 
 
401 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal  0.427793 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4125  transposase  53.54 
 
 
264 aa  247  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0035841 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0055  transposase IS605 OrfB  50.66 
 
 
303 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0899  transposase, IS605 OrfB family  32.46 
 
 
363 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000841843  hitchhiker  0.0000000725079 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3802  transposase, IS605 OrfB family  35.78 
 
 
363 aa  179  7e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3850  transposase, IS605 OrfB family  35.78 
 
 
363 aa  179  9e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104951  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3554  transposase, IS605 OrfB family  35.78 
 
 
363 aa  179  9e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1464  transposase, IS605 OrfB family  35.78 
 
 
363 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0417  transposase, IS605 OrfB family  35.46 
 
 
363 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.413645  normal  0.0217582 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0457  transposase, IS605 OrfB family  35.78 
 
 
363 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.196449 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2754  transposase, IS605 OrfB family  35.78 
 
 
363 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3814  transposase, IS605 OrfB family  31.41 
 
 
363 aa  176  7e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000135622  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0739  transposase, IS605 OrfB family  35.04 
 
 
380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3187  transposase, IS605 OrfB family  35.42 
 
 
380 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.742933 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2689  transposase, IS605 OrfB family  35.14 
 
 
363 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2181  transposase, IS605 OrfB family  34.33 
 
 
380 aa  169  8e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.538688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1199  transposase, IS605 OrfB family  34.59 
 
 
380 aa  169  9e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000673457  hitchhiker  0.00797435 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2549  transposase, IS605 OrfB family  33.69 
 
 
370 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.735833  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2012  transposase, IS605 OrfB family  33.05 
 
 
362 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.27721  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3651  IS605 family transposase OrfB  34.15 
 
 
380 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166379  normal  0.432603 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1755  transposase, IS605 OrfB family  34.23 
 
 
371 aa  161  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2213  transposase IS605 OrfB family  32.61 
 
 
376 aa  160  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0289  transposase, IS605 OrfB family  33.6 
 
 
380 aa  159  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0155  transposase, IS605 OrfB family  34.6 
 
 
466 aa  159  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565863  normal  0.100643 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1517  transposase, IS605 OrfB family  34.77 
 
 
371 aa  158  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1513  IS605 family transposase OrfB  31.89 
 
 
405 aa  157  4e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0963227  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0388  IS891/IS1136/IS1341 transposase  30.71 
 
 
373 aa  155  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2076  IS605 family transposase OrfB  32.06 
 
 
380 aa  155  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1565  ISCpe2, transposase orfB  35.16 
 
 
384 aa  154  4e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0245  ISCpe2, transposase orfB  34.84 
 
 
384 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0472  ISCpe2, transposase orfB  34.19 
 
 
384 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0772  ISCpe2, transposase orfB  34.84 
 
 
383 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1583  ISCpe2, transposase orfB  34.84 
 
 
384 aa  151  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0166589  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0626  ISCpe2, transposase orfB  34.52 
 
 
384 aa  150  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.202409  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3155  transposase, IS605 OrfB family  33.33 
 
 
338 aa  149  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0126  ISCpe2, transposase orfB  34.84 
 
 
384 aa  149  8e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3489  transposase, IS605 OrfB family  36.84 
 
 
409 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0547  ISCpe2, transposase orfB  34.52 
 
 
384 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0723  ISCpe2, transposase orfB  34.52 
 
 
384 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1031  ISCpe2, transposase orfB  33.98 
 
 
384 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0491139  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0989  ISCpe2, transposase orfB  34.52 
 
 
384 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0122  transposase  35.92 
 
 
402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0294  IS605 family transposase OrfB  27.69 
 
 
424 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.414871  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2479  transposase, IS605 OrfB family  31.64 
 
 
388 aa  146  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0679  ISCpe2, transposase orfB  33.87 
 
 
384 aa  147  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1049  ISCpe2, transposase orfB  34.19 
 
 
384 aa  147  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00154487  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1117  IS605 family transposase OrfB  29.21 
 
 
395 aa  146  5e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.148504  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.02 
 
 
361 aa  146  6e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3012  transposase, IS605 OrfB family  31.79 
 
 
395 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0711  ISCpe2, transposase orfB  33.87 
 
 
384 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.489014  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0889  ISCpe2, transposase orfB  33.87 
 
 
384 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688854  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0168  ISCpe2, transposase orfB  34.19 
 
 
384 aa  143  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1677  putative transposase IS605 family  31.36 
 
 
449 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  30.05 
 
 
383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  30.11 
 
 
405 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2515  transposase, IS605 OrfB family  31.03 
 
 
326 aa  140  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  29.72 
 
 
381 aa  140  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  29.97 
 
 
373 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0459  IS605 family transposase OrfB  27.46 
 
 
401 aa  138  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  29.47 
 
 
370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  30.47 
 
 
403 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  30.47 
 
 
403 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  30.47 
 
 
403 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  30.47 
 
 
403 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  30.54 
 
 
373 aa  136  8e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  28.61 
 
 
373 aa  136  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  29.29 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  29.64 
 
 
373 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  29.64 
 
 
373 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1623  IS605 family transposase OrfB  29.9 
 
 
377 aa  135  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.139017  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3430  transposase  29.78 
 
 
442 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  29.65 
 
 
404 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  29.64 
 
 
373 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  29.94 
 
 
373 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  30.56 
 
 
404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  29.36 
 
 
373 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3089  transposase, IS605 OrfB family  32.22 
 
 
406 aa  134  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.154586 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0073  IS605 family transposase OrfB  32.12 
 
 
418 aa  133  5e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  30.24 
 
 
372 aa  133  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  29.92 
 
 
403 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  29.94 
 
 
372 aa  132  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  29.64 
 
 
372 aa  132  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2314  transposase, IS605 OrfB family  28.44 
 
 
419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  29.94 
 
 
372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2736  transposase, IS605 OrfB family  28.75 
 
 
391 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.312474 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  31.47 
 
 
381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>